Fago temperado inducible y especie típica del género Fago lamba-semejante, en la familia SIPHOVIRIDAE. Su hospedero natural es la E. coli K12. Su virión contiene un ADN lineal de dóble hebra, excepto por 12 bases complementarias en el extemo 5-terminal de las cadenas de polinucleótidos. El ADN se torna circular durante la infección.
Virus cuyos huéspedes son células bacterianas.
Virus cuyo hospedero es la Escherichia coli.
Fenómeno por el cual un fago temperado se incorpora al ADN de la bacteria huesped, estableciéndose un tipo de relación simbiótica entre el profago (PROFAGOS) y la bacteria, de modo que se da una perpetuación del profago en todos los decendientes de la bacteria. Hasta que la inducción (ACTIVACIÓN VIRAL) por varios agentes, como la radiación ultravioleta, libera al fago, que entonces se convierte en virulento y lisa la bacteria.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de los virus.
Bacteriófago virulento y especie típica del género fago semejante a T4, de la familia MYOVIRIDAE. Infecta a la E. coli y es el fago mejor conocido del par T. Su virión contiene ADN de doble hebra, con terminación redundante y permutado circularmente.
Proteínas que se encuentran en cualquier especie de virus.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Virus cuyo ácido nucleico es el ADN.
Bacteriófago virulento y especie típica del género Fago T7-Semejante, en la familia PODOVIRIDAE, que infecta a la E. coli. Está constituido por ADN de doble hebra, terminalmente redundante, y no permutada.
EUNidades hereditarias funcionales de los VIRUS:.
Serie de 7 fagos virulentos que infectan a la E. coli. Los fagos T-pares T2, T4 (BACTERIÓFAGO T4), y T6, y los fagos T5 se llaman "autónomamente virulentos" debido a que producen cese del metabolismo bacteriano durante la infección. Los fagos T1, T3 (BACTERIÓFAGO T3), y T7 (BACTERIÓFAGO T7) se les llama "virulento dependientes" debido a que dependen de la continuación del metabolismo bacteriano durante el ciclo lítico. Los fagos T-pares contienen 5-hidroximetilcitosina en lugar de la citosina ordinaria en su ADN.
Una amplia categoría de proteínas virales que juegan roles indirectos en los procesos biológicos y actividades de los virus. Se incluyen aquí proteínas que regulan la expresión de genes virales o están implicadas en modificar las funciones de la célula huesped. Muchas de las proteínas en esta categoría realizan múltiples funciones.
Producción de nuevos ordenamientos del ADN por varios mecanismos tales como variación y segregación, INTERCAMBIO GENÉTICO, CONVERSIÓN GÉNICA, TRANSFORMACIÓN GENÉTICA, CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA o infección mixta por virus.
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Un Colifago (género de virus similares al mu, família MYOVIRIDAE) templado, compuesto por una molécula lineal de ADN de doble hebra, capaz de insertarse al azar en cualquier punto del cromosoma hospedero. Frecuentemente causa mutación, al interrumpir la continuidad del OPERÓN bacteriano en el sitio de inserción.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Determinados loci de las moléculas de ADN tanto bacterianas (attB) como del fago (attP), que forman los sitios en los que se da la recombianción entre ellos y el ADN del fago se integra con el ADN BACTERIANO, durante la LISOGENIA.
Una categoría de secuencias de ácidos nucleicos que funciona como unidades de la herencia y que codifican las instrucciones básicas para el desarrollo, reproducción y mantenimiento de los organismos.
Enzimas que forman parte de los sistemas de restricción-modificación. Catalizan la segmentación endonucleolítica de secuencias de ADN que no poseen el patrón de metilación de la especie en el ADN de la célula hospedera. La segmentación produce fragmentos aleatorios, o específicos de doble cadena, con 5'-fosfatos terminales. La función de las enzimas de restricción es destruir cualquier ADN extraño que invada la célula hospedera. La mayoría ha sido estudiada en sistemas bacterianos, pero algunas han sido encontradas en organismos eucarióticos.También se han usado como herramientas en la disección sistemática y en el mapeo de los cromosomas, en la determinación de la secuencia de bases de ADNs y han hecho posible cortar y recombinar genes de un organismo al genoma de otro. EC 3.21.1.
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Bacteriófago virulento y miembro único del género Cystovirus que infecta a las especies de Pseudomonas. El virión tiene un genoma segmentado constituido por tres fragmentos de ADN de doble hebra y que contiene también una membrana única con lípidos.
Ruptura de las células bacterianas debido a una fuerza mecánica, acción química o el crecimiento lítico de BACTERIÓFAGOS.
Especie típica del género MICROVIRUS. Prototipo de los pequeños colifagos virulentos de ADN, compuesto por un ADN de una hebra o circular superenrrollado que durante la infección se convierte en formas replicadas de doble hebra por una enzima del hospedero.
Los procesos mediante los cuales las dos cadenas de la doble hélice del ADN se separan, permitiendo que cada cadena actúe como plantilla para la síntesis de una cadena complementaria mediante el pareamiento de bases específicas. Comprende la replicación autónoma pero no la REPLICACION VIRAL.
Recombinasas que insertan ADN exógeno en el genoma huesped. Algunos ejemplos son las proteinas codificadas por los GENES POL de los RETROVIRIDAE y también por los BACTERIÓFAGOS temperados, de los que el más conocido es el BACTERIÓFAGO LAMBDA.
Proteínas que se encuentran en las secciones de la cola de los virus ADN y ARN. Se cree que estas proteínas desempeñan un importante rol en la dirección del doblez de la cadena y en la conformación de las cadenas polipeptídicas.
Especie indeterminada de bacteriófagos temperados de la familia MYOVIRIDAE que infecta a la E. coli. Constituido por un ADN de doble hebra con extremidades adhesivas de 19 bases.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Enzimas que catalizan la extensión dirigida por el molde de ADN, del terminal 3' de una cadena de ARN, un nucleótido cada vez. Pueden iniciar una cadena de nuevo. En eucariotes, se han distinguido tres formas de la enzima en base a la sensibilidad a la alfa-amanitina y al tipo de ARN sintetizado. (Adaptación del original: Enzyme Nomenclature, 1992).
ADN biológicamente activo que se ha formado por la unión in vitro de segmentos de ADN de diferentes orígenes. Incluye la recombinación de una unión o del borde de una zona heteroduplex donde se unen las dos moléculas de ADN recombinados.
Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.
Bacteriófago temperado del género INOVIRUS que infecta a las enterobacterias, especialmente a la E. coli. Es un fago filamentoso constituido por una hebra de ADN y que es permutada circularmente.
En las bacterias, grupo de genes metabólicamente relacionados, con un promotor común, cuya transcripción a un ARN MENSAJERO policistrónico único está bajo control de una región OPERADORA.
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Enzimas que catalizan la incorporación de desoxirribonucleótidos a una cadena de ADN. EC 2.7.7. -.
Bacteriófago del género Fago T7-Semejante, de la familia PODOVIRIDAE, que está íntimamente relacionado al BACTERIÓFAGO T7.
Biosíntesis del ARN dirigida por un patrón de ADN. La biosíntesis del ADN a partir del modelo de ARN se llama TRANSCRIPCIÓN REVERSA.
Cualquier método empleado para determinar la localización y distancias relativas entre los genes en un cromosoma.
Transferencia de ADN bacteriano mediante fagos desde una bacteria infectada a otra bacteria. También se refiere a la transferencia de genes al interior de células eucariotas mediante virus. Este proceso que se da de forma natural es utilizado de forma rutinaria como TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Uno de los tipos de subunidades de cadena ligera de las inmunoglobulinas, con un peso molecular aproximado de 22 kDa.
Especie indeterminada de bacteriófago temperado de la familia MYOVIRIDAE que infecta a la E. coli. Es el mayor de los colifagos y está constituido por un ADN de dos hebras, terminalmente redundante y permutado circularmente.
Técnica para tipificación bacteriana capaz de diferenciar las bacterias o las cepas de bacterias por su susceptibilidad a uno o más bacteriófagos.
Proteinas bacterianas utilizadas por BACTERIÓFAGOS para incorporar su ADN dentro del ADN de la bacteria "huesped". Hay proteinas unidas al ADN que actúan en recombinación genética así como en la regulación de la transcripción y la trazducción.
Grupo de enzimas que catalizan la segmentación endonucleolítica del ADN. Incluyen miembros de EC 3.1.21.-, EC 3.1.22.-, EC 3.1.23.- (ENZIMAS DE RESTRICCION DEL ADN), EC 3.1.24. (ENZIMAS DE RESTRICCION DEL ADN). y EC 3.1.25.-.
Virus cuyo hospedero es la Salmonella. Un fago de Salmonella encontrado frecuentemente es el BACTERIÓFAGO P22.
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Genomas de BACTERIÓFAGOS templados integrados en el ADN de las células del huésped bacteriano. Los profagos pueden duplicarse a lo largo de muchas generaciones celulares, hasta que algún estímulo induce su activación y virulencia.
Familia de bacteriófagos que se caracterizan por poseer colas largas y no contráctiles.
Enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces éster dentro del ADN. EC 3.1.-.
Plegamiento de la molécula de ADN de un organismo en una estructura compacta, ordenada que se ajuste dentro del espacio limitado de una CÉLULA o VIRIÓN.
Genes que regulan o circunscriben la actividad de otros genes, específicamente genes que codifican para PROTEINAS o ARNs, que tienen funciones de REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA.
Proceso de multiplicación viral intracelular, que consiste en la síntesis de PROTEÍNAS, ÁCIDOS NUCLEICOS, y a veces LÍPIDOS y su ensamblaje para formar una nueva partícula infecciosa.
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
Ordenamiento espacial de los átomos de un ácido nucleico o polinicleótido que produce su forma tridimensional característica.
Bacteriófagos cuyo material genético es el ARN, que tiene una sola hebra en toda su extensión excepto en el fago de Pseudomonas Phi 6. Todos los fagos de ARN infectan a sus bacterias hospedero a través de los pili de la superficie de los hospederos. Algunos fagos de ARN encontrados frecuentemente son: BF23, F2, R17, fr, PhiCb5, PhiCb12r, PhiCb8r, PhiCb23r, 7s, PP7, Q BETA PHAGE, MS2 PHAGE, y PHAGE PHI 6.
Método para medir infectividad viral y multiplicación de CÉLULAS CULTIVADAS. Las zonas lisadas o placas limpias se desarrollan en las PARTÍCULAS VIRALES que son liberadas de las células infectadas durante la incubación. Con algunos VIRUS, las células mueren a manos de un efecto citopático, con los demás, las células infectadas no son muertas, pero pueden ser detectadas por su capacidad para la hemadsorción. A veces las células de la placa contienen ANTÍGENOS VIRALES s que pueden ser medidos por INMUNOFLUORESCENCIA.
Bacteriófago y especie tipo del género Tectivirus, familia TECTIVIRIDAE. Son específicos de bacterias gramnegativas.
Estructuras dentro del núcleo de las células de bacterias que consisten en o contienen ADN el cual porta la información genética esencial de la célula.
Técnica, ampliamente usada, que aprovecha la capacidad de las secuencias complementarias en cadenas únicas de ADN y ARN de emparejarse unas con otras para formar una hélice doble. La hibridación puede darse entre dos secuencias complementarias de ADN, entre un ADN con cadena única y un ARN complementario o entre dos secuencias de ARN. La técnica es usada para detectar y aislar secuencias específicas, medir la homología o definir otras características de una o dos cadenas (Adaptación del original: Kendrew, Encyclopedia of Molecular Biology, 1994, p503).
Virus cuyo hospedero es la Pseudomona. Un fago de Pseudomona encontrado frecuentemente es el BACTERIÓFAGO PHI 6.
Uso de endonucleasas de restricción para analizar y generar un mapa físico de los genomas, genes u otros segmentos del ADN.
Complemento genético completo contenido en una molécula de ADN o de ARN en un virus.
Virus cuyo hospedero es el Staphylococcus.
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
La adhesión de los gases, líquidos o sólidos disueltos sobre una superficie. Incluye fenómenos de adsorción de bacterias y virus sobre las superficies también. La ABSORCIÓN en la sustancia puede seguir, pero no necesariamente.
Virus cuyo hospedero es un Bacillus. Los fagos bacilares frecuentemente se encuentran en los bacteriófagos phi 29 y bacteriófago phi 105.
Familia de bacteriófagos que se caracterizan por poseer colas cortas no contráctiles.
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
Separación de partículas según la densidad, mediante el empleo de un gradiente de diversas densidades. En equilibrio cada partícula se sitúa en el gradiente equivalente a su densidad.
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Subdisciplina de la genética que se ocupa de los mecanismos y procesos genéticos en los microorganismos.
Virus cuyo hospedero es el Streptococcus.
Una prueba que se usa para determinar si tendrá lugar o no la complementación (compensación en forma de dominancia) en una célula con un fenotipo mutante dado cuando otro genoma mutante, que codifica el mismo fenotipo mutante, se introduce en dicha célula.
Elementos reguladores de un OPERÓN a los que se unen los activadores o represores para efectuar la transcripción de GENES en el operón.
Proceso de mutación que restaura el FENOTIPO salvaje en un organismo que posee un GENOTIPO alterado por mutación. La segunda mutación "supresora" puede darse en un gen diferente, en el mismo gen pero localizada a distancia del sitio de la mutación primaria, o en genes extracromosómicos (HERENCIA EXTRACROMOSÓMICA).
Cadena única de desoxirribonucleótidos que se encuentra en algunas bacterias y virus. Usualmente existe como un círculo covalentemente cerrado.
Enzimas que catalizan la liberación de mononucleótidos mediante la hidrólisis del enlace terminal de cadenas de desoxirribonucleótidos o ribonucleótidos.
Proteína a la que afecta la terminación de la síntesis del ARN durante el proceso de transcripción genética a través de la disociación del complejo ternario de transcripción ARN-POLIMERASA ADN-DEPENDIENTES de la terminación del gen.
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Microscopía usando un haz de electrones, en lugar de luz, para visualizar la muestra, permitiendo de ese modo mucha mas ampliación. Las interacciones de los ELECTRONES con los materiales son usadas para proporcionar información acerca de la estructura fina del material. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN las reacciones de los electrones transmitidos a través del material forman una imagen. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE RASTREO un haz de electrones incide en un ángulo no normal sobre el material y la imagen es producida a partir de las reacciones que se dan sobre el plano del material.
La suma del peso de todos los átomos en una molécula.
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
Cualquiera de las moléculas de ADN covalentemente cerradas que se encuentran en bacterias, muchos virus, mitocondrias, plástidos, y plásmidos. También se han observado ADNs pequeños, circulares y polidispersos en un número de organismos eucarióticos y se ha sugerido que tienen homología con el ADN cromosómico y en la capacidad de insertarse en él, y escindirse del ADN cromosómico. Es un fragmento de ADN formado por un proceso de formación y de deleción de un asa , que contiene una región constante de la cadena pesada mu y la parte 3 de la región de cambio mu. El ADN circular es un producto normal de la reordenación entre los segmentos del gen que codifica las regiones variables de las cadenas ligeras y pesadas de las inmunoglobulinas, así como de los receptores de las células T.
Enzimas que catalizan la hidrólisis de los enlaces internos y por lo tanto la formación de polinucleótidos u oligonucleótidos de las cadenas ribo-desoxirribonucleótidos. CE 3.1. -.
Proteínas que se unen al ADN. La familia incluye proteínas que se unen tanto al ADN de una o de dos cadenas y que incluyen también a proteínas que se unen específicamente al ADN en el suero las que pueden utilizarse como marcadores de enfermedades malignas.
Género de bacteriófagos de la familia LEVIVIRIDAE, cuya infectividad es resistente a las radiaciones UV (ultravioletas).
Secuencias de ADN reconocidas como señales para finalizar la TRANSCRIPCION GENÉTICA.
Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en los virus.
Familia de recombinasas identificadas inicialmente en las BACTERIAS. Catalizan el intercambio de cadenas del ADN conducido por el ATP en la RECOMBINACIÓN GENÉTICA. El producto de la reacción consiste en un duplex y un asa de cadena simple desplazada, que tiene la forma de la letra D, razón por la que se denomina como una estructura en asa D.
La parte del espectro electromagnético que está inmediatamente debajo del rango visible y se extiende hasta las frecuencias de rayos x. Las longitudes de ondas más largas (rayos cercanos a UV, o bióticos, o vitales) son necesarias para la síntesis endógena de la vitamina D y también son conocidos como rayos antirraquíticos; las longitudes de onda más cortas, ionizantes, (rayos lejanos de UV, o abióticos, o extravitales) son viricidas, bactericidas, mutagénicos y carcinogénicos y se emplean como desinfectantes.
Catalizan la unión de ribonucleótidos o desoxirribonucleótidos preformados, en la conexión fosfodiéster, durante los procesos genéticos. EC 6.5.1.
ADN duplex circular aislado a partir de los virus, bacterias y mitocondrias en forma superenrrollada o superdoblado. Este ADN superhelicoidal es rico en energía libre. Durante la transcripción, la magnitud de la iniciación es proporcional a la superhelicoidalidad del ADN.
Ácido ribonucleico que constituye el material genético de los virus.
Componentes moleculares específicos de las células que son capaces de reconocer e interactuar con un virus, y que, luego de unirse a él, son capaces de generar alguna señal que inicia la cadena de eventos que genera la respuesta biológica.
Secuencias de ADN que son reconocidas (directa o indirectamente) y enlazadas por una ARN polimerasa dependiente de ADN durante la iniciación de la transcripción. Entre las secuencias altamente conservadas dentro del promotor están la caja de Pribnow en las bacterias y la TATA BOX en los eucariotes.
Cápsula externa de proteínas que protege a un virus, ella protege al ácido nucleico viral. Ella puede tener simetría helicoidal o icosaédrica y está compuesta por unidades estructurales o capsómeros. Conforme al número de subunidades que tienen los capsómeros, se les llama dímeros (2), trímeros (3), pentámeros (5) o hexámeros (6).
Moldes macromoleculares para la síntesis de macromoléculas complementarias, como ocurre en la REPLICACIÓN DEL ADN, TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de ADN a ARN y la TRADUCCIÓN GENÉTICA de ARN a POLIPÉPTIDOS.
Electroforesis en la que se emplea un gel de poliacrilamida como medio de difusión.
Un antibiótico que fue por primera vez aislado de cultivos de Streptomyces venequelae in 1947 pero que es producido sintéticamente en la actualidad. Tiene una estructura relativamente simple y fue el primer antibiótico de amplio espectro que fue descubierto. Actúa interfiriendo con la síntesis bacteriana de proteínas y es principalmente un bacteriostático.
Moléculas de ácido nucleico de doble cadena (ADN-ADN o ADN-ARN) que contienen regiones mal pareadas de nucleótidos (no-complementarios). In vivo, estos heterodúplex pueden producirse por mutación o recombinación genética; in vitro, se forman por la hibridización de ácidos nucleicos. El análisis por microscopía electrónica de los heterodúplex resultantes facilita el mapeo de regiones de secuencias de bases homólogas de ácidos nucleicos.
Especie de bacteria grampositiva que es un saprofito común en el suelo y el agua.
Correspondencia secuencial de nucleótidos en una molécula de ácido nucleico con los de otra molécula de ácido nucleico. La homología de secuencia es una indicación de la relación genética de organismos diferentes y la función del gen.
Segmentos discretos de ADN que pueden escindirse y reintegrarse a otro sitio del genoma. La mayoría son inactivos, es decir, no se han encontrado fuera del estado integrado. Los elementos transportables de ADN incluyen los elementos SI bacterianos (secuencias de inserción), los elementos Tn, los elementos controladores del maíz Ac y Ds, Drosophila P, elementos gitanos y pogo, los elementos humanos Tigger y los elementos Tc y marinos que se encuentran en todo el reino animal.
Desorganización de la estructura secundaria de los ácidos nucleicos mediante ruptura de las uniones de hidrógeno e hidrofóbicas. El ADN desnaturalizado aparece como una estructura flexible de simple cadena. Los efectos de la desnaturalización sobre el ARN son similares aunque menos pronunciados y en gran medida reversibles.
Proteínas que constituyen la CÁPSIDE de VIRUS.
Tritio es un isótopo radioactivo del hidrógeno (con símbolo químico ³H), que emite radiación beta de baja energía y tiene aplicaciones en investigación científica y biomédica, así como en la datación por carbono.
Acepción aplicada a la SECUENCIA DE BASES con respecto a cómo es transformada en SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS. El inicio, parada y orden de los aminoácidos de una proteína se especifica por tripletes consecutivos de nucleótidos denominados codones (CODON).
Género de bacteriófagos filamentosos de la familia INOVIRIDAE. Los organismos de este género infectan a las enterobacterias, PSEUDOMONAS, VIBRIO y XANTHOMONAS.
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
La timina es una nucleobase pirimidínica que forma parte de los nucleótidos que constituyen el ADN, donde se empareja específicamente con la adenina mediante dos enlaces de hidrógeno.
Moléculas de ADN capaces de replicarse de forma autónoma dentro de una célula huésped y dentro de la cual pueden insertarse otras secuencias de ADN y de esta manera amplificarse. Muchas se derivan de PLÁSMIDOS, BACTERIÓFAGOS o VIRUS. Se usan para transportar genes foráneos a las células receptoras. Los vectores genéticos poseen un sitio replicador funcional y contienen MARCADORES GENÉTICOS para facilitar su reconocimiento selectivo.
Electroforesis en que se emplea un gel de agar o agarosa como medio de difusión.
Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.
Una exodesoxirribonucleasa ATP dependiente que cliva en cualquier dirección, el 5'- a 3'- o el 3'- a 5' para dejar 5'-fosfooligonucleótidos. Se encuentra primariamente en la BACTERIA.
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Ensamblaje de las PROTEÍNAS ESTRUCTURALES VIRALES y el ácido nucleico (ADN VIRAL o ARN VIRAL) para formar un VIRION.
Proteínas que catalizan la reversión del dúplex de ADN durante la replicación mediante la unión cooperativa para las regiones de cadena simple de ADN o para las regiones cortas de ADN dúplex que están experimentando apertura transitoria. Además las helicasas ADN son ATPasas dependientes de ADN que aprovechan la energía libre de la hidrólisis de ATP para trasladar los filamentos de ADN.
Proteínas virales que componen las PARTÍCULAS DE VIRUS maduras ensambladas. Pueden incluir proteinas nucleares de nucleocápside (proteinas gag), enzimas empaquetadas dentro de la partícula viral (proteinas pol)y componentes de membrana (proteinas env). No incluye las proteinas codificadas en el GENOMA VIRAL, que se producen en células infectadas pero que no se empaquetan en la particula viral madura, es decir, las llamadas proteinas no estructurales (PROTEINAS NO ESTRUCTURALES VIRALES).
Polinucleótidos son largas cadenas de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiéster, que constituyen la estructura básica de ácidos nucleicos como el ADN y ARN.
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Especie indeterminada de bacteriófago temperado de la familia PODOVIRIDAE que infecta a las especies de Salmonella. El genoma está compuesto por ADN de doble hebra, terminalmente redundante y permutado circularmente.
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis del ATP. La reacción de hidrólisis usualmente es acoplada con otra función, tal como transportar Ca(2+) a través de la membana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca(2+), Mg(2+), aniones, H+, o ADN.
Transmisión vertical de carácteres hereditarios por el ADN de organelos citoplasmáticos, como la MITOCONDRIAS, CLOROPLASTOS y PLASTIDIOS o de PLÁSMIDOS o ADN episomal viral.
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Fenómeno en el cual la infección por un primer virus produce resistencia en las células o tejidos a la infección por un segundo virus.
Crianza deliberada de dos individuos diferentes que se traduce en descendencia que lleva parte del material genético de cada progenitor. Los organismos progenitores deben ser compatibles genéticamente y pueden ser de diferentes variedades o especies estrechamente relacionadas.
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de los procesos o fenómenos genéticos. Incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otro equipamiento electrónico.
Una amplia categoría de enzimas que están involucradas en el proceso de RECOMBINACION GENETICA.
Mecanismo por el que los virus latentes, como los virus tumorales transmitidos genéticamente (PROVIRUS) o los PROFAGOS de las bacterias lisogénicas, son inducidos a su replicación y liberados como virus infecciosos. Puede ser consecuencia de varios estímulos endógenos y exógenos, incluyendo LIPOPOLISACÁRIDOS de células B, hormonas glucocorticoides, pirimidinas halogenadas, RADIACIÓN IONIZANTE, luz ultravioleta y virus superinfectantes.
Cadenas de polipéptidos constituídas por 211 a 217 residuos de aminoácidos, que tienen un peso molecular aproximado de 22 kD. Hay dos tipos principales de cadenas ligeras, la kappa y la lambda. Dos cadenas ligeras Ig y dos cadenas pesadas Ig (CADENAS PESADAS DE INMUNOGLOBULINA)forman una molécula de inmunoglobulina.
Un método (desarrollado originalmente por E.M.Southern) para la detección del ADN que ha sido separado electroforéticamente e inmovilizado mediante secado en papel de nitrocelulosa o de otro tipo o en membrana de nylon.
Modificación dirigida del complemento genético de un organismo vivo por técnicas como las que alteran el ADN, sustituyen el material genético por mediación de un virus, trasplantan nucleos completos, trasplantan híbridos celulares, etc.
Moléculas de proteínas que se encontraron originalmente en la membrana externa de las BACTERIAS GRAMNEGATIVAS y que forman canales multiméricos para la DIFUSIÓN pasiva de AGUA; IONES; u otras moléculas pequeñas. Las porinas están presentes en las PAREDES CELULARES bacterianas, así como en la MEMBRANA CELULAR y las MEMBRANAS MITOCONDRIALES de plantas, hongos, mamíferos y otros vertebrados.
Un dextrodisacárido derivado de la malta y el almidón. Se usa como agente edulcorante y como intermediario fermentable en la industria cervecera.
Proteasas que contienen dominios núcleo proteolíticos y dominios reguladores que contienen ATPasa. Están generalmente comprimidos en grandes ensamblajes de multi-subunidades. Los dominios pueden ocurrir dentro de una sola cadena de péptidos o en distintas subunidades.
Proceso de generación de una MUTACIÓN genética. Puede darse espontáneamente o ser inducida por MUTÁGENOS.
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Cantidades relativas de PURINAS y PIRIMIDINAS en un ácido nucleico.
Atomos estables de fósforo que tienen el mismo número atómico que el elemento fósforo pero que difieren en peso atómico. P-131 es un isótopo estable de fósforo.
Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.
Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.
Familia de bacteriófagos que contiene un género (Cystovirus) con un miembro (BACTERIÓFAGI PHI 6).
Enzima que cataliza reversiblemente la formación de galactosa 1-fosfato y ADP a partir de ATP y D-galactosa. La galactosamina también puede actuar como aceptor. La deficiencia de esta enzima provoca la GALACTOSEMIA. EC 2.7.1.6.
Proteínas aisladas de la membrana externa de bacterias gramnegativas.
Polímero constituido por pocos nucleótidos (de 2 a 20). En genética molecular, secuencia pequeña sintetizada para igualar a una región donde se sabe que ocurre una mutación y luego usada como detector (SONDA DE OLIGONUCLEÓTIDO). (Dorland, 28a ed)
Inserción del ADN viral en el ADN de la célula huesped. Incluye la integración del ADN de fago en el ADN bacteriano (LISOGENIA) para formar un profago(PRÓFAGOS) o la integración del ADN retroviral con el ADN celular para formar un PROVIRUS.
Familia de enzimas que catalizan la segmentación exonucleolítica del ADN. Incluye miembros de la clase EC 3.1.11 que forman 5'-fosfomonoésteres como produtos de la segmentación.
Unidad genética formada por tres genes estructurales, un operador y un gen regulatorio. El gen regulatorio controla la síntesis de los tres genes estructurales: BETA-GALACTOSIDASA, permeasa de beta-galactósidos (involucrada con el metabolismo de la lactosa) y la beta-tiogalatósido acetiltransferasa.
Extracto celular fraccionado que mantiene una función biológica. Fracción subcelular aislada por ultracentrifugación u otro medio con el uso de técnicas de separación; primero debe estar aislado para que el proceso pueda estudiarse libre de todas las reacciones complejas que ocurren en una célula. El sistema libre de células, por tanto, se utiliza mucho en la biología celular.
Especie de fago filamentoso de Pseudomonas del género INOVIRUS, familia INOVIRIDAE.
Orden constituida por tres familias de bacteriófagos con cola: MYOVIRIDAE, PODOVIRIDAE, y SIPHOVIRIDAE.
Clase de plásmidos que transfieren la resistencia a antibióticos desde una bacteria a otra por conjugación.
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Proceso parasexual en las BACTERIAS, ALGAS, HONGOS y EUCARIOTAS ciliados para lograr el intercambio de material cromosómico durante la fusión de dos células. En las bacterias, es una transferencia unidireccional del material genético; en los protozoos es un intercambio bidireccional. En las algas y hongos, es una forma de reproducción sexual, con la unión de gametos masculinos y femeninos.
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
ADN polimerasas dependientes de ADN, que se encuentran en bacterias, animales y vegetales. Durante el proceso de replicación, estas enzimas catalizan la adición de residuos de desoxirribonucleótidos al extremo de una cadena de ADN en presencia de ADN como modelo-iniciador. También poseen actividad exonucleasa y por lo tanto funcionan en la reparación del ADN.
Mecanismo sensible al error o conjunto de funciones para la reparación de ADN microbiano dañado. Las funciones SOS (de la señal internacional de auxilio) intervienen en la reparación del ADN y en la mutagénesis, en la inhibición de la división celular, en la recuperación de las condiciones fisiológicas normales tras la reparación del ADN y, posiblemente en la muerte celular cuando el daño del ADN es grande.
Factores proteicos que sólo se requieren durante la fase de elongación de la síntesis de proteínas.
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de residuos terminales, no reductores de beta-D-galactosa en los beta-galactósidos. La deficiencia de beta-galactosidasa A1 puede causar la GANGLIOSIDOSIS GM1.
Cualquiera de los procesos por los cuales factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen en el control diferencial (inducción o represión), de la acción de genes a nivel de transcripción o traducción.
Proteínas recombinantes que se producen por TRADUCCIÓN GENÉTICA de genes de fusión formados por la combinación de SECUENCIAS REGULADORAS DEL ÁCIDO NUCLEICO de uno o mas genes con la proteina que codifica secuencias de uno o mas genes.
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Una colección de péptidos clonados, o químicamente sintetizados, frecuentemente constituídos por todas las combinaciones posibles de aminoácidos formando un péptido n-aminoácido.
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Compuestos y complejos moleculares consistentes en un gran número de átomos generalmente sobre 500 kD de tamaño. En los sistemas biológicos las substancias macromoleculares se pueden visualizar generalmente usando MICROSCOPIO ELECTRÓNICO y se distinguen de los ORGANELOS por la carencia de estructura membranosa.
Constitución genética del individuo, que comprende los ALELOS presentes en cada locus génico (SITIOS GENÉTICOS).
Uno de los tipos de cadenas ligeras de las inmunoglobulinas, con un peso molecular aproximado de 22 kDa.
Intercambio recíproco de segmentos que se encuentran en las correspondientes posiciones a lo largo de pares de CROMOSOMAS homólogos por rotura simétrica y nueva unión cruzada formando lugares de intercambio (ADN CRUCIFORME) que son determinados durante la SEGREGACIÓN CROMOSÓMICA. El intercambio se da normalmente durante la MEIOSIS pero también puede darse en ausencia de ésta, por ejemplo, en cromosomas bacterianos, cromosomas de organelas o cromosomas nucleares de células somáticas.
Pérdida real de una porción de un cromosoma.
ARN polimerasa de cadena simple, dependiente de ADN, que funciona para iniciar, o comenzar la síntesis de ADN, sintetizando un polímero de nucleótido de ARN. EC 2.7.7.-.
La reconstrucción de una molécula de ADN de doble cadena continua sin defectos a partir de una molécula contenida en regiones dañadas. Los principales mecanismos de reparación son la reparación por extirpación, en la que las regiones defectuosas en una cadena son extirpadas y resintetizadas usando la información complementaria de pareamento de las bases que está en la cadena intacta.
Proteínas conjugadas con ácidos nucleicos.
Modificación hereditaria de las propiedades de una bacteria competente por ADN desnudo procedente de otra fuente. La incorporación de ADN desnudo es un fenómeno que ocurre naturalmente en algunas bacterias. esto es usado frecuentemente en TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Técnicas usadas para separar mezclas de sustancias basadas en diferencias en las afinidades relativas de las sustancias para fases móviles y estacionarias. Una fase móvil (líquido o gas) pasa a través de una columna que contiene una fase estacionaria de líquido sólido poroso líquido revestido en un soporte sólido. El uso es tanto analítico para pequeñas cantidades y preparativo para cantidades a granel.
Microscopía electrónica en la que se produce una congelación rápida de las muestras. La imagen de las moléculas hidratadas-congeladas y de los organelos permite obtener la mejor resolución posible que semeja al estado vivo, libre de fijadores químicos o de colorantes.
Capacidad de los microorganismos, en especial las bacterias, de resistir o hacerse tolerantes a fármacos quimioterapéuticos, antimicrobianos o antibióticos. Esta resistencia puede ser adquirida a través de mutación génica o ADN extraño en plásmidos transmisibles (FACTORES R).
Las proteínas que se sintetizan en los organismos eucariotes y las bacterias en respuesta a la hipertermia y a otras tensiones ambientales. Ellos incrementan la tolerancia térmica y realizan funciones esenciales para la supervivencia celular bajo estas condiciones.
Grupo de desoxirribonucleótidos (hasta 12) en los que los residuos de fosfato de cada desoxirribonucleótido actúan como puentes en la formación de uniones diéster entre las moléculas de desoxirribosa.
Gran colección de fragmentos de ADN clonados (CLONACIÓN MOLECULAR)de un determinado organismo, tejido, órgano o tipo celular. Puede contener secuencias genómicas completas (BIBLIOTECA GENÓMICA) o secuencias complementarias de ADN, éstas formadas a partir de ARN mensajero y sin secuencias intrónicas.
Proceso de disociación de un compuesto químico por la adición de una molécula de agua.
Familia de galactósido hidrolasas que hidrolizan compuestos con un enlace O-galactosil.EC 3.2.1.-.
Un grupo de metilazirinopirroloindoledionas obtenidas de ciertas cepas de Streptomyces. Son antibióticos muy tóxicos utilizados como AGENTES ANTINEOPLASICOS en algunos tumores sólidos. La PORFIROMICINA y MITOMICINA son los miembros más útiles de este grupo.
Relación entre la estructura química de un compuesto y su actividad biológica o farmacológica. Los compuestos frecuentemente se clasifican juntos porque tienen características estructurales comunes, incluyendo forma, tamaño, arreglo estereoquímico y distribución de los grupos funcionales.
Secuencia de tripletes de nucleótidos sucesivos que son leidos como un CODÓN especificador de AMINOÁCIDOS y que comienza con un CODÓN INICIADOR y termina con un codón de parada (CODÓN TERMINADOR).
Tratamiento de enfermedades mediante materiales biológicos o modificadores de la respuesta biológica, como el uso de GENES, CÉLULAS, TEJIDOS, órganos, SUERO, VACUNAS y agentes humorales.
Tipo de cromatografía de intercambio iónico que emplea dietilaminoetil celulosa (DEAE-CELULOSA) como resina cargada positivamente.
Familia de proteínas de choque térmico que contienen una secuencia de consenso de 70 aminoácidos conocido como el dominio J. El dominio J de las proteínas de choque térmico HSP40 interactúa con PROTEÍNAS HSP70 DE CHOQUE TÉRMICO. Las proteínas HSP40 de choque térmico juegan un papel en la regulación de la actividad del ADENOSINA TRIFOSFATASAS de las proteínas HSP70 de choque térmico.
Propiedades de un agente patógeno que lo hace capaz de infectar a uno o más huéspedes específicos. El patógeno puede incluir PARÁSITOS, así como también VIRUS, BACTERIA, HONGOS o PLANTAS.
Conjunto de tres nucleótidos en una secuencia de codificación de proteínas que especifica los aminoácidos individuales o una señal de terminación (CODÓN DE TERMINACIÓN). La mayoría de los codones son universales, pero algunos organismos no producen los ARN DE TRANSFERENCIA complementarios para todos los codones. Estos codones se conocen como codones no asignados (CODÓN SIN SENTIDO).
Cualquier preparación líquida o sólida hecha específicamente para cultivo, almacenamiento o transporte de microorganismos u otros tipos de células. La variedad de los medios que existen permiten el cultivo de microorganismos y tipos de células específicos, como medios diferenciales, medios selectivos, medios de test y medios definidos. Los medios sólidos están constituidos por medios líquidos que han sido solidificados con un agente como el AGAR o la GELATINA.
Líquido rechazado o desechos arrastrados por las alcantarillas.
Genes cuya MUTACIÓN de pérdida de función o ganancia de función lleva a la muerte del portador antes de su madurez. Pueden ser GENES ESENCIALES necesarios para la viabilidad, o genes que causan un bloqueo de la función de un gen esencial en un momento cuando la función del gen esencial se requiere para la viabilidad.
Oligonucleótidos sintéticos o naturales utilizados en estudios de hibridización con el propósito de identificar y estudiar fragmentos específicos de ácidos nucleicos, ejemplo, segmentos de ADN cercanos o que están dentro de locus específicos del gen o de genes. La sonda hibridiza con un ARNm específico, si está presente. Las técnicas convencionales utilizadas para evaluar el producto de hibridización incluyen el ensayo de dot blot, ensayo de Southern blot, y las pruebas de anticuerpos específicos de híbridos de ADN:ARN. Las marcas convencionales para la sonda incluyen el marcaje con radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina.
Enzima que es capaz de hidrolizar el ADN altamente polimerizado quebrando los enlaces fosfodiéster, preferencialmente adyacentes a un nucleótido de pirimidina. Cataliza la segmentación endonucleolítica del ADN dando lugar a los productos finales 5'-fosfodi- y oligonucleótido. La enzima tiene preferencia por el ADN de cadena doble. EC 3.1.21.1 (anteriormente EC 3.1.4.5).