Archéobactéries
Un des trois domaines de vie (et les autres étant bactéries connues et Eukarya), anciennement appelé archaebacteria sous le taxon Bactérie. Mais à présent considéré séparés et distincts. Se caractérisent par : (1) la présence de caractéristiques tRNAs et RNAS ribosomales ; (2) l ’ absence de paroi cellulaire peptidoglycane ; (3) la présence de ether-linked lipides construit de branched-chain sous-unités ; et (4) leur survenue dans d'étranges habitats. Pendant que archaea ressemblent à des bactéries dans la morphologie et organisation génomique ressemblent-ils à eukarya dans leur mode de la réplication génétique. Le domaine contient au moins quatre royaumes : CRENARCHAEOTA ; EURYARCHAEOTA ; NANOARCHAEOTA ; et KORARCHAEOTA.
Arn Archéal
Crenarchaeota
Régulation Expression Génique Archéal
Méthane
Methanococcus
Bactéries
Un des trois domaines de vie (et les autres étant Eukarya et Archaea), également appelé facteur D'unicellulaires Eubacteria. Ils sont généralement posséder micro-organismes présents dans la paroi des cellules rigide, multiplier par la division cellulaire, et présentent trois grandes formes : Ronde ou coccal, rodlike ou Bacillary, et - Torsadée ou spirochetal. Les bactéries peuvent être classés en fonction de leur réponse à oxygène : Aérobique, anaérobique, ou anaérobie Facultatively. À la mode par lesquels elles obtenir leur énergie : Chemotrophy (via réaction chimique) ou PHOTOTROPHY (via lumière réaction) ; pour chemotrophs par leur source d'énergie chimique : CHEMOLITHOTROPHY (de la matière minérale) ou chemoorganotrophy (de composés organiques), et par leur source pour CARBON ; azote ; etc. ; HETEROTROPHY (provenant de sources) organique ou AUTOTROPHY (de CARBON de titane). Ils peuvent aussi être classée par si oui ou non ils tachent (basée sur la structure de leur cellule murs) avec cristal VIOLET teinture : Gram ou les.
Sulfolobus
Un genre de l'aérobic. sa Chemolithotrophic coccoid Archaea, dont les organismes Sont thermoacidophilic. Ses cellules sont hautement de forme irrégulière, souvent, mais occasionnellement lobed sphérique. Il a une diffusion mondiale avec les organismes sols acides et de l'eau chaude. Soufre est utilisé comme source d'énergie.
Methanobacteriaceae
Données Séquence Moléculaire
Acide aminé, spécifique des descriptions de glucides, ou les séquences nucléotides apparues dans la littérature et / ou se déposent dans et maintenu par bases de données tels que la banque de gènes GenBank, européen (EMBL laboratoire de biologie moléculaire), la Fondation de Recherche Biomedical (NBRF) ou une autre séquence référentiels.
Euryarchaeota
Methanosarcina
Un genre de anaérobique, dont les organismes spheroid-shaped irrégulier METHANOSARCINALES nonmotile. Endospores ne sont pas formées. Ces archaea dériver l'énergie à la formation de méthane issu de acétate, méthanol, mono-, phosphate, et trimethylamine, et parfois, le monoxyde de carbone. Les organismes es isolée du milieu marin et d'eau douce.
Nitrification
Un processus facilitée par des bactéries impliquant l'oxydation du nitrate d'ammonium et de dérivé nitré.
Methanobacterium
Un genre de anaérobique, des bacilles METHANOBACTERIACEAE. Son organisme est nonmotile et utilise de l'ammoniaque comme l'unique source d'azote. Ces methanogens sont retrouvés dans les sédiments aquatiques, le sol, les eaux usées, et le tractus gastro-intestinal d'animaux.
Desulfurococcaceae
Une famille de archaebactéries, dans l'ordre DESULFUROCOCCALES Gram-positif anaérobie, composée de protéines, qui utilisent les peptides ou des hydrates de carbone Facultatively par soufre respiration ou fermentation. Il y a huit genera : AEROPYRUM, Desulfurococcus, Ignicoccus, Staphylothermus, Stetteria, Sulfophoboccus, Thermodiscus et Thermosphaera. (De Bergey est Manuel de la Bactériologie, Systematic 2d éditeur)
Methanosarcinales
Un ordre de methanogens anaérobies dans le royaume EURYARCHAEOTA. Il y a deux familles : METHANOSARCINACEAE et Methanosaetaceae.
Halobactériales
Un ordre de extrêmement halophilic archaebactéries, dans le royaume EURYARCHAEOTA ubiquitously. Ils apparaissent dans la nature où la concentration en sel est élevé, et sont chemoorganotrophic, en utilisant des acides aminés or des hydrates de carbone comme source de carbone.
Haloferax
Un genre de extrêmement halophilic HALOBACTERIACEAE chemoheterotropic et qui sont strictement aérobic. On les trouve dans l'environnement que saline neutre de lac salé (surtout la mer Morte) et salterns marine.
Pyrococcus
Un genre de strictement ultrathermophilic anaérobie archaebactéries, dans la famille THERMOCOCCACEAE, survenant chez chauffé seawaters. Ils montrent heterotrophic croissance à une température optimale de 100 ° C.
Sulfolobus Acidocaldarius
Une espèce de l'aérobic. sa Chemolithotrophic Archaea constitué de soufre coccoid cellules qui utiliser comme source d'énergie. La température optimale pour la croissance est de 70 à 75 ° C. Il es isolée du champs acide.
Arn Ribosomique 16S
Methanosarcinaceae
Une famille de METHANOSARCINALES anaérobie mesophilic ou dont les cellules sont thermophiles et apparaître comme irrégulier ou rengainées corps sphéroïde. Ces tiges methanogens sont présentés dans un environnement anaérobie aquatiques, y compris les sédiments des eaux usées et gastro-intestinale anaérobie digesters tracts. Il y a quatre types : METHANOSARCINA, Methanolobus, Methanothrix et Methanococcoides.
Pyrococcus Abyssi
Chromosome Archéen
Sulfolobus Solfataricus
Une espèce de thermoacidophilic Archaea dans la famille Sulfolobaceae volcanique, trouvé dans les zones où la température est à 26 degrés C et soufre.
Sédiment Géologique
Une masse de matière solide animés ou inanimés fragmentée, ou le gros fragment lui-même, qui vient de l'avoir affronté de roche et est porté par, suspendu dans bureau ou par air, eau, de la glace. Ça se réfère également à une masse qui accumulée par tout autre agent et naturel qui forme des couches en surface, comme sur le sable, gravier, de la boue, vase, remplis ou vite. (Dictionnaire de McGraw-Hill Terms scientifique et technique, 4e Ed, p1689)
Methanococcales
Un ordre de methanogens anaérobies dans le royaume EURYARCHAEOTA. Ils sont pseudosarcina, coccoid ou rengainées joue un bâtonnet et parahydroxybenzoate de groupes. La paroi cellulaire se compose de protéine. L'ordre inclut une famille, METHANOCOCCACEAE. (De manuel d'Bergey of Systemic la Bactériologie, 1989)
Archaeoglobus Fulgidus
Une espèce de extrêmement thermophiles, sulfur-reducing archaea. Il grandit à une température maximale de 35 degrés C. dans marin ou en zones géothermique.
Pyrococcus Furiosus
Evolution, Molecular
Thermococcus
Cellules Eucaryotes
Methanosarcina Barkeri
Halobacteriaceae
Une famille de extrêmement halophilic archaea trouvé dans des environnements avec le sel, tels que les concentrations de lac salé, évaporé saumure ou poisson salé. Halobacteriaceae sont soit obliger ou facultatif Aérobies et anaérobies sont divisés en au moins 26 genera incluant : HALOARCULA HALOBACTERIUM HALOCOCCUS HALOFERAX ; ; ; ; ; ; et HALORUBRUM NATRONOBACTERIUM NATRONOCOCCUS.
Ammoniac
Séquence Des Acides Aminés
Glyceryl Ethers
Eukaryota
Un des trois domaines de vie (et les autres étant bactéries connues et Archaea), également dénommés Eukarya. Ce sont des organismes dont les cellules sont enfermés dans les parties concernées et posséder un noyau. Ils contiennent presque tous multicellulaires et de nombreux organismes unicellulaires, et sont traditionnellement divises en groupes (parfois appelée royaumes) y compris animaux ; PLANTES ; champignons ; et divers taxa algue et d'autres qui étaient préalablement partie de l'ancien royaume des protistes.
Thermoplasma
Un genre de Facultatively heterotrophic anaérobie archaebactéries, dans l'ordre THERMOPLASMALES self-heating refuse de charbon, isolé de l'acide des piles et des sources chaudes. Ils sont thermophiles et peuvent faire pousser les deux avec et sans le soufre.
Alignement Séquences
L'arrangement de deux ou plusieurs séquences venant de base acide aminé ou un organisme ou organismes de manière à aligner zones séquences partager propriétés communes. Le degré de parenté entre les séquences ou homologie est prédite statistiquement impossible par ou sur la base de pondérations attribuées aux éléments alignés entre les séquences. Cette évolution peut constituer un indicateur potentiel de la parenté génétique entre les organismes.
Détermination Séquence Adn
Adn Ribosomique
Homologie Séquentielle Acides Aminés
Processus Autotrophes
Les processus par lequel utiliser simples organismes inorganique ou dissoutes gazeux substances, telles que le dioxyde de carbone et azote inorganique nutriment comme sources. Contraste avec heterotrophic processus qui procèdent de matériaux organiques comme le nutriment source. Autotrophes peut être soit chemoautotrophs (ou chemolithotrophs), essentiellement Archaea et bactéries connues, qui utilise aussi simple pour leur énergie substances inorganique reguirements photoautotrophs photolithotrophs ; ou (ou), tels que des plantes et cyanobactéries, qui tirent leur énergie de la lumière. Selon les conditions environnementales quelques organismes peuvent échanger entre différents modes nutritionnel (autotrophy ; HETEROTROPHY ; chemotrophy PHOTOTROPHY) ; ou d'utiliser différentes sources et nutritif pour satisfaire leurs besoins énergétiques.
Haloferax Mediterranei
Cellules Procaryotes
Thermoproteaceae
Une famille de THERMOPROTEALES constitué de longueur variable rigide barres sans Septa. Les géraniums poussent chemolithoautotrophically ou par le soufre la respiration. Les quatre types sont : PYROBACULUM ; THERMOPROTEUS ; Caldivirga ; et Thermocladium. (De Bergey est Manuel de la Bactériologie, Systematic 2d éditeur)
Halobacterium Salinarum
Séquence Nucléotidique
La séquence des purines et PYRIMIDINES dans les acides nucléiques et polynucleotides. On l'appelle aussi séquence nucléotidique.
Thermoplasmales
Un ordre de l'aérobic. sa thermophiles archaebactéries, dans le royaume EURYARCHAEOTA caractérisé par de l'absence d'une paroi cellulaire. Deux types ont été décrits : THERMOPLASMA et Picrophilus.
Transfert Génique Horizontal
La transmission d'information génétique naturelle entre organismes, apparentées ou non, en contournant parent-to-offspring transmission horizontal ? Transfert génique peut survenir via une variété de processus naturelle tels que GENETIC conjugaison ; GENETIC transduction ; et TRANSFECTION. Cela peut entraîner un changement du bénéficiaire organisme est composition génétique (transformation, GENETIC).
Methanobrevibacter
Un genre de, les anaérobies, Gram-positif à court de bâtonnet Archaea, dans la famille METHANOBACTERIACEAE, ordre METHANOBACTERIALES. Ils sont présentés dans le tube TRACT ou d'autres environnements anoxiques.
Protéines Bactériennes
Protéines trouvé dans aucune des espèces de bactéries.
Haloarcula Marismortui
Gènes Arn Ribosomal
Gènes, a trouvé dans les eukaryotes, qui sont des procaryotes et transcrit pour produire l'ARN qui est incorporée dans les ribosomes. Facteur D'ARNr gènes sont généralement pour OPERONS dispersées à travers le génome, tandis que les eukaryotes ARNr gènes sont groupées, multicistronic cascade unités.
Sulfolobale
Un ordre de CRENARCHAEOTA composée de aérobic ou Facultatively aérobic. sa Chemolithotrophic Gram-positif qui sont extrêmes, manquent thermoacidophiles peptidoglycane dans leur paroi cellulaire.
Oxidoréductases
La classe des enzymes réactions catalysant oxidoreduction. Le substrat c'est de l'oxyde est considérée comme une donneuse d'hydrogène systématique. Le nom est basée sur le donneur : Acceptor oxidoreductase recommandée nom sera déshydrogénase, où que cela soit possible ; comme alternative, réductase peut être utilisée. Oxydase est uniquement utilisé dans les cas où l'oxygène est la acceptor. (Enzyme nomenclature, 1992, pistolet)
Modèle Moléculaire
Microbiologie Eau
La présence de bactéries, virus, et des champignons dans l'eau. Ce terme n'est pas limitée aux organismes pathogènes.
Méthanomicrobiacées
Ecosystem
Archaeoglobus
Anaerobiose
Arn Transfert
Les petites molécules, 73-80 nucléotides ARN, cela marche pendant (traduction anglaise, GENETIC) s'alignent AMINO ACIDS au ribosomes dans une séquence déterminée par la mRNA (ARN, coursier). Il y a environ 30 différentes transfert RNAS. Chaque reconnaît un piège sur le codon spécifique mRNA et par ses propres ANTICODON aminoacyl tRNAs (ARN, VIREMENT, AMINO acyl), chaque porte un acide aminé spécifique au ribosome à ajouter à la faire allonger peptide chaînes.
Séquence Conservée
Salinity
Escherichia Coli
Une espèce de bêta-lactamases, Facultatively bactéries anaérobies, des bacilles (anaérobies à Gram-négatif) Facultatively tiges généralement trouvé dans la partie basse de l'intestin de les animaux à sang chaud. C'est habituellement nonpathogenic, mais certaines souches sont connues pour entraîner des infections pyogène. Pathogène DIARRHEA et souches (virotypes) sont classés par des mécanismes pathogène telles que Escherichia coli entérotoxinogène (toxines), etc.
Microbiologie Sol
La présence de bactéries, virus, et des champignons dans le sol. Ce terme n'est pas limitée aux organismes pathogènes.
Plancton
Communauté de minuscules plantes et animaux aquatiques et bactéries connues de photosynthèse, qui sont un peu ou suspendu dans l'eau, avec peu ou aucun pouvoir de déplacement. Ils sont divisés en phytoplancton et zooplancton.
Oxydoréduction
Une réaction chimique dans lequel une électron est transféré d'une molécule à l'autre. La molécule est le electron-donating réduisant agent ou electron-accepting reductant ; la molécule est l'agent oxydant ou oxydant. La réduction et le fonctionnement des agents oxydant reductant-oxidant conjugué paires ou redox paires (Lehninger, Principes de biochimie, 1982, p471).
Arn Bactérien
Ribosome Subunits, Large, Archaeal
Sulfolobaceae
Bioréacteur
Des outils ou les produits utilisant des appareils pour générer une conversion chimique synthétique ou la capacité d'un système biologique. Ils peuvent être fermentors classique, les cultures cellulaires, les systèmes de perfusion ou un enzyme bioréacteur. Pour la production de protéines ou enzymes, la technique de micro-organismes tels que des bactéries, des cellules de mammifères, ou les insectes ou cellules végétales sont généralement choisi.
Hot Temperature
Présence de chaleur ou de la chaleur ou de la température notablement plus élevés qu'un habitué norme.
Hydrothermal Vents
Des sources chaudes de l'océan. Ils sont souvent près de volcanically actif des endroits comme mid-oceanic crêtes.
Structure Tertiaire Protéine
Le niveau de structure protéique dans lesquels les associations de structures (protéine secondaire hélice alpha, bêta draps, boucle régions, et motifs) ensemble pour former plié formes appelé domaines : Disulfures des ponts entre cysteines dans deux différentes parties de la chaine polypeptidique avec autres interactions entre les chaînes jouer un rôle dans la formation et stabilisation des protéines habituellement tertiaire. Petite structure consistent en un seul domaine, mais plus grande protéines peut contenir un certain nombre de domaines liés par les segments de chaine polypeptidique peu structure secondaire habituel.
Proteobacteria
Une division de bactéries composé des bactéries violettes et leurs cousins qui forment une branche de l'arbre eubacterial. Ce groupe de guérilléros gram-négatives est classifiée basée sur l'homologie aux difficultées de séquences nucléotides ARN ribosomale 16S ou par hybridation de l ’ ARN ribosomal ou ADN et ARN ribosomale 23S avec 16S.
Adn Bactérien
L'acide désoxyribonucléique qui fait le matériel génétique des bactéries.
Pacific Ocean
The Pacific Ocean is a vast body of water that separates the continents of Asia and Australia from North and South America, and covers an extensive area of the Earth's surface with a depth ranging from shallow coastal areas to over 36,000 feet in its deepest point, the Mariana Trench.
Gènes Bactériens
The functional héréditaire unités de bactéries connues.
Deltaproteobacteria
Un groupe de Proteobacteria représenté par morphologiquement différents sulfidogens anaérobie. Certains membres de ce groupe sont considérés prédateurs bactérienne ayant bacteriolytic propriétés.
Soufre
Haloarcula
Un genre de HALOBACTERIACEAE distingue des autres types dans la famille par la présence de certains des dérivés du TGD-2 Haloarcula lipides. Polaires se trouvent dans l'environnement que saline neutre de lac salé et le sérum physiologique, marine salterns des sols.
Microbial Consortia
Sources Chaudes
Habitat d'eau chaude naturellement chauffée par des processus géologiques sous-jacente. Surface sources chaudes sont utilisées depuis BALNEOLOGY. Des sources thermales sous-marines sont appelés "hydrothermal VENTS.
Bacterial Physiological Phenomena
Processus physiologiques et propriétés de bactéries connues.
Bactéries Sulfato-Réductrices
Un groupe de bêta-lactamases. Les bactéries anaérobies, qui est capable d'acétate oxydent complètement en dioxyde de carbone en utilisant l'électron acceptor sulfure pendant que élémentaire.
Température
La propriété d'objets qui détermine la direction de chaleur coulent quand elles sont placées dans contact thermique direct. La température est de l'énergie de motions microscopiques et invariances transitionnelles) (vibration des particules d'atomes.
Clonage Moléculaire
Estuaries
Partiellement ci-joint une masse d'eau et la zone environnante habitats côtiers, où l'eau salée de l'océan se mélange avec de l'eau fraîche de rivières et ruisseaux. Le mélange qui en résulte d'eau de mer et d'eau fraîche s'appelle de l'eau saumâtre et ses la salinité unique de 0,5 à 35 ppt. (Accédé http : / / oceanservice.noaa.gov / éducation / kits / Estuaries / estuaries01 _ whatis.html)
Pyrococcus Horikoshii
Méthanomicrobiales
Un ordre de anaérobique, methanogens hautement spécialisée, au royaume EURYARCHAEOTA. Son organisme est nonmotile ou mobile avec des cellules occurring as coccoid corps, pseudosarcina ou tiges. Familles inclure METHANOMICROBIACEAE, Methanocorpusculaceae et Methanospirillaceae.
Pyrobaculum
Un genre de bâtonnet, rectangulaire presque Archaea, dans la famille THERMOPROTEACEAE. Organismes Sont Facultatively aérobie ou anaérobie ou juste, poussent sur différents substrats organique, et sont retrouvés dans solfataras continental.
Lakes
Cristallographie Rayons X
Thermoproteus
Un genre de anaérobie obligately Archaea, dans la famille THERMOPROTEACEAE. On les trouve à acide sources chaudes et les trous d'eau.
Aeropyrum
Un genre de anaérobique, chemolithotropic coccoid Archaea, dans la famille DESULFUROCOCCACEAE. Ils vivent en milieu marin.
Spécificité Espèce
Cette restriction d'une caractéristique, la structure anatomique de comportement ou système physique, tels que la réponse immunitaire métaboliques ; ou gène variante génétique ou aux membres d'une espèce... je veux parler de cette propriété qu'une seule espèce qui différencie d'un autre mais il est également utilisé pour augmenter ou diminuer les taux phylogénétique que l'espèce.
Conformation Acide Nucléique
Processus Hétérotrophes
Les processus par lequel les organismes substances organiques utiliser leurs sources. Contraste avec AUTOTROPHIC nutriment PROCESSUS inorganique qui procèdent de simples produits chimiques comme le nutriment source. Heterotrophs peut être soit chemoheterotrophs (ou chemoorganotrophs) qui requièrent également substances organiques comme du glucose pour leurs besoins énergétiques métabolique primaire ou photoheterotrophs (ou photoorganotrophs) qui tirent leur énergie primaire en vigueur de la lumière. Selon les conditions environnementales quelques organismes peuvent échanger entre différents modes nutritionnel (AUTOTROPHY ; heterotrophy ; chemotrophy PHOTOTROPHY) ; ou d'utiliser différentes sources de rencontrer leurs nutriments et besoins énergétiques.