"Cold shock proteins and peptides refer to a group of molecular chaperones that are produced by an organism in response to cold stress. These proteins and peptides play a crucial role in protecting cells from damage caused by exposure to low temperatures, by preventing protein denaturation and aggregation. They also help to maintain cellular homeostasis during cold stress and contribute to the overall survival of the organism in cold environments."
Avsaknad av värme eller temperaturer märkbart under den normala.
Proteiner som alstras i eukaryota organismer och bakterier som svar på överhettning och andra stressfaktorer i omgivningen. De ökar värmetåligheten och utför funktioner som är livsviktiga under sådana förhållanden.
Proteiner förekommande hos någon bakterieart.
"Peptider är korta aminosyrekedjor som bildas genom att flera aminosyror binds samman med peptidbindningar, vilket skapar en polymer med biologisk aktivitet."
Beskrivningar av specifika sekvenser av aminosyror, kolhydrater eller nukleotider som publicerats och/eller deponerats och hålls tillgängliga i databaser som t ex Genbank, EMBL, NBRF eller andra sekvensdataarkiv.
De processer genom vilka cytoplasmatiska eller intercellulära faktorer inverkar på differentieringsstyrningen av genaktiviteten hos bakterier.
*Thermotoga maritima* är en termofil, anaerob och strikt heterotrof arkae-bakterie som lever i extrema höga temperaturer upp till 90°C, ofta hittad i marina hydrotermiska ventar. Den har en unik cellmembranstruktur med en yttre lipidmonoschicht och en inre peptidoglykanlagrad membran som skyddar den från höga temperaturer och högt tryck. *Thermotoga maritima* använder sig av ett bredt spektrum av organiska ämnen som kolkälla genom att oxidera dem till koldioxid och acetat, vilket gör den till en potentialt intressant producent av bioenergi.
Aminosyrors ordningsföljd i en polypeptidkedja. Den utgör proteiners primärstruktur och är av avgörande betydelses för proteinkonfigurationen.
Nedfrysning, även känt som fixation eller konservering, är ett medicinskt förfarande där ett kroppsdel eller ett helt lik bevaras genom att ersätta vatten och fett i celler och vävnader med en konserveringsvätska, ofta formeldahydrat (formaldehyd). Detta hjälper till att förhindra nedbrytning och förminskar risken för smitta.
En klass molekylära chaperoner som finns både hos prokaryoter och ett flertal avdelningar av eukaryota celler. Det föreligger bevis för att dessa proteiner kan samverka med polypeptider i ett antal olika uppbyggnadsförlopp, så att bildande av icke-funktionella strukturer förhindras.
En art gramnegativa, fakultativt anaeroba och stavformade bakterier som normalt förekommer i den nedre delen av tarmkanalen hos varmblodiga djur. Vanligtvis är den inte patogen, men vissa stammar kan ge upphov till diarré och variga infektioner. Syn. E. coli.
I jord och vatten vanligt förekommande saprofytisk, grampositiv bakterie.
I en enkel mening kan temperatur inom medicinen definieras som den grad av värmevariation eller termisk energi som mäts i kroppen hos levande organismer, vanligtvis i enheten Celsius (°C) eller Fahrenheit (°F). Den normala kroppstemperaturen för en vuxen människa varierar vanligtvis mellan 36,5 och 37,5 °C (97,7 till 99,5 °F), även om det kan variera något beroende på individuella skillnader, tid på dygnet och metoden för temperaturmätning.
Purin- och pyrimidinföljden i nukleinsyror och polynukleotider. Kallas även nukleotid- eller nukleosidsekvens.
Proteiner från Escherichia coli.
The 'Cold-Shock Response' is a physiological reaction that occurs in an organism when exposed to sudden cold water immersion or a rapid decrease in temperature. This response triggers various autonomic and hormonal changes, including increased heart rate, blood pressure, and respiratory rate, as well as the release of stress hormones like adrenaline and cortisol. These responses are primarily aimed at preserving core body temperature and maintaining vital functions during cold exposure.
Septisk chock definieras som ett livshotande tillstånd orsakat av en allvarlig infektion som leder till ett cirkulatoriskt collapse med multiorgansvikt.
Fysiologisk anpassning (eng. physiological adaptation) refererar till de förändringar och anpassningar som sker inom levande organismers fysiologiska system, såsom andnings-, kardiovaskulära och endokrina system, i respons till långvariga eller plötsliga förändringar i deras inre och yttre miljö. Detta hjälper organismen att upprätthålla homeostas, en jämvikt av kroppens interna processer, och öka dess överlevnadschans under påverkande faktorer som exempelvis klimatförändringar, höga eller låga temperaturer, syrgasyttrekt orörda miljöer eller förändrade näringsriktningar. Fysiologisk anpassning kan ske på genetisk nivå genom naturligt urval eller på kortare sikt genom reversibla fysiologiska justeringar som exempelvis ökad hjärtfrekvens under fysisk
Proteinveckning, eller proteinfoldning, är den process där ett proteinmolekyl plattar ut sig självt och bildar en tredimensionell struktur, som är nödvändig för dess funktion. Denna process sker spontant och är styrd av interaktionerna mellan de aminosyror som proteinets sekvens består av. Fel i proteinveckningen kan leda till att proteinet inte fungerar korrekt, vilket kan orsaka sjukdomar.
I en enskild medicinsk betydelse kan "chock" definieras som ett tillstånd av akut och allvarlig stress på kroppen, ofta orsakad av ett trauma, intensiv blödning, infection eller andra fysiologiska störningar. Chock utlöses vanligtvis av en kombination av cirkulationssvikt och hypoxi (syrebrist), vilket kan leda till cellskador och organsvikt om det inte behandlas akut. Symptomen på chock kan inkludera snabb andning, låg puls, lågt blodtryck, blekhet, yrsel, förvirring och medvetandeförlust.
En klass molekylära chaperoner vars medlemmar medverkar i steroidreceptorers signalöverföringsmekanism.
"Bakteriellt RNA" refererar till RNA (Ribonukleinsyra) som förekommer hos bakterier. Detta inkluderar olika typer av RNA: messenger RNA (mRNA), ribosomalt RNA (rRNA) och transfer RNA (tRNA). Dessa molekyler spelar viktiga rollar i protein syntesen hos bakterier.
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
En blandning av reaktioner som inträffar när en organism utsätts för extrem värme och annan miljöbetingad stress. Till reaktionerna hör syntes av vissa proteiner, undertryckande av andra proteiner och uttryckande av nya.
HSP27, eller heat shock protein 27, är ett molekylärt chaperon som hjälper till att folda, transportera och skydda andra proteiner i cellen under normala förhållanden och under stress. Detta specifika chaperon tillhör små heat shock protein-familjen (sHSP) och är känt för sin roll i celldefens och överlevnad under stressförhållanden som höga temperaturer, toxiska substanser och oxidativ skada. HSP27 kan också spela en roll i cellcykeln, apoptos (programmerad celldöd) och cytoskelettorganisation.
RNA-binding proteins (RBPs) are a type of protein that selectively interact with RNA molecules, playing crucial roles in post-transcriptional regulation of gene expression. They can bind to various structural elements within RNA, such as double-stranded RNA, single-stranded RNA, hairpins, and other secondary structures, influencing RNA processing, stability, localization, and translation. The specificity of RNA-protein interactions is determined by the recognition of distinct RNA sequences and/or structural motifs through the modular domains present in RBPs.
En form av energi och en känsla av förhöjd temperatur. Inom medicinen är värme av intresse för sina fysiologiska effekter, för terapeutisk användning, och för bruk i förfaranden inom fysik eller fysikalisk kemi.
Medlemmar av familjen värmechockproteiner (HSP). Chaperonin 60 isolerad från bakterier, plastider eller mitokondrier uppträder som ett oligomerprotein med en distinkt struktur bestående av 14 underenh eter, ordnade i två ringar med sju i varje.
Experimentella eller teoretiska modeller för undersökning av molekylers form, elektroniska egenskaper eller interaktioner. Hit hör även analoga molekyler, datorframställd grafik och mekaniska strukturer.
I enkelhet kan 'proteinkonfiguration' definieras som den specifika rymdstrukturen och orienteringen hos de aminosyror som utgör ett protein. Denna konfiguration bestäms av proteinkedjans primära struktur (sekvensen av aminosyror) samt hur dessa aminosyror är hopfogade och vevda i rummet, vilket kallas för sekundär, tertiär och kvartär struktur. Proteinkonfigurationen har en direkt betydelse för proteinets funktion och stabilitet.
Proteiner som transporterar specifika ämnen i blodet eller genom cellväggar.
"Sekundær proteinstruktur refererer til den lokale, regulære foldning af en del af et proteins peptidkæde, der er stabiliseret af hydrogenbindinger mellem aminosyrestrupperne, f.eks. alfa-helix eller beta-skal."
Ett peptidfragment är en kort sekvens av aminosyror som har beeneds klippt isär från ett större peptid eller protein.
HSP72 är ett stressprotein som hör till familjen av heat shock proteiner (HSP) och har specificerad molekylär vikt på 72 kDa. Det induceras under cellstress, såsom värmestress, ischemisk skada, toxisk exponering och infektion, för att hjälpa till att skydda och stabilisera proteinstrukturen och underlätta proteinrefoldning av missfoldade proteiner, för att motverka celldöd och på så sätt främja cellöverlevnad.
En blödningschock definieras som ett tillstånd av akut cirkulatorisk kompromiss orsakad av ett allvarligt blodförlust, med hypotension, sänkt perfusionsnivå och organsvikt som följd.
Katarral sjukdom i de övre luftvägarna, vilken kan utgöras av virusinfektion, blandinfektion eller allergisk reaktion. Märkbara kännetecken är snuva, lätt feber, frossa och allmän olustkänsla.
Ett peptidbibliotek är en samling av ett stort antal olika syntetiska peptider, som tillsammans bildar en resurs för forskning inom områden såsom strukturell biologi, biokemi och medicinsk kemi. Peptidbiblioteken kan vara specialdesignade för att undersöka specifika frågeställningar, till exempel hur olika peptider interagerar med proteiner eller andra molekyler i levande system. Varje peptid i biblioteket är unik och består av en kedja av aminosyror som är kovalent bundna till varandra. Peptidbiblioteken kan användas för att hitta nya ledtrådar om hur olika biologiska processer fungerar, och de kan också vara värdefulla vid utvecklingen av nya läkemedel och terapeutiska behandlingsmetoder.
Laktamer som bildar föreningar med ringar med en storlek av ca 1-3 dussin atomer.
Bensenringar med två ketondelar i någon position. Substitutioner kan förekomma i alla positioner utom där ketongrupperna sitter.
En familj cellproteiner som förmedlar korrekt sammansättning och sönderdelning av andra polypeptider, och i vissa fall byggande av oligomera strukturer, men som själva inte ingår i de slutgiltiga strukturerna. Man antar att chaperonproteiner medverkar till polypeptiders självkonstruktion genom att hindra alternativa sammansättningsförlopp som skulle producera icke-funktionella strukturer. Några klasser av molekylära chaperoner är nukleoplasminer, chaperoniner, HSP70-stressproteiner och HSP90-stressproteiner.
Små, katjoniska peptider som hos de flesta arter utgör en viktig del av det tidiga, medfödda och framkallade försvaret mot angripande mikroorganismer. Hos djur finns de på slemhinnor, i fagocytkorn oc h på kroppsytorna. Också insekter och växter har dessa peptider. Gruppen omfattar bl a defensiner, protegriner, takyplesiner och tioniner.
"Small Heat-Shock Proteins (sHSPs)" are a group of conserved proteins that are induced by heat and other stressful conditions in cells across many species, including humans. They function as molecular chaperones, helping to prevent protein misfolding and aggregation under stressful conditions, thereby promoting protein homeostasis and cell survival. The term "small" refers to their relatively low molecular weights, typically ranging from 12 to 43 kDa. sHSPs can form large oligomeric complexes and interact with other chaperone systems to maintain the proper folding and function of proteins in the cell.
Anpassning till en ny omgivning eller till förändring i den befintliga.
Cycliska peptider är en typ av peptidmolekyler som innehåller en sluten ringstruktur bildad genom kovalenta bindningar mellan deras aminosyrares sidokedjor, vilket ger dem en stabilare och mer kompakt konformation jämfört med linjära peptider, och de har viktiga biologiska funktioner som hormoner, neurotransmittorer och antimikrobiella agenter.
"Proteinbindning refererar till den process där ett protein binder specifikt till ett annat molekylärt substance, såsom en liten molekyl, ett annat protein eller en jon, vanligtvis genom non-kovalenta interaktioner som hydrogenbindning, Van der Waals-kräfter och elektrostatiska attraktioner. Denna bindning kan regulera funktionen hos det bundna substanceet och är av central betydelse för många biologiska processer, inklusive signaltransduktion, enzymsk aktivitet och transport av molekyler inom cellen."
'Panstrongylus' är ett släkte inom insektsfamiljen reduviider (Reduviidae), som inkluderar arter som kan vara vektorer för vissa parasitiska protozoer som orsakar sjukdomar hos djur och människor, såsom Chagas sjukdom hos människan som orsakas av *Trypanosoma cruzi*. Det är värt att notera att det inte finns någon medicinsk definition specifikt för släktet 'Panstrongylus', utan de medicinska aspekterna relaterar till vissa arter inom släktet och deras roll som vektorer för parasitiska sjukdomar.
"RNA (Ribonucleic acid) är ett ensträngat nucleotidmolekylt som fungerar som genetisk budbärare i celler, transportierande genetisk information från DNA till ribosomer under protein syntesprocessen."
Peptidkartläggning, även kallat peptidmappning, är en biokemisk metod som används för att bestämma aminosyrasequensen hos ett okänt peptidmolekyul genom att successivt bryta ned det i kortare fragment med hjälp av proteaser och sedan bestämma sekvensen av varje fragment genom till exempel Edman degradering eller masspektrometri.
Oligopeptider är korta peptidmolekyler bestående av två till tio aminosyror som är länkade till varandra via peptidbindningar. De bildas ofta genom proteolys, en nedbrytande process där proteiner splittras upp i mindre peptidfragment eller enskilda aminosyror. Oligopeptider har diverse funktioner inom levande organismers cellulära signalering och reglering av biologiska processer.
Tillförsel av molekyler av rekombinant DNA från prokaryota eller eukaryota källor till replikationsvektorer, så som plasmider eller virus, och införande av de härvid erhållna hybridmolekylerna i mottagarceller, utan att livsdugligheten hos dessa celler ändras.
En klass av sekvensbesläktade molekylära chaperoner i bakterier, mitokondrier och plastider. Chaperoniner är rikligt förekommande, grundläggande proteiner som ökar i mängd i samband med stresstillstån d, såsom värmechock, bakteriell infektion av makrofager och ökad cellulär mängd av oveckade proteiner. Bakteriella chaperoniner verkar som viktiga immunogener vid bakterieinfektioner hos människa pga sin anhopning under infektionsstress. Två av medlemmarna av denna chaperonklass är chaperonin 10 och chaperonin 60.
En elektroforesmetod där en andra elektrofores på en vinkelrät bana görs på de komponenter som separerats vid den första elektroforesen. Det vanliga mediet vid denna teknik är polyakrylamidgel.
Genetisk transkription är ett biologiskt process där DNA-sekvensen kopieras till en mRNA-sekvens (meddelande RNA) med hjälp av enzymet RNA-polymeras, vilket möjliggör syntesen av proteiner.
Läran om förloppsdynamik i kemiska och fysikaliska system.
HSC70, eller Heat Shock Cognate protein 70, är ett molekylärt chaperonprotein som hjälper till att korrekt folda och monteringsproteiner i cellen under normala förhållanden. När cellen utsätts för stress, såsom värmechock eller andra former av stresorförhållanden, ökar produktionen av HSC70-proteinet som en del av den cellulära stressresponsen. Dess främsta funktion är att hjälpa till att refolda eller bryta ned felaktigt foldeda proteiner som annars skulle kunna bli skadliga för cellen. HSC70-proteinet kan också spela en roll i proteinkvalitetskontroll, autofagi och presentation av antigen till immunsystemet.
Kardiogener chock definieras som ett tillstånd av plötslig och allvarlig hjärtfunktionsnedsättning, orsakad av strukturella eller elektriska störningar i hjärtat, vilket leder till att hjärtmuskeln inte kan pumpa blod effektivt. Detta kan resultera i ocksålt svalt blodflöde till kroppens vitala organ och kan vara livshotande om det inte behandlas akut.
Fysiologisk stress är ett svar på en real or perceived threat till homeostasen, orsakad av aktivering av det autonoma nervsystemet och hypotalamus-hypofys-binjure axeln, vilket leder till en ökning av hormoner som katekolaminer och glukokortikoider för att möjliggöra en anpassad fysisk respons.
I medicine refererer "cellinje" til en gruppe af celler med ensartet funktion og opbygning, der samarbejder for at udføre en specifik biologisk proces eller opgave i et levende organisme. Celliner er ofte specialiserede i deres struktur og funktion for at udføre deres rolle effektivt, og de kan findes i alle levende organismer, fra encellet bakterie til komplekse flercellede dyr og planter.