Hydrogenas
Ett enzym som finns i bakterier. Det katalyserar reduktionen av ferredoxin och andra ämnen i närvaro av molekylärt väte och deltar i elektrontransport i den bakteriella fotosyntesen. EC 1.18.99.1.
Väte
Det första grundämnet i det periodiska systemet. Väte har kemiskt tecken H (Hydrogen), atomnummer 1 och atomvikt 1. Det förekommer normalt i form av en färglös, luktfri och smaklös gas, vätgas, med formeln H2. Vätejoner är protoner. Förutom den vanliga isotopen H1 finns den stabila isotopen deuterium (D) och den instabila radioisotopen tritium (T).
Desulfovibrio
Nickel
I en enskild medicinsk betydelse kan "nickel" definieras som ett metalliskt allergen som kan orsaka kontakteksem eller överkänslighetsreaktioner hos vissa individer. Nickel är ett vanligt ämne i olika typer av metalliska produkter, såsom smycken, armbandsur, och blyertsminor, och kan frisättas över tiden och komma i kontakt med huden, vilket kan leda till allergiska reaktioner.
Oxidoreduktaser
Thiocapsa reseopersicina
*Thiocapsa roseopersicina* är en art av sulfidbakterier som tillhör släktet *Thiocapsa*. Denna bakterie är fototrofisk och kan oxidera svavel för att producera energi genom ett process som kallas anoxygenn fotosyntes. Bakterien innehåller också fukoxantin och bacterioruberin, två pigment som ger den sin karakteristiska rosa färg. *Thiocapsa roseopersicina* förekommer vanligtvis i sötvattenmiljöer med höga nivåer av svavelvätegas (H2S) och låga syrenivåer.
Alcaligenes
Järn-svavelproteiner
Cupriavidus necator
"Cupriavidus necator" är en gramnegativ, aerob bakterie som förekommer i naturen, bland annat i jord och vatten. Den har förmåga att bryta ned vissa organiska ämnen och kan användas inom bioteknik för produktion av kemikalier såsom polyhydroxialkanoater (PHA), som är en typ av bioplast. Den kan också reducera kväve till ammoniak och har därför potentialt att användas för behandling av avloppsvatten.
Rhizobiaceae
Rhizobiaceae är en familj av gramnegativa, aeroba eller fakultativt anaeroba, stavformade bakterier som huvudsakligen lever i symbios med växter. De är kända för sin förmåga att fixera kväve, vilket innebär att de kan omvandla atmosfärisk kväve till ammoniak, en form av kväve som kan användas av växter för att syntetisera aminosyror och andra organiska molekyler.
Viologener
Viologener är en grupp av organiska föreningar som innehåller två kväveatomer bundna till varandra genom två kolatomgrupper, vilket ger upphov till en dipositivt laddad heterocyclisk struktur. De är kända för deras elektronacceptor-egenskaper och används ofta inom områden som elektronik, solceller och medicinsk forskning.
Formatdehydrogenaser
Flavoproteiner som reversibelt katalyserar reduktionen av koldioxid till format. Många föreningar kan vara mottagare (acceptorer), men den enda fysiologiskt aktiva acceptorn är NAD. Enzymerna har sin verkan vid fermentering av sockerarter och andra föreningar till koldioxid och är nyckelenzymer för energialstring när bakterier odlas på format som viktigaste kolkälla. De renframställs ur bovint blod. EC 1.2.1.2.
Oxidation-reduktion
Kolmonoxid
Elektronspinnresonansspektrografi
En teknik som är tillämpbar på en mängd olika ämnen som uppvisar paramagnetism till följd av magnetismen alstrad av opariga elektroner. Erhållna spektra kan användas för påvisande, identifiering, och bestämning av elektronstrukturer, undersökning av molekylers interaktioner, och för mätning av kärnspinn och magnetiska moment. Elektronisk dubbelresonansspektrografi (ENOR) är en variant av tekniken som ger bättre upplösning. Spinnresonansanalys kan göras in vivo, och inkluderar tillämpningar som t ex magnetresonans (MRI). Syn. ESR.
Desulfovibrio vulgaris
Clostridium
Rhizobium leguminosarum
Rhizobium leguminosarum är en bakterieart som förekommer i jord och som bildar noduler på rötterna hos vissa grönsaker i familjen lökväxter, särskilt klövrar. I dessa noduler konverterar bakterien kvävegas till ammoniak, vilket används av växten för att bygga upp proteiner och andra organiska molekyler. Denna process kallas kvävefixering och är viktig för att underhålla markens näringsstatus. I en mening kan man säga att Rhizobium leguminosarum är en symbiotisk kvävefixerande bakterie som lever i noduler på rötterna hos klövrar och andra relaterade grönsaker.
Ferredoxiner
Methanosarcina barkeri
Formater
I medicinsk kontext, betyder "formatera" att organisera information eller data på ett standardiserat sätt, ofta genom att använda kontrollerade språk och terminologier, för att underlätta datainsamling, analys, utbyte och tolkning mellan olika vårdsystem, forskningsstudier eller offentliga hälsoregistret.
Anaerobios
En livsmiljö utan syrgas.
Clostridium acetobutylicum
Euryarchaeota
Pyruvatsyntas
Pyruvatsyntase, även kallad pyruvatkinas, är ett enzym som katalyserar omvandlingen av fosfoenolpyruvat till pyruvat under utvecklandet av ATP (adenosintrifosfat) och NADH i glykolysprocessen. Detta steg markerar slutet på glykolysens anaeroba fas. Pyruvatsyntas finns i två isoformer, L-formen som är aktiv i muskler och R-formen som är aktiv i levern.
Nostoc
Nostoc är ett släkte blågröna cyanobakterier (tidigare kända som blågröna alger), som lever som ensamma celler eller bildar kolonier som kan vara täckta av en geléartad substans. Nostoc-arter förekommer globalt och kan hittas i en mängd olika habitat, inklusive mark, sötvatten, brackvatten och extrem miljöer som öknar och polarområdena. De flesta Nostoc-arter är fotosyntetiska och kan fixera kvävegas, vilket gör dem viktiga för att fånga atmosfäriskt kväve och omvandla det till en form som kan användas av andra organismer. Nostoc har också potentialen att producera en rad bioaktiva metaboliter med möjlig medicinsk relevans, såsom antibakteriella, antivirala och antitumörmedel.
Svavel
Svavel (S) är ett icke-metalliskt grundämne som förekommer naturligt i naturen och är en essentiell näringsämne för levande organismer. Det är ett giftigt, illaluktande, gulaktigt gas vid rumstemperatur och omvandlas till en fast, vit substans under lägre temperaturer. Svavel förekommer i proteiner och som svavelkväveföreningar i levande växter och djur. Det används också inom industrin för att producera svavelsyra, kemikalier, gummi, pesticider och som desinfektionsmedel.
Alteromonas
Järn
Ett i jordskorpan allmänt utbrett metalliskt grundämne. Kemiskt tecken är Fe, atomnummer 26 och atomvikt 55,85. Järn är en väsentlig beståndsdel i hemoglobin, cytokrom och andra komponenter i respiratoriska enzymsystem. Dess främsta funktioner är att transportera syre till vävnader (hemoglobin) och att ingå i cellulära oxidationsförlopp. Uttömning av järnförråden kan leda till järnbristanemi. Järn används för att återuppbygga blodet vid anemi.
Chromatium
Parakvat
Paraquat är ett starkt och kontroversiellt herbicid som används för att kontrollera ogräs på kommersiella jordbruksmarker. Det är en mycket giftig substans som kan orsaka allvarliga skador på lungor, lever, njurar och hjärta vid exponering, och kan vara dödligt om det sväljs, andas in eller kommer i kontakt med huden i högre koncentrationer. Paraquat är förbjudet i flera länder, inklusive Europa, men används fortfarande i vissa delar av världen.
Molekylsekvensdata
Rhodobacter capsulatus
Rhodobacter capsulatus är en gramnegativ, strikt aerob bakterie som tillhör alfaproteobakterierna (Alphaproteobacteria). Den är känd för sin förmåga att utföra fotosyntes under anoxiska förhållanden och kan bilda pigmenterade granuler, så kallade utsvällningar, som innehåller bakteriekolerider. R. capsulatus är också känd för sin förmåga att fixera kväve och är därför användbar inom bioteknologi för produktion av kommersiella proteinprodukter.
Elektrontransport
Reglering av genuttryck, bakterier
Kolibakterie
Chlamydomonas reinhardtii
Operon
Ett operon är ett genkluster i prokaryota celler, som består av en grupp reglerade strukturgener och ett operatörregion som kontrolleras av ett gemensamt promotorområde, vilket tillåter koordinerad transkription av flera gener under kontroll av samma regulatorprotein.
Acetylen
Syrgas
"Syrgas" er en sammentrekning av ordene "syre" og "luft", og refererer til den atmosfæriske luften som vi normalt inhalerer, som består av omkring 21% syre (O2), 78% kv nitrogen (N2) og små mengder av andre gasser som argon, kultilkristaller og spor av kullilkristaller. I denne enkelte meningen kan syrgas definieres som den atmosfæriske luft som inneholder 21% syre (O2) som er livsviktig for mennesker og andre levende vesen for å oksidere (forbranne) næringsstoffer for å produsere energi i cellene.
Methanococcus
Aminosyrasekvens
Ditionit
Veillonellaceae
Veillonellaceae är en familj av gramnegativa, icke sporbildande, anaeroba bakterier som förekommer naturligt i människans mun, tarm och hud. Dessa bakterier är asacrobatiska, vilket betyder att de producerar energisubstrat genom att oxidera en substans samtidigt som de reducerar en annan. De är kända för sin förmåga att bryta ned laktat till kolmonoxid och acetat, vilket kan hjälpa att reglera pH-balansen i den mänskliga tarmen. Vissa studier har visat att överväxt av Veillonellaceae kan vara associerad med vissa sjukdomstillstånd, men ytterligare forskning behövs för att fastslå deras exakta roll i patofysiologiska processer.
Genetisk förbättring
Thermococcus
Thermococcus är ett släkte av archaeer, en grupp encelliga mikroorganismer som saknar cellkärna och mitokondrier. Thermococcus-arkeerna är termofila, vilket betyder att de trivs vid höga temperaturer, ofta runt 80-103 grader Celsius. De förekommer naturligt i extrema miljöer som hydrotermiska ventilationssystem (svavelkällor) på oceanbotten och har potentialen att producera industriellt användbara enzymer som kan tåla höga temperaturer och andra extrema förhållanden.