Cholestanetriol 26-Monooxygenase
Cholestanetriol 26-monooxygenase är ett enzym involverat i kolesterolmetabolismen. Det konverterar 5β-cholestantriol till 3α,7α,26-trihydroxicholestan-5-en, som är en intermediär i bilesyransyntesen. Defekter i detta enzym kan leda till ett sjukdomstillstånd kallat cerebrotendinös xantomatos, som kännetecknas av höga nivåer av kolesterolderivat i blodet och neurologiska symtom.
Oxygenaser
Hydroxylaser
En stor grupp enzymer som förmedlar oxidations-reduktionsreaktioner där en atom i en syremolekyl binds till det organiska substratet. Den reducerade syreatomen binds med väte och bildar vatten. Enzymerna kallas även monooxygenaser. Dessa reaktioner fordrar två substrat som reduktanter för var och en av de båda syreatomerna. Det finns olika klasser av enzymerna beroende på vilken typ av väteavgivande kosubstrat (koenzymer) som krävs för blandfunktionsoxidationen. EC 1.4 - 1.97.
Kynurenin-3-monooxygenas
Ett NADPH-beroende flavinmonooxygenas som har avgörande betydelse i tryptofankatabolismen, genom att katalysera hydroxyleringen av L-kynurenin till 3-hydroxi-L-kynurenin och NADP. EC 1.14.13.9.
Methylococcaceae
Methylococcus capsulatus
En art av Methylococcus som bildar kapslar och har förmåga till autotrof koldioxidfixering.
Cytokrom P-450
En stor grupp isoenzymer (hemproteiner) som utgör nyckelkomponenter i det flerfunktionsoxidassystem som dels ansvarar för biosyntesen av steroider, fettsyror och gallsyror, dels bioomvandlingen av många främmande föreningar till mutagena och cancerframkallande ämnen. De flesta däggdjur har ett flertal avlägset besläktade fenobarbitalinducerbara genunderfamiljer. De indelas efter sina sekvensöverensstämmelser snarare än efter sina funktioner i CYP-genfamiljer (>40% homologi) och underfamiljer (>59% homologi). CYP1-, CYP2- och CYP3-genfamiljerna står för större delen av läkemedelsmetabolismen. EC 1.13.-.
Methylosinus trichosporium
En art av Methylosinus som har förmågan att bryta ned trikloretylen och andra organiska miljögifter.
Kamfer-5-monooxygenas
Ett monooxygenas-hemtiolat (cytokrom P-450) med kamfer bundet till den aktiva platsen. Det verkar som slutmonooxygenas i d-kamfer-monooxygenassystemet, i, och katalysen sker i närvaro av putidaredoxin, putidaredoxinreduktas och molekylärt syre. Enzymet kodas av CAMC-genen och kallas även CYP101. Under anaeroba förhållanden reducerar detta enzym de polyhalogenerade föreningar som bundits till kamferbindningsstället. Det är dessutom det enda cytokrom P-450-enzymet med känd kristallstruktur. Det har kristalliserats ur bakterier. EC 1.14.15.1.
Nitrosomonas
'Nitrosomonas' är ett släkte av aerobiska, fria levnadsföringssättet bakterier som oxiderar ammoniak till nitrit under den biologiska nätsprocessen, vilket kallas nittogenes. Dessa bakterier spelar en viktig roll i kvävekretsloppet i miljön. (En: 'Nitrosomonas' is a genus of aerobic, free-living bacteria that oxidize ammonia to nitrite during the biological nitrogen cycle, a process called nitrification.)
Flavin-adenindinukleotid
Oxidation-reduktion
Alkan-1-monoxygenas
En alkan-1-monooxygenas är ett enzym som katalyserar oxidationen av alkaner till primära alkoholer med en molekyl syre och en reducerande koenzym, ofta NADPH eller NADH. Detta enzym spelar en viktig roll i biologisk oxidation av kolföreningar och finns hos både prokaryota och eukaryota organismer.
Pseudomonas
Pseudomonas är ett släkte gramnegativa, aeroba stavformade bakterier, vanligtvis icke-sporbildande, som förekommer vitt spridd i naturen, särskilt i fuktiga miljöer. Några arter av släktet Pseudomonas kan orsaka infektioner hos människor och djur, framför allt Pseudomonas aeruginosa, som är känd för sin förmåga att utveckla antibiotikaresistens och orsaka livshotande sjukdomar, särskilt hos immunförsvagna individer.
Biologisk nedbrytning
Bensydamin
1-bensyl-3-(3-dimetylamino)propoxi-1H-indazolmonohydroklorid. Ett smärtstillande, febernedsättande och antiinflammatoriskt medel som används för att minska postoperativa och posttraumatiska smärtor oc h ödem och påskynda läkning. Det används också lokalt för behandling av reumatiska åkommor och inflammationer i mun och svalj.
Tyrosin 3-monooxygenas
Tyrosin 3-monooxygenas, även känt som tyrosin hydroxylas, är ett enzym involverat i katekolaminernas syntes i kroppen. Det katalyserar den första steget i syntesen av katekolaminer, såsom dopamin, noradrenalin och adrenalin, genom att konvertera aminosyran tyrosin till L-DOPA (3,4-dihydroxifenylalanin) med hjälp av syre och NADPH som kofaktorer.
Skvalenmonooxidas
Hydroxylering
FMN-reduktas
Flavinmononukleotid-reduktas (FMN-reduktas) är ett enzym som reducerar Flavinmononukleotid (FMN) till Flavanodihydrogen (FH2) genom att transfera två väteatomer från NADPH till FMN.
NADPH-ferrihemoproteinreduktas
NADPH-ferrihemoproteinreduktase, även känt som NADPH-oxidoreduktas eller NOX, är ett enzym som överför elektroner från NADPH till ferrihemoproteiner och kan reducera dem till ferrohemoproteiner. Detta enzym spelar en viktig roll i cellers förmåga att generera reaktiva syremolekyler, såsom superoxidradikaler, som är involverade i olika fysiologiska processer, inklusive immunförsvar och signaltransduktion.
Amidinlyaser
Dessa enzym katalyserar elimineringen av ammoniak från amidiner, med bildande av en dubbelbindning. EC 4.3.2.
Multienzymkomplex
System av enzym som verkar i följd genom att katalysera på varandra följande reaktioner sammankopplade med gemensamma metabola intermediärer. De kan medverka i en enkel omsättning av vattenmolekyler eller väteatomer, eller vara förknippade med stora supramolekylära strukturer som mitokondrier eller ribosomer.
Flaviner
Flaviner är en grupp organiska föreningar som fungerar som prostetiska grupper inom flavoproteiner, vilka är involverade i biologiska oxidations-reduktionsprocesser. Flavinmononukleotid (FMN) och flavinadensindinukleotid (FAD) är två exempel på flaviner som spelar en viktig roll inom cellers metabolism, såsom i andningen och i nedbrytningen av fettsyror, kolhydrater och aminosyror.
Molekylsekvensdata
Oxidoreduktaser
Rhodococcus
'Rhodococcus' är ett släkte av grampositiva, aeroba och kokusbildande bakterier som förekommer i naturen, främst i jord och vatten. Några arter av Rhodococcus kan orsaka infektioner hos människor, särskilt hos immunsupprimerade individer. Infektioner kan vara subkliniska eller ge upphov till allvarliga sjukdomar som pneumonia, sepsis och abscesser.
Fenol
Trikloretylen
Toluen
Toluen, även känd som metylbensen, är ett aromatiskt kolväte som naturligt förekommer i petroleum och kolträsk. Det är en klar, färglös vätska med en distinkt söt doft som liknar bensin. Toluen används ofta som lösningsmedel inom industrin och kan också förekomma i små mängder i luften, vatten och mark efter utsläpp från industriella processer eller förbränning av fossila bränslen. Långvarig exponering för toluen kan orsaka skador på nervsystemet och andra hälsoproblem.
Levermikrosomer
Substratspecificitet
Substratspecificitet beteferrer sig inom farmakologi och enzymologi till den egenskap hos ett enzym eller en receptor där det endast binder till och katalyserar (eller påverkar) vissa specifika substanser, molekyler eller läkemedel, känt som substrat. Det innebär att en given enzymtyp endast är aktivt mot en begränsad grupp av kemiska föreningar som har en viss strukturell och kemisk likhet. Substratspecificiteten bestäms av enzymernas tredimensionella struktur och den del av substratmolekylen som interagerar med aktiva sitet på enzymet.
Methylocystaceae
Gramnegativa aeroba bakterier
Beijerinckiaceae
Beijerinckiaceae is a family of nitrogen-fixing bacteria within the order Rhizobiales. These bacteria are gram-negative, motile rods that can exist as free-living organisms in soil or as symbionts in root nodules of leguminous plants. They play a crucial role in the global nitrogen cycle by converting atmospheric nitrogen into ammonia, which is a form of nitrogen that plants can use for growth. Some notable genera within this family include Azorhizobium, Beijerinckia, and Methylocella.
Katalys
Pseudomonas putida
Alkaner
NADP
NADP, eller mer formellt NADP+ (nicotinamidadenindinukleotidfosfat), är ett viktigt koenzym i celler och spelar en central roll i cellers energihushållning och metabolism. Det är ett vattenlösligt koenzym som deltar i redoxreaktioner, det vill säga reaktioner där elektroner överförs mellan molekyler. NADP+ kan acceptera två elektroner och en proton (H+), vilket resulterar i att den reduceras till NADPH.
Oxidoreduktaser, O-demetylering
7-alkoxykumarin 0-dealkylas
Pseudomonas mendocina
Aminosyrasekvens
Dikloretylener
Acetylen
Pseudomonas stutzeri
Propan
Kloning, molekylär
Ammoniak
Aceton
En brandfarlig, färglös, flyktig vätska med behaglig eterisk doft. Den är ett allmänt använt lösningsmedel och används som sådant inom farmacin; vid koncentrationer över 80% används den som antiseptis kt medel. Aceton är ett av de ketonämnen som bildas vid ketoacidos, som i diabetes eller vid svält.
Koppar
Metalliskt grundämne, och tillika spårämne, med kemiskt tecken Cu, atomnummer 29 och atomvikt 63,55. Koppar ingår i hemocyanin, som är syrebärare hos de flesta leddjur.
Klorokinolinoler
8-hydroxikinolinoler, vars nr 5 och/eller 7-kolatomer klorinerats. De har antibakteriell, antiprotozo- och antidiarréverkan, särskilt vid amöbainfektion; även mot seborré har de använts. Preparaten används huvudsakligen lokalt, men också som tillsats i djurfoder. De kan orsaka syn- och andra nervstörningar och ges oftast i kombination med andra medel.
Syrgas
"Syrgas" er en sammentrekning av ordene "syre" og "luft", og refererer til den atmosfæriske luften som vi normalt inhalerer, som består av omkring 21% syre (O2), 78% kv nitrogen (N2) og små mengder av andre gasser som argon, kultilkristaller og spor av kullilkristaller. I denne enkelte meningen kan syrgas definieres som den atmosfæriske luft som inneholder 21% syre (O2) som er livsviktig for mennesker og andre levende vesen for å oksidere (forbranne) næringsstoffer for å produsere energi i cellene.
Tryptofanhydroxylas
Tryptophanhydroxylase är ett enzym involverat i serotoninsyntesen i kroppen. Det katalyserar den första och rate-limitierande reaktionen, nämligen omvandlingen av aminosyran tryptofan till 5-hydroxytryptofan (5-HTP). Serotonin är en signalsubstans som har betydelse för bland annat sömnbeteende, aptit och stämningsreglering.
Multigenfamilj
En uppsättning gener som genom mångfaldigande och variation härstammar från någon ursprunglig gen. Sådana gener kan sitta tillsammans på samma kromosom eller vara utspridda på olika kromosomer. Exempel på multigenfamiljer är de som kodar för hemoglobiner, immunglobuliner, histokompatibilitetsantigener, aktiner, tubuliner, keratiner, kollagener, stressproteiner, salivproteiner, korioproteiner, membranproteiner, ägguleproteiner och faseoliner, och även histoner, ribosom-RNA och tRNA-gener. De tre senare utgör exempel på upprepningsgener, av vilka det finns hundratals identiska i tandemformationer.
Epoxiföreningar
Glyceryletrar
Flavinmononukleotid
4-hydroxybensoat-3-monooxygenas
Bensoat-4-monooxygenas
Bensoaat-4-monooxygenas är ett enzym som katalyserar oxidationen av bensoaat (parakresol) till 4-hydroxibensoaat, vilket är en metabolit med potentialt giftverkan. Detta enzym finns naturligt i levern hos däggdjur och spelar därför en viktig roll i det metaboliska clearance av bensoaat från kroppen.
Kamfer
Alkansulfonater
Mikrosomer
Biotransformering
Kemisk förändring av en exogen substans i ett biologiskt system. Förändringen kan innebära en inaktivering av ämnet eller produktion av en aktiv metabolit från en inaktiv ursprungsförening. Omvandling en kan vara icke-syntetisk (oxidation-reduktion, hydrolys) eller syntetisk (glukuronidbildning, sulfatkonjugation, acetylering, metylering). Metabolisk detoxikation och eliminering räknas också hit.
Etionamid
Ralstonia
Ralstonia är ett släkte av gramnegativa, aeroba stavformade bakterier som tillhör ordningen Burkholderiales. Ralstonia-arter är vanligen motståndskraftiga mot antibiotika och kan orsaka opportunistiska infektioner hos människor med nedsatt immunförsvar, såsom patients som får lungtransplantationer eller hemodialys. Ralstonia-infektioner kan också förekomma i andra kliniska sammanhang, såsom infusionstherapi och vattenkylsystem.
Styren
Indigo Carmine
Testolakton
Testolactone is a medication that is used to treat breast cancer by reducing the amount of estrogen in the body. It works by blocking the production of estrogen in the body, which can help slow or stop the growth of hormone-sensitive tumors. Testolactone is an oral tablet and is typically taken several times a day. It may be used in combination with other treatments for breast cancer. It's important to note that Testolactone is not a commonly used medication, it has been largely replaced by other medications such as aromatase inhibitors.
Spektrofotometri
Metimazol
Enzyminduktion
Enzyminduktion refererar till processen där aktiviteten hos ett enzym ökar som ett resultat av exponering för en inducerande agent. Detta sker vanligtvis genom att induceringsagenten påverkar genuttrycket och/eller syntesen av enzymet, vilket leder till en ökad mängd fungerande enzym i cellen. Enzyminduktion kan ha kliniskt relevans inom områden som farmakologi och toxicologi, eftersom den kan påverka både farmakokinetiken och toxikokinetiken av olika substanser.
NAD
NAD (Nicotinamid Adenin Dinukleotid) är ett viktigt koenzym som deltar i flertalet biokemiska reaktioner inom kroppen, särskilt vid cellandningen där det hjälper till att konvertera energireserver i form av kolhydrater, fetter och protein till ATP (Adenosintrifosfat), som används som direkt energikälla i cellerna. NAD förekommer i två former: NAD+ (oxiderad form) och NADH (reducerad form). Vid cellandningen oxideras NADH tillbaka till NAD+, vilket genererar elektroner som driver den elektrontransportkedja som producerar ATP. Därutöver är NAD också inblandat i andra processer såsom DNA-reparation och cellulär signalering.
Kolväten, klorerade
Kolibakterie
Sekvenshomologi, aminosyra
Aminosyresekvenshomologi refererer til den grad af lighed i rækkefølgen af aminosyrerne, der udgør proteiner hos to eller flere organismer. Jo større antal identiske aminosyrer i samme position i de sammenlignede sekvenser, des højere er graden af homologi. Dette begreb anvendes ofte i molekylærbiologien for at fastslå evolutionæ forhold og funktionelle egenskaber hos proteiner.
Järn
Ett i jordskorpan allmänt utbrett metalliskt grundämne. Kemiskt tecken är Fe, atomnummer 26 och atomvikt 55,85. Järn är en väsentlig beståndsdel i hemoglobin, cytokrom och andra komponenter i respiratoriska enzymsystem. Dess främsta funktioner är att transportera syre till vävnader (hemoglobin) och att ingå i cellulära oxidationsförlopp. Uttömning av järnförråden kan leda till järnbristanemi. Järn används för att återuppbygga blodet vid anemi.
Bassekvens
Fenobarbital
DNA-sekvensanalys
Pyrogallol
Pyrogallol är ett organisk ämne som används inom laboratoriemedicin och forskning. Det är ett phenol med tre hydroxylgrupper (-OH) som är kemiskt reaktivt och används som reducerande agent i vissa typer av analytiska metoder, såsom oxdation-reduktionstester. Pyrogallol är även känt för att ha potentialen att vara irritant och senstizer för hud och slemhinnor.
Styrener
I en enkel medicinsk definition, är "styrener" en grupp av läkemedel som har en aktiv substans som kallas "styror." Styrener används främst för att behandla psykiatriska sjukdomar såsom schizofreni och bipolär sjukdom, då de hjälper till att minska symtomen på dessa tillstånd som hallucinationer, förvirring och aggressivitet. Styrener fungerar genom att blockera vissa signalsubstanser i hjärnan, såsom dopamin och serotonin, och på det sättet korrigera den onormala aktiviteten i hjärnan som orsakar psykotiska symtom.
Flavoproteiner
Flavoproteiner är proteiner som binder flavinmononukleotid (FMN) eller flavinadensindinukleotid (FAD), två former av vitamin B2. Dessa koenzymers fungerar som elektrontransportörer i en rad biologiska reaktioner, inklusive oxidation-reduktionreaktioner. Flavoproteiner deltar i ett brett spektra av cellulära processer, såsom aerobisk and respiration, fotosyntes och metabolismen av aminosyror, fettsyror och karbohydrater.
Fenylalaninhydroxylas
Arylkolvätehydroxylaser
En grupp cytokrom P-450-proteiner som utnyttjar reducerat flavin eller flavoprotein, till vilka de binder en syreatom. De verkar på många aromatiska föreningar och ingår i flerfunktionsoxidassystemet. Dessa enzym är viktiga för oxidationen av ett flertal läkemedel och toxiner, såsom fenobarbital, karcinogener och insektsgifter. EC 1.14.14.1.
Methanococcaceae
Methylococcus
Rekombinanta proteiner
Rekombinanta proteiner är proteiner som innehåller sekvenser från två eller flera olika källor, vanligtvis genom genetisk manipulation i laboratorium. Genom användning av rekombinant-DNA-teknik kan man kombinera gener från olika organismer för att skapa en ny gen som kodar för ett protein med önskade egenskaper. Detta är en viktig metod inom biomedicinsk forskning och används bland annat för produktion av läkemedel, diagnostiska verktyg och för studier av proteiner och deras funktioner.
Proadifen
Proadifen är ett äldre, icke-selektivt inhibitor medel som har använts för att blockera en grupp enzymer kallade monoaminoxidaser (MAO). Dessa enzymer hjälper till att bryta ned neurotransmittorerna i hjärnan, så om de hindras kan koncentrationen av dessa signalsubstanser öka. Proadifen har använts för behandling av depression och andra psykiatriska störningar, men på grund av sitt breda spektrum av verkan och potentialen för allvarliga biverkningar har det blivit ersatt av mer selektiva MAO-hämmare.
Antrakinoner
Norbornaner
I en enstaka mening kan "norbornaner" definieras som en grupp av organiska föreningar som har en norbornan-struktur, vilket innebär en kolkedja med två cyklohexanringar som är kopplade till varandra genom två kolatomers gemensamma bindning. Denna struktur ger upphov till en spännad ringform, vilket kan ge den kemiska föreningen unika egenskaper och reaktivitet. Detta grundstrukturelement är viktigt inom organisk kemi och har använts för att skapa en rad olika slags kemikalier och läkemedel.