Proteínas que se hallan en cualquier especie arqueológica.

Ácido ribonucleico de la archaea que cumple funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.

Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de la archaea.

Unidades genéticas funcionales de la ARCHAEA.

Complemento genético de un organismo arqueal (ARCHAEA) como está representado en su ADN.

Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.

Virus cuyos huéspedes pertenecen al dominio de ARCHAEA.

Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción génica en el arquea.

Género de cocos ARCHAEA aeróbicos, quemolitotróficos cuyos organismos son termoacidofílicos. Sus células tienen forma muy irregular, a menudo lobuladas, pero ocasionalmente esféricas. Tienen una distribución mundial con organismos aislados de suelos calientes acídicos y del agua. El azufre se utiliza como fuente de energía.

Familia de METHANOBACTERIALES anaerobios, de forma variada desde cocos a bastoncillos. Las membranas celulares están compuestas principalmente por hidrocarburos poliisoprenoides que unen el eter al glicerol. Sus organismos se encuentran en hábitats anaerobios en la naturaleza.

Orden de metágenos anaerobios en el reino EURYARCHAEOTA. Tienen forma de pseudosarcina, cocoide o bastoncillos envueltos en vainas y catabolizan a grupos metilo. Las paredes celulares están compuestas de proteínas. El orden incluye una familia, METHANOCOCCACEAE.

Reino del dominio ARCHAEA que comprende organismos termoacidofílicos dependientes del azufre. Los dos órdenes son SULFOLOBALES y THERMOPROTEALES.

Estructuras que se encuentran dentro del núcleo de las células de Archaea que están constituidas por ADN o que contienen ADN, que contienen información genética esencial para la célula.

Género de METHANOCOCCACEAE cocoides cuyos organismos se mueven por medio de un penacho de flagelos polares. Estos metágenos se encuentran en pantanos salinos, sedimentos marinos y estuarios, y en el tracto gastrointestinal de animales.

especie de ARCHAEA termoácidofilica de la familia Sulfolobaceae, encontrada en áreas volcánicas donde la temperatura llega casi a los 80 grados C y hay presencia de SULFURO.

Especie de archaea halofílica que se encuentra en el Mar Muerto.

Especie de archaea estrictamente anaerobia, hipertermofílica que vive en sedimentos marinos geotérmicamente calientes. Muestra crecimiento heterotrófico por fermentación o por respiración sulfurosa.

Subunidad mayor del ribosoma 70S de archaea. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 23S, ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 40 diferentes PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS.

Una especie de ARCHAEA gramnegativa hipertermofílica, encontrada en salidas hidrotermales de océano profundo. Es un anaerobio obligatorio y obligatoriamente quimiorganotrófico.

Relaciones entre grupos de organismos en función de su composición genética.

Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.

Especie de archaea extremadamente termofílica y reductora de azufre. Crece a una temperatura máxima de 95 grados C. en áreas geotérmicas marinas o submarinas.

Género de METHANOSARCINALES anaerobios, de forma esférica irregular, cuyos organismos son inmóviles. No se forman endosporas. Estos archaea derivan su energía de la formación de metano a partir de acetato, metanol, mono-, di-, y trimetilamina, y posiblemente, monóxido de carbono. Los organismos son aislados a partir de agua dulce y de ambientes marinos.

Especie de ARCHEA quimiolitotrófica y aerobia constituida por células cocoides que utilizan al azufre como fuente de energía. La temperatura óptima para su crecimiento es de 70-75 grados C. Se aislan de campos acídicos.

Una especie de ARCHAEA anaeróbico hipertermofílico, aislado de muestras de fluído hidrotermal. Es obligatoriamente heterotrófico con células cocoides que requieren TRIPTOFANO para crecer.

Un género facultativamente anaerobio de cocoides ARCHAEA, en la familia SULFOLOBACEAE. Las células son altamente irregulares de forma y termoacidofílicas. El crecimiento litotrófico ocurre aeróbicamente por oxidación de azufre en algunas especies. La distribución incluye manantiales solfatáricos y campos, lodazales, y ambientes marinos ácidos geotérmicamente calientes.

El hidrocarburo saturado más simple. Es un gas inflamable, incoloro, ligeramente soluble en agua. Es uno de los principales constituyentes del gas natural y se forma en la descomposición de materia orgánica.

Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.

Reino de la ARCHAEA hipertermofílica que se encuentra en diversos ambientes.

Un filo de ARCHAEA que comprende por lo menos siete clases: Methanobacteria, Methanococci, Halobacteria (halófilos extremos), Archaeoglobi (especies reductoras de sulfato), Methanopyri, y las termofilas: Thermoplasmata e Thermococci.

Género de archaea estrictamente anaerobios ultratermofílica en la familia THERMOCOCCACEAE, que ocurren en aguas de mares calientes. Muestran crecimiento heterotrófico con una temperatura óptima de 100 grados C.

Constituyente de la subunidad 30S de los ribosomas procarióticos que contiene 1600 nucleótidos y 21 proteínas. El rARN 16S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.

El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.

Género de archaea heterotrófica facultativamente anaerobia del orden THERMOPLASMALES, aisladas de pilas de residuos de carbón para autocalentamiento y de fuentes de aguas calientes ácidas. Son termofílicas y pueden crecer tanto con como sin azufre.

Compuestos en los cuales uno o más de los tres grupos hidroxilos se encuentran unidos por un enlace éter a un alcohol alifático saturado o insaturado; uno o más de los grupos hidroxilos del glicerol pueden estar esterificados. Estos compuestos han sido encontrados en varios tejidos animales.

Familia de THERMOPROTEALES constituida por bacilos rígidos de longitud variable y sin septum. Crecen quemolitoautotróficamente o por respiración sulfurosa. Los cuatro géneros son: PYROBACULUM, THERMOPROTEUS, Caldivirga y Thermocladium (Adaptación del original: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2d ed).

Masa de material orgánico o inorgánico sólido fragmentado, o el propio fragmento sólido, que procede de la acción del intemperismo sobre las rocas y es transportada por, suspendida en o dejado caer por el aire, agua o hielo. Se refiere también a una masa que se acumula por cualquier otro agente natural y forma capas en la superficie terrestre, tales como arena, grava, limo, lodo, relleno o marga.

Género de METANOBACTERIAS anaerobias en forma de bastoncillos. Sus organismos son inmóviles y utilizan el amoniaco como única fuente de nitrógeno. Estos metanógenos se encuentran en sedimentos acuáticos, suelos, aguas residuales y en el tracto gastrointestinal de animales.

Orden de metanógenos anaerobios del reino EURYARCHAEOTA. Hay dos familias: METHANOSARCINACEAE y Methanosaetaceae.

Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.

Orden de metágenos anaerobios con formas variadas desde cocoide a bastoncillo, del reino EURYARCHAEOTA. Son inmóviles, no catabolizan los carbohidratos, material proteináceo o compuestos orgánicos que no sean formiato o monóxido de carbono, y están ampliamente distribuidos en la naturaleza.

Subunidad pequeña de los RIBOSOMAS arqueales. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 16S y de cerca de 28 diversas PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS.

El proceso de cambio acumulado en el nivel de ADN, ARN; y PROTEINAS, en generaciones sucesivas.

Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.

Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.

Familia de archaea, del orden DESULFUROCOCCALES, constituida por cocos anaerobios que utilizan facultativamente péptidos, proteínas o carbohidratos por respiración sulfurosa o fermentación. Hay ocho géneros: AEROPYRUM, Desulfurococcus, Ignicoccus, Staphylothermus, Stetteria, Sulfophoboccus, Thermodiscus y Thermosphaera (Adaptación del original: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2d ed).

Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.

Agua salinizada de OCÉANOS Y MARES que proporciona el hábitat a los organismos marinos.

Un proceso facilitado por bacterias especializadas que implican la oxidación de amonio a nitrito y nitrato.

Secuencias de ADN que codifican al ARN RIBOSÓMICO y los segmentos de ADN que separan a los genes individuales del ARN ribosomico, que se conocen como ADN ESPACIADOR RIBOSÓMICO.

Células de los organismos superiores que contienen un núcleo verdadero limitado por una membrana nuclear.

Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.

Familia de METHANOCOCCALES anaerobios cuyos organismos se mueven por medio de un flagelo. Estos metágenos usan dióxido de carbono como aceptor de electrones.

Orden de CRENARCHAEOTA que está constituido por cocos aeróbicos o facultativamente aeróbicos, quimolitotróficos que son termoacidófilos extremos. Carecen de peptidoglicanos en sus paredes celulares.

El estudio de la estructura del cristal empleando las técnicas de DIFRACCION POR RAYOS X.

Reino del dominio ARCHAEA, que comprende organismos termofílicos de fuentes de agua caliente que está entre las formas más primitivas de todas las formas vivas. Comparativamente han sufrido pocos cambios evolutivos desde el último ancestro común de toda la vida existente.

La variedad de todos los organismos vivientes nativos y sus variadas formas de interrelación. (MeSH, 2010) Contenido vivo de la Tierra en su conjunto, todo cuanto vive en los océanos, las montañas y los bosques. La encontramos en todos los niveles, desde la molécula de ADN hasta los ecosistemas y la biosfera. Todos los sistemas y entidades biológicos están interconectados y son interdependientes. La importancia de la biodiversidad estriba en que nos facilita servicios esenciales: protege y mantiene los suelos, regula el clima y hace posible la biosíntesis, proporcionándonos así el oxígeno que respiramos y la materia básica para nuestros alimentos, vestidos, medicamentos y viviendas (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)

Especie de Archaea halofílica que se encuentra en lagos salados. Algunas cepas forman una MEMBRANA PÚRPURA, en condiciones anaeróbicas.

Género de HALOBACTERIACEAE que se distingue de otros géneros de la familia por la presencia de derivados específicos de lípidos polares TGD-2. La Haloarcula se encuentra en ambientes salinos neutros como en los lagos salados, salinas marinas y suelos salinos.

Familia de METHANOSARCINALES anaerobios cuyas células son mesofílicas o termofílicas y se observan como cuerpos esféricos irregulares o bacilos encubiertos. Estos metágenos se encuentran en cualquier medio ambiente anaerobio incluidos los sedimentos acuáticos, digestores anaerobios de aguas de albañales y tracto gastrointestinal. Hay cuatro géneros: METHANOSARCINA, Methanolobus, Methanothrix, y Methanococcoides.

La presencia de bacterias, virus y hongos en la tierra. Este término no está restringido a organismos patógenos.

Un género de HALOBACTERIACEAE que son quimioorganotróficos y estrictamente aeróbicos.Han sido aislados a partir de múltiples ambientes hipersalinos que varían ampliamente en propiedades químicas y físicas.

Hábitat de aguas termales naturalmente calentadas por procesos geológicos subyacentes. La superficie de los manantiales calientes ha sido usada para la BALNEOLOGIA. Las de aguas termales submarinas se les llama RESPIRADEROS HIDROTÉRMICOS.

Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.

Grupo II de chaperoninas que se encuentran en las especies ARCHEA.

Un grupo de diferentes especies de microorganismos que actúan juntos como una comunidad.

Genes que se hallan tanto en procariotas como en eucariotas, que son transcritos para producir el ARN que se incorpora a los RIBOSOMAS. Los genes procarióticos rARN generalmente se encuentran en operones (OPERÓN) dispersos por el GENOMA, mientras que los genes eucarióticos rARN son unidades transcripcionales multicistrónicas agrupadas.

Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.

Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIAS y ARCHAEA), también llamado de Eukarya. Son organismos cuyas células están envueltas en membranas y poseen un núcleo. Comprenden casi todos los organismos unicelulares y muchos organismos pluricelulares. Tradicionalmente se dividen en grupos (a veces llamados reinos), incluyendo ANIMALES, PLANTAS, HONGOS, diferentes algas, y otros taxones que anteriormente formaban parte del antiguo reino Protista.

Orden de metanógenos anaerobios, altamente especializados, del reino de los EURYARCHAEOTA. Sus organismos son inmóviles o móviles, con células que son como cuerpos cocoides, pseudosarcina o bastoncillos. Las familias incluyen los METHANOMICROBIACEAE, Methanocorpusculaceae y Methanospirillaceae.

Cadenas simples de aminoácidos que son las unidades de PROTEÍNAS multiméricas. Estas pueden estar compuestas de subunidades iguales o no iguales. Una o mas subunidades monoméricas pueden componer un protómero, que a su vez es una subunidad de un conjunto mas amplio.

Familia de archaea extremadamente halofílica que se encuentra en ambientes con altas concentraciones de sal, como los lagos salados, salinas evaporadas o pescado salado. Las Halobacteriaceae son aerobios obligados o anaerobios facultativos y se dividen en al menos veintiséis géneros: HALOARCULA, HALOBACTERIUM, HALOCOCCUS, HALOFERAX, HALORUBRUM, NATRONOBACTERIUM y NATRONOCOCCUS.

Complemento genético de una BACTERIA, representado en su ADN.

Una enzima que contiene ARN que desempeña un rol esencial en el procesamiento ARNt catalizando el clivaje endonucleolítico de precursores de ARN DE TRANSFERENCIA. Remueve los extra 5'-nucleótidos desde los precursores de ARNt para generar moléculas de ARNt maduras.

Transmisión de información genética entre organismos, emparentados o sin parentesco, burlando la transmisión de padres a hijos, que se da de forma natural. Puede darse mediante procesos naturales como la CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA y la TRANSFECCIÓN. Puede dar lugar a un cambio de la composición genética del organismo recipiente (TRANSFORMACIÓN GENÉTICA).

Ordenamiento espacial de los átomos de un ácido nucleico o polinicleótido que produce su forma tridimensional característica.

Presencia de bacterias, virus y hongos en el agua. Este término no está restringido a los organismos patógenos.

Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.

Un género de ARCHAEA con forma de bacilos, casi rectangulares, en la familia THERMOPROTEACEAE. Los organismos son facultativamente aerobios o estrictamente anaerobios, crecen en varios sustratos orgánicos, y se encuentran en solfataras continentales.

Orden de archaea extremadamente termofílico, reductor de sulfato del reino EURYARCHAEOTA. La única familia Archaeoglobaceae contiene un género ARCHAEOGLOBUS.

Un sistema funcional el cual incluye los organismos de una comunidad natural junto a su ambiente. (MeSH/NLM) Unidad ecológica básica, formada por el ambiente viviente (biotopo) y de organismos animales y vegetables que interactúan como un ente funcional único (Material II - IDNDR, 1992)

Gas alcalino incoloro. Es formado en el cuerpo durante la descomposición de materiales orgánicos durante un gran número de importantes reacciones metabólicas. Notar que la forma acuosa del amoniaco se conoce como HIDRÓXIDO DE AMONIO.

Un género de ARCHAEA obligatoriamente anaerobios, en la familia THERMOPROTEACEAE. Se encuentran en manantiales calientes ácidos y en hoyos de agua.

Género de archaea extremadamente termofílico, reductor de sulfato de la familia Archaeoglobaceae.

Orden de CRENARCHAEOTA comprendido por termófilos extremos que son anaerobios, no septados en forma de bastones, discos o esferas y que se encuentran en aguas calientes sulfurosas, hoyos de fango y ambientes submarinos supercalientes.

Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.

El espectro de los organismos vivos que habitan una determinada región determinada, hábitat o biotipo.

Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).

Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)

Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).

Factores de iniciación de péptido a partir de organismos procariotas. Sólo se necesitan tres factores para iniciación de la traducción en los organismos procariotas, que se produce por un proceso mucho más simple que en la INICIACIÓN DE LA CADENA PEPTÍDICA TRADUCCIONAL de los organismos eucariotas.

Orden de archae extremadamente halofílica, en el reino EURYARCHAEOTA. Ocurren frecuentemente en la naturaleza donde la concentración de sal es alta, y son quimorganotróficos, utilizan aminoácidos o carbohidratos como fuentes de carbono.

Familia de multisubunidades de complejos de proteínas que se forman en grandes estructuras cilíndricas que se unen a y encapsulan proteínas no nativas. Las chaperoninas utilizan la energía de la hidrólisis de ATP para aumentar la eficiencia de reacción del PLIEGUE DE PROTEÍNAS y de ese modo ayudar a las proteínas a alcanzar su conformación funcional. La familia de chaperoninas se divide en el GRUPO I DE CHAPERONINAS, y el GRUPO II DE CHAPERONINAS, donde cada grupo poseé su propio repertorio de subunidades de proteína y preferencias de subcelulares.

Pequeño ARN mitocondrial cinetoplástido que desempeña un importante rol en la EDICIÓN DEL ARN. Estas moléculas forman híbridos perfectos con las secuencias editadas de ARNm y poseen secuencias de nucleótidos en sus extremos 5' que son complementarias con las secuencias del ARNm que están inmediatamente corriente abajo de las regiones preeditadas.

Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.

La seudouridina es un nucleósido presente en moléculas de ARN, donde reemplaza a la uridina en algunos residuos y puede contribuir a la estabilidad estructural y función del ARN modificado.

Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.

Lo siento, 'Wyoming' no es un término médico, es el nombre del estado número 44 de los Estados Unidos de América, ubicado en la región de las Montañas Rocosas. No puedo proporcionar una definición médica de esto, ya que no existe tal cosa.

Especie de archaea halofílica que se distingue por su producción de ácido a partir del azúcar. Esta especie se llamó previamente Halobacterium marismortui.

Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.

Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.

Clase de todas las enzimas que catalizan reacciones de oxidación-reducción. El sustrato que es oxidado es considerado donador de hidrógeno. El nombre sistemático está basado en la oxidorreductasa donadora:aceptora. El nombre recomendado es deshidrogenasa, siempre que sea posible. Como alternativa puede usarse reductasa. Oxidasa sólo se usa en los casos en que el O2 es el aceptor.

Factor de transcripción específico de la ARN POLIMERASA II. Tiene una función en la reunión del complejo de preiniciación transcripcional pol II y ha sido implicado como objetivo de los activadores transcripcionales específicos de genes.

Enzimas que reconocen estructuras de ADN CRUCIFORME e introduce incisiones pares que ayudan a resolver la estructura dentro de dos hélices de ADN.

Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.

Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.

El grado de similitud entre la forma tridimensional de las proteínas. Puede ser una indicación de poca HOMOLOGÍA DE SECUENCIA DE AMINOÁCIDO y utilizada para el DISEÑO DE DROGAS racional.

Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.

Una familia de archaea, en el orden DESULFUROCOCCALES consisten en células cocoides anaerobias a discoides. Crecen lo mismo quimiolitoautotróficamente o por FERMENTACION. Se reconocen tres géneros: Pyrodictium, Hyperthermus, y Pyrolobus.

Aguas termales en el fondo del océano. Generalmente, se encuentran cerca de lugares de actividad volcánica tales como arrecifes oceánicos.

Electroforesis en el que varios gradientes desnaturalizantes se utilizan para inducir los ácidos nucleicos a derretirse en las varias etapas que resultando en separación de moléculas basadas en es pequeñas diferencias en las secuencias incluyendo SNPs. Los desnaturalizantes utilizados contienen calor, formamida y urea.

Grado de contenido salino, que es en gran parte la CONCENTRACIÓN OSMOLAR de CLORURO DE SODIO más cualquiera de las otras SALES presentes. Es un factor ecológico de gran importancia, que influye en los tipos de organismos que viven en un AMBIENTE.

El mineral no consolidada o materia orgánica en la superficie de la tierra que sirve como un medio natural para el crecimiento de las plantas terrestres.

La región de una enzima que interactúa con su substrato provocando una reacción enzimática.

Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.

Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.

La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)

Forma tridimensional y ordenamiento característico de las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).

Proceso mediante el cual dos moléculas con la misma composición química forman un producto de condensación o polímero.

Enzimas que catalizan la metilación dependiente de S-adenosil-L-metionina de las bases ribonucleótidas en el interior de una molécula de ARN de transferencia. EC 2.1.1.

Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis del ATP. La reacción de hidrólisis usualmente es acoplada con otra función, tal como transportar Ca(2+) a través de la membana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca(2+), Mg(2+), aniones, H+, o ADN.

Género de HALOBACTERIACEAE extremadamente halofílico, quimioheterotróficas y estrictamente aerobias. Se encuentran en ambientes salinos neutros como los lagos salados (especialmente el Mar Muerto) y salinas marinas.

ARN de transferencia que es específico para transportar triptófano hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.

Enzima que activa la leucina con su ARN de transferencia específico. EC 6.2.2.4.

Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.

Género de plantas anuales y perennes herbáceas de la familia RUBIACEAE.

Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.

ARNs nucleares pequeños que participan en el procesamiento del ARN pre-ribosómico en el nucleolo. La caja C/D contiene ARNnop's (U14, U15, U16, U20, U21 y U24-U63) dirige la metilación específica del sitio de diversas porciones de ribosa. La caja H/ACA que contiene ARNnop's (E2, E3, U19, U23, y U64-U72) dirige la conversión de uridinas específicas a pseudouridina. La escisión en sitios específicos que se produce en los ARNs ribosómicoa maduros es dirigida por ARNnop's U3, U8, U14, U22 y los componentes ARNnop's de la ARNasa MRP y ARNasa P.

Procesos por los cuales los organismos usan sustancias inorgánicas simples, tales como dióxido de carbono gaseoso o disuelto y nitrógeno inorgánico como fuente de nutrientes. Contrasta con procesos heterotróficos que hacen uso de materiales orgánicos como la fuente de suministro de nutrientes. Los autótrofos pueden ser tanto quimioautótrofos (o quimiolitótrofos), principalmente ARCHAEA y BACTERIAS, que también consumen sustancias inorgánicas simples para sus requisitos de energía metabólica, o fotoautótrofos (o fotolitótrofos), tales como PLANTAS y CIANOBACTERIAS, que derivan su energía de la luz. Dependiendo de las condiciones ambientales, algunos organismos pueden cambiar entre los diferentes modos de nutrición (PROCESOS AUTOTRÓFICOS; PROCESOS HETEROTRÓFICOS; procesos quimiotróficos; o PROCESOS FOTOTRÓFICOS) para utilizar diferentes fuentes para satisfacer sus necesidades de nutrientes y energía.

Zonas de la tierra donde se ubican depósitos de hidrocarburos de PETRÓLEO y / o GAS NATURAL.

Agua que contiene cantidades no significativas de sales, como el agua de RÍOS y LAGOS.

Subclase de enzimas que aminoacilan el ARN DE TRANSFERENCIA AMINOÁCIDO-ESPECÍFICO con los correspondientes AMINOÁCIDOS.

Propiedades y procesos fisiológicos de BACTERIA.

No puedo proporcionar una definición médica de 'Océano Pacífico' ya que este término se refiere a un cuerpo de agua geográfico y no tiene relación con la medicina.

Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.

Procesos que intervienen en la formación de ESTRUCTTURA TERCIARIA DE PROTEÍNA.

Conversión de TRANSFERENCIA DE ARN sin carga a AMINOACIL ARNt.

Familia de METHANOMICROBIALES anaerobios cuyas células tienen forma de cocos, bastoncillos rectos o ligeramente curvos. Hay seis géneros.

Subcategoría de chaperoninas que se encuentran en la ARCHAEA y el CITOSOL de las células eucariotas. El grupo II de chaperoninas forman una estructura molecular en forma de barril que se distingue de las CHAPERONINAS DEL GRUPO I en que no utiliza una estructura separada de unión para incluir las proteínas similares lid.

Sustancias de origen arqueal que tienen actividad antigénica.

Secuencia de tripletes de nucleótidos sucesivos que son leidos como un CODÓN especificador de AMINOÁCIDOS y que comienza con un CODÓN INICIADOR y termina con un codón de parada (CODÓN TERMINADOR).

Inmunoglobulinas producidas en unarespuesta a ANTIGENOS ARQUEALES.

Conjunto de métodos de estadística usados para agrupar variables u observaciones en subgrupos altamente inter-relacionados. En epidemiología, se puede usar para analizar series de grupos de eventos con gran afinidad entre si o casos de enfermedad u otros fenómenos relacionados a la salud cuyos modelos de distribución sean bien definidos con respecto a tiempo o espacio, o a ambos.

Cuerpos tierra adentro apaciguados o movimientos lentos de AGUA DULCE o agua salada, más grande que un estanque, y suministrados por RÍOS y arroyos.

Familia de plantas del orden Myrtales, subclase Rosidae y clase Magnoliopsida. Son de árboles y arbustos que crecen sobre todo en áreas templadas.

Conjunto de organismos acuáticos diminutos PLANTAS y ANIMALES y BACTERIAS fotosintéticas, que flotan libremente o están suspendidos en el agua, con poco o ningún poder de locomoción. Están divididos en FITOPLANCTON y ZOOPLANCTON.

Biosíntesis del ARN dirigida por un patrón de ADN. La biosíntesis del ADN a partir del modelo de ARN se llama TRANSCRIPCIÓN REVERSA.

Microscopía electrónica en la que se produce una congelación rápida de las muestras. La imagen de las moléculas hidratadas-congeladas y de los organelos permite obtener la mejor resolución posible que semeja al estado vivo, libre de fijadores químicos o de colorantes.

Factor de transcripción general que desempeña un papele principal en la activación de los genes aucarióticos, transcritos por ARN POLIMERASAS. Se une específicamente al elemento promotor de TATA BOX, situado muy próximo a la posición de la iniciación de la transcripción en el ARN transcrito por la ARN POLIMERASA II. Aunque considerado como componente principal del FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN TFIID, participa también en los complejos generales de factores de transcripción implicados en la transcripción de ARN POLIMERASA I y ARN POLIMERASA II.

Correspondencia secuencial de nucleótidos en una molécula de ácido nucleico con los de otra molécula de ácido nucleico. La homología de secuencia es una indicación de la relación genética de organismos diferentes y la función del gen.

Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.

Componentes proteicos de los SISTEMAS CRISPR-CAS para la defensa antiviral en BACTERIA y ARCHAEA. Estas son proteínas que llevan a cabo una variedad de funciones durante la creación y expansión de las SECUENCIAS CRISPR, la captura de nuevos ESPACIADORES CRISPR, biogénesis de PEQUEÑOS ARN DE INTERFERENCIA (CRISPR o crARNs), y la orientación y el silenciamiento de los virus y plásmidos invasores. Incluyen ADN HELICASAS; PROTEÍNAS PORTADORAS DE ARN, ENDONUCLEASAS, y ARN y ADN POLIMERASAS.

Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.

Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.

Bacteriófago y especie tipo del género Tectivirus, familia TECTIVIRIDAE. Son específicos de bacterias gramnegativas.

Enzimas que catalizan la extensión dirigida por el molde de ADN, del terminal 3' de una cadena de ARN, un nucleótido cada vez. Pueden iniciar una cadena de nuevo. En eucariotes, se han distinguido tres formas de la enzima en base a la sensibilidad a la alfa-amanitina y al tipo de ARN sintetizado. (Adaptación del original: Enzyme Nomenclature, 1992).

Enzima que se encuentra principalmente en BACTERIAS REDUCTORAS DE AZUFRE, donde desempeñan una función importante en la vía de oxidación anaerobia del carbono.

El estudio sistemático de las secuencias completas del ADN (GENOMA) de los organismos.

Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.

Genoma colectivo representante de muchos organismos, principalmente microorganismos, que existe en una comunidad.

Especie de archaea halofílica cuyos organismos son inmóviles. Los hábitats incluyen agua dulce y lodo marino, lagunas de desechos animales, y el rumen de ungulados.

Ausencia total, o (aproximadamente) la escasez, de oxígeno elemental disuelto o gaseoso en un lugar o ambiente determinado.

Componentes estructurales de proteínas, comunmente observados, formados por combinaciones simples de estructuras secundarias adyacentes. Una estructura comunmente observada puede estar compuesta por una SECUENCIA CONSERVADA que puede estar representada por una SECUENCIA DE CONSENSO.

ADN polimerasas dependientes de ADN, que se encuentran en bacterias, animales y vegetales. Durante el proceso de replicación, estas enzimas catalizan la adición de residuos de desoxirribonucleótidos al extremo de una cadena de ADN en presencia de ADN como modelo-iniciador. También poseen actividad exonucleasa y por lo tanto funcionan en la reparación del ADN.

Proteínas que se unen al ADN. La familia incluye proteínas que se unen tanto al ADN de una o de dos cadenas y que incluyen también a proteínas que se unen específicamente al ADN en el suero las que pueden utilizarse como marcadores de enfermedades malignas.

Género de HALOBACTERIACEAE cuyo crecimiento requiere de una elevada concentración de sal. La fisión binaria es por constricción.

Familia de enzimas que catalizan la segmentación endonucléolítica del ARN. Incluye EC 3.1.26.-, EC 3.1.27.-, EC 3.1.30.- y EC 3.1.31.-.

Enzima que activa la serina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.11.

El continente situado alrededor del polo sur y las aguas del sur de los océanos Atlántico, Pacífico e Indico. Incluye las Dependencias de las Islas Falkland.

Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).

Proteínas que se encuentran en los ribosomas. Se cree que tengan una función catalítica en la reconstrucción de las subunidades ribosomales biológicamente activas.

Grupo de PROTEOBACTERIA representadas por sulfidógenos anaerobios, morfológicamente variados. Algunos miembros de este grupo se consideran depredadores bacterianos, con propiedades bacteriolíticas.

ARN de transferencia que es específico para transportar glutamina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.

Grado de semejanza entre secuencias. Los estudios de HOMOLOGIA DE SECUENCIA DE AMINOÁCIDO y HOMOLOGIA DE SECUENCIA DE ÁCIDO NUCLEICO proporcionan información útil sobre la interrelación genética de genes, productos génicos y especies.

La facilitación de una reacción química por material (catalizador) que no es consumida por la reacción.

El montaje de la ESTRUCTURA CUATERNARIA DE PROTEÍNA de las proteínas multiméricas (COMPLEJOS MULTIPROTEÍNAS) desde sus compuestos de las SUBUNIDADES DE PROTEÍNA.

Un elemento miembro de la familia de los calcógenos. Tiene por símbolo atómico S, número atómico 16 y peso atómico [32.059; 32.076]. Se encuentra en los aminoácidos cisteína y metionina.

Rodopsinas fotosensoriales existentes en microorganismos tales como EURYARCHAEOTA. Estos compuestos convierten las señales luminosas en información bioquímica que regula determinadas funciones celulares, como la actividad motora de los flagelos.

ARN de transferencia que es específico para transportar tirosina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.

Los procesos mediante los cuales las dos cadenas de la doble hélice del ADN se separan, permitiendo que cada cadena actúe como plantilla para la síntesis de una cadena complementaria mediante el pareamiento de bases específicas. Comprende la replicación autónoma pero no la REPLICACION VIRAL.

La localización secuencial de genes en un cromosoma.

Enzimas de la clase de las isomerasas que catalizan la transferencia de acil-, fosfo-, amino- u otros grupos, de una posición a otra dentro de una molécula. EC 5.4.

ARN de transferencia que es específico para transportar asparragina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.

Crecimiento de microorganismos que utilizan PROCESOS AUTÓTROFOS para obtener nutrientes y procesos quimiótrofos para obtener su aporte principal de energía. Los procesos quimiótrofos intervienen en la obtención del aporte principal de energía de fuentes químicas exógenas. Los autótrofos quimiótrofos (quimioautótrofos) generalmente usan compuestos inorgánicos como fuentes de energía y, por tanto, se denominan quimiolitoautótrofos. La mayoría de los quimioautótrofos viven en medios hostiles, como las fumarolas marinas profundas. Son sobre todo BACTERIAS y ARCHAEA, y son los principales productores de estos ecosistemas.

Proteínas que contienen hierro que transfieren electrones a las flavoproteínas, generalmente en un bajo potencial; el hierro no está presente como en el hemo.

Complejos nucleolares de ARN-proteína que funcionan en el procesamiento del ARN pre-ribosómico.

Bacteria en forma de bastoncillo rodeada de una estructura en forma de vaina que tiene salientes en forma de balón fuera de los extremos de la célula. Es termofílica, el crecimiento ocurre con temperaturas tan altas como 90 grados C. Se aisla de sedimentos marinos geotérmicamente calientes o de aguas termales.

La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)

Enzima que activa la lisina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.6.

Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.

La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.

Filo de bacterias constituida por la bacteria púrpura y sus semejantes y que constituyen una de las ramas del árbol eubacteriano. Este grupo esta constituido predominantemente por bacterias gramnegativas y se clasifican en base a la homología de las secuencias de nucleótidos equivalentes del ARN ribosómico 16S o por hibridización del ARN o ADN ribosómico con 16S y ARN ribosómico 16S y 23S.

La zona física inmediata alrededor de las raíces de las plantas incluidas las raíces de las plantas. Es un área de intensa y compleja actividad biológica que involucra a las plantas, microorganismos, otros organismos del suelo, y al suelo.

Enzima que activa la tirosina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.1.

Proteínas que catalizan la reversión del dúplex de ADN durante la replicación mediante la unión cooperativa para las regiones de cadena simple de ADN o para las regiones cortas de ADN dúplex que están experimentando apertura transitoria. Además las helicasas ADN son ATPasas dependientes de ADN que aprovechan la energía libre de la hidrólisis de ATP para trasladar los filamentos de ADN.

El factor 1 de elongación peptídica es una proteína con muchas subunidades, responsable del enlace dependiente de GTP, de los aminoacil-ARNt's a los ribosomas eucarióticos. La subunidad alfa (EF-1alfa) se une al aminoacil-ARNt y los transfiere al ribosoma, en un proceso vinculado a la hidrólisis del GTP. Las subunidades beta y delta (EF-1beta, EF-1delta) participan en la conversión de GDP a GTP. La subunidad gamma (EF-1gamma) es un componente estructural.

La facilitación de reacciones bioquímicas con la ayuda de catalizadores de origen natural tales como las ENZIMAS.

Secuencia única de ADN de un replicón en la que se inicia la REPLICACIÓN DEL ADN y prosigue bidireccional o unidireccionalmente. Contiene los sitios en que ocurre la primera separación de las cadenas complementarias, se sintetiza un primer ARN, y tiene lugar el cambio del primer ARN a la síntesis de ADN. (Adaptación del original: Rieger et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed).

Género de HALOBACTERIACEAE en forma de bastoncillos y extremadamente halofílica que crece en condiciones alcalinas. Son estrictamente aerobias y algunas cepas son móviles. La Natronobacterium se encuentra en lagos sódicos, salinas alcalinas y suelos sódicos.

Herramientas o aparatos para generar productos empleando la capacidad de conversión sintética o química de un sistema biológico. Pueden ser fermentadores clásicos, sistemas de perfusión de cultivo de células, o biorreactores de enzimas. Para la producción de proteínas o enzimas, se seleccionan microorganismos recombinantes como las bacterias, células de mamífero, o células de insectos o de vegetales.

Conjuntos de reacciones enzimáticas que tienen lugar en los organismos y forman compuestos bioquímicos estableciendo nuevos enlaces covalentes.

El estudio del origen, estructura, desarrollo, crecimiento, función, la genética y la reproducción de los organismos que habitan en los OCÉANOS Y MARES.