Ribosomas
Estructuras con múltiples componentes que se encuentran en el CITOPPLASMA de todas las células, y en las MITOCONDRIAS y en los PLASTIDIOS. Desempeñan función en la BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS a través de la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Subunidades Ribosómicas Pequeñas de Archaea
Subunidad pequeña de los RIBOSOMAS arqueales. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 16S y de cerca de 28 diversas PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS.
Subunidades Ribosómicas Grandes de Archaea
Subunidad mayor del ribosoma 70S de archaea. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 23S, ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 40 diferentes PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS.
Subunidades Ribosómicas
Los dos complejos de ribonucleoproteína, de diferente tamaño, que constituyen un RIBOSOMA - la subunidad ribosómica mayor y la subunudad ribosómica menor. El ribosoma eucariótico de 80S está constituido por una subunidad mayor, de 60S, y una subunidad menor, de 40S. El ribosoma bacteriano de 70S está formado por una subunidad mayor, de 50S, y una subunidad menor, de 30S.
Subunidades Ribosómicas Grandes
El componente mayor de las ribonucleoproteínas de los RIBOSOMAS. Contiene los dominios que catalizan la formación del enlace del péptido y del desplazamiento del ribosoma a lo largo del ARN MENSAJERO durante la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Subunidades Ribosómicas Pequeñas
Componente pequeño de ribonucleoproteínas de los RIBOSOMAS. Contiene el sitio de unión del ARN MENSAJERO y dos sitios de unión para el ARN DE TRANSFERENCIA - uno para el AMINOACIL ARNt (sitio A) y el otro (sitio P) para el peptidil ARNt que porta la cadena peptídica de elongación.
Subunidades Ribosómicas Grandes Bacterianas
Subunidad mayor del ribosoma 70S de eubacterias. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 23S, ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 37 diferentes PROTEÍNAS RIBOSOMALES.
Subunidades Ribosómicas Pequeñas Bacterianas
Subunidad pequeña de los RIBOSOMAS de las eubacterias. Está formada por ARN RIBOSÓMICO 16S y alrededor de 23 PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS distintas.
Subunidades Ribosómicas Grandes de Eucariotas
Subunidad mayor del ribosoma 80s de eucariotas. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 28S, de ARN RIBOSÓMICO 5.8S, de ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 50 diferentes PROTEÍNAS RIBOSOMALES.
Subunidades Ribosómicas Pequeñas de Eucariotas
Subunidad menor de los ribosomas 80s de eucariotas. Está formada por ARN RIBOSÓMICO 18S y alrededor de 32 diferentes PROTEÍNAS RIBOSOMALES.
Células Eucariotas
Subunidades de Proteína
Cadenas simples de aminoácidos que son las unidades de PROTEÍNAS multiméricas. Estas pueden estar compuestas de subunidades iguales o no iguales. Una o mas subunidades monoméricas pueden componer un protómero, que a su vez es una subunidad de un conjunto mas amplio.
Proteínas Ribosómicas
Proteínas que se encuentran en los ribosomas. Se cree que tengan una función catalítica en la reconstrucción de las subunidades ribosomales biológicamente activas.
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
ARN Ribosómico
La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)
Secuencia de Aminoácidos
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Secuencia de Bases
ARN de Transferencia
Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.
Proteínas Inactivadoras de Ribosomas Tipo 1
Proteínas que inactivan ribosomas que consisten sólo de la subunidad tóxica A, que es un polipéptido de aproximadamente 30 kDa.
Saccharomyces cerevisiae
Iniciación de la Cadena Peptídica Traduccional
Proceso de TRADUCCIÓN GENÉTICA en el que se inicia la formación de una cadena peptídica. Incluye la reunión de los componentes de los RIBOSOMAS, la realización de la codificación del ARN MENSAJERO para el polipéptido, ARNT INICIADOR, FACTORES DE INICIACIÓN DE PÉPTIDOS y colocación del primer aminoácido en la cadena peptídica. Los detalles y componentes de este proceso son únicos en la biosintesis de las proteinas procarióticas y eucariótica.
Factores de Iniciación de Péptidos
Factores proteicos que sólo se requieren durante la fase de iniciación de la síntesis de proteínas en la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Extensión de la Cadena Peptídica de Translación
Proceso de TRADUCCIÓN GENÉTICA en el que un aminoácido se transfiere de su cognado ARN DE TRANSFERENCIA a la cadena extendida de PÉPTIDOS.
Conformación de Ácido Nucleico
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Sitios de Unión
Sustancias Macromoleculares
Compuestos y complejos moleculares consistentes en un gran número de átomos generalmente sobre 500 kD de tamaño. En los sistemas biológicos las substancias macromoleculares se pueden visualizar generalmente usando MICROSCOPIO ELECTRÓNICO y se distinguen de los ORGANELOS por la carencia de estructura membranosa.
Unión Proteica
Aminoacil-ARN de Transferencia
Intermediarios en la biosíntesis de proteínas. Los compuestos se forman a partir de aminoácidos, ATP y ARN de transferencia, una reacción catalizada por la aminoacil ARNt sintetasa. Son compuestos claves en el proceso de translación genética.
Factor 2 Eucariótico de Iniciación
Factor de iniciación eucariótico de la síntesis de proteínas. En los eucariotes superiores el factor está constituido por tres subunidades: alfa, beta y gamma. A medida que se produce la iniciación, el eIF-2 forma un complejo ternario con Met-ARNti y el GTP.
Factor G de Elongación Peptídica
El Factor G de Elongación Peptídica cataliza la translocación de peptidil-ARNt del sitio A hacia el sitio P de los ribosomas bacterianos, mediante un proceso vinculado a la hidrólisis de GTP a GDP.
Modelos Moleculares
Polirribosomas
Estructura multirribosómica que representa una secuencia lineal de RIBOSOMAS los cuales se mantienen unidos por el ARN MENSAJERO. Estos polirribosomas constituyen los complejos activos en la síntesis proteica celular y son capaces de incorporar los aminoácidos a los polipéptidos tanto in vivo como in vitro. (From Rieger, et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed).
ARN Bacteriano
Factor 4E Eucariótico de Iniciación
Factor de iniciación de péptidos que se une específicamente a CAPERUZAS DE ARN 5' del ARNM en el CITOPLASMA. Es un componente del complejo trimérico EIF4F.
Mutación
Puromicina
Factores de Elongación de Péptidos
Factores proteicos que sólo se requieren durante la fase de elongación de la síntesis de proteínas.
Poli U
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Factor 4G Eucariótico de Iniciación
Componente del factor 4F eucariótico de iniciación, que está implicado en interacciones múltiples de las proteínas en el lugar de iniciación de la translación. Puede tener una función en la reunión de varios factores de iniciación en el lugar de iniciación de la translación.
Homología de Secuencia de Aminoácido
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Eucariotas
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIAS y ARCHAEA), también llamado de Eukarya. Son organismos cuyas células están envueltas en membranas y poseen un núcleo. Comprenden casi todos los organismos unicelulares y muchos organismos pluricelulares. Tradicionalmente se dividen en grupos (a veces llamados reinos), incluyendo ANIMALES, PLANTAS, HONGOS, diferentes algas, y otros taxones que anteriormente formaban parte del antiguo reino Protista.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Factor 3 de Iniciación Eucariótica
Factor de iniciación eucariótico de múltiples subunidades que contiene por lo menos 8 polipéptidos distintos. Desempeña un papel en el reciclaje de subunidades ribosomales al sitio de iniciación de la transcripción mediante la promoción de la disociación de la no-traducción de subunidades ribosomales. También está implicado en la promoción de la unión de un complejo ternario de FACTOR 2 EUCARIÓTICO DE INICIACIÓN; GTP, y ARN DE TRANSFERENCIA DE METIONINA a las subunidades ribosomales 40S.
Factores Eucarióticos de Iniciación
Factores de iniciación del péptido de organismos eucariotas. Más de doce factores se involucran en la INICIACIÓN DE LA CADENA PEPTÍDICA TRADUCCIONAL en células eucarióticas. Muchos de esos factores tienen un papel en el control de la tasa de la TRADUCCIÓN DEL ARNM.
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Conformación Proteica
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Guanosina Trifosfato
Reticulocitos
ERITROCITOS inmaduros. En los seres humanos, estos son CÉLULAS ERITROIDES que apenas han sufrido la extrusión de su NÚCLEO CELULAR. Aún contienen algunas organelas que gradualmente disminuyen en número mientras las células maduran. Los RIBOSOMAS son los últimos en desaparecer. Ciertas técnicas de coloración hacen que los componentes de los ribosomas se precipiten en un "retículo" característico (no es lo mismo que el RETÍCULO ENDOPLÁSMICO)y por ello el nombre de reticulocitos.
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Regiones no Traducidas 5'
Secuencia en el extremo 5' del ARN mensajero que no codifica producto. Esta secuencia contiene el sitio de unión del ribosoma y otras secuencias que regulan la transcripción y la traducción.
Centrifugación por Gradiente de Densidad
Factor 2 de Elongación Peptídica
El Factor 2 de elongación peptídica cataliza la translocación de peptidil-ARNt del sitio A al sitio P de los ribosomas eucarióticos, mediante un proceso vinculado a la hidrólisis de GTP a GDP.
Factor 4F Eucariótico de Iniciación
Complejo del factor de iniciación péptido trimérico que se asocia con la estructura 5 cap ARNm del ARN (ARN CAPS) y juega un papel esencial en el ARNm TRADUCCIÓN. Se compone del FACTOR 4A EUCARIÓTICO DE INICIACIÓN; FACTOR 4E EUCARIÓTICO DE INICIACIÓN; y ACTOR 4G EUCARIÓTICO DE INICIACIÓN.
Codón Iniciador
Codón que dirige la iniciación de la translación de proteína (TRADUCCIÓN GENÉTICA) al estimular la unión del iniciador ARNt (ARN, DE TRANSFERENCIA, MET). En procariotes, los codones AUG o GUG pueden actuar como iniciadores, en tanto en eucariotes AUG es el único codón iniciador.
Codón
Conjunto de tres nucleótidos en una secuencia de codificación de proteínas que especifica los aminoácidos individuales o una señal de terminación (CODÓN DE TERMINACIÓN). La mayoría de los codones son universales, pero algunos organismos no producen los ARN DE TRANSFERENCIA complementarios para todos los codones. Estos codones se conocen como codones no asignados (CODÓN SIN SENTIDO).
Transcripción Genética
Microscopía por Crioelectrón
ARN Ribosómico 23S
Constituyente de la subunidad 50S de los ribosomas procarióticos que contienen alrededor de 3200 nucleótidos. El rARN 23S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
Terminación de la Cadena Péptídica Traduccional
Proceso de BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNA en el que el último aminoácido se añade al polipéptido extendido. Esta terminación está señalizada desde el ARN MENSAJERO, por uno de los tres codones de terminación (CODÓN DE TERMINACIÓN), inmediatamente después del último CODÓN especificador de aminoácido.
Biosíntesis de Péptidos
Producción de PÉPTIDOS o PROTEINAS por los constituyentes de un organismo vivo. La biosintesis de las proteinas en los RIBOSOMAS siguiendo un modelo de ARN se llama traducción (TRADUCCIÓN GENÉTICA). Hay otra biosíntesis de péptidos no ribosómica (BIOSINTESIS DE PÉPTIDOS, INDEPENDIENTES DE ÁCIDOS NUCLEICOS) que es llevada a cabo por PÉPTIDO SINTASAS y PEPTIDIL TRANSFERASAS. Modificaciones adicionales de las cadenas peptídicas producen moleculas funcionales de péptidos y proteinas.
Proteínas de Escherichia coli
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
Proteínas Recombinantes
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
ARN Ribosómico 18S
Constituyente de la subunidad 40S de los ribosomas de eucariotas. El rARN 18S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos en eucariotas.
ARN de Transferencia de Metionina
ARN de transferencia que es específico para transportar metionina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Codón de Terminación
Cualquier codón que da la señal de terminación de la TRADUCCIÓN GENÉTICA. Los FACTORES DE TERMINACIÓN DE PÉPTIDOS se unen al codon de terminación y desencadenan la hidrólisis del enlace aminoacilo que conecta el polipéptido terminado al ARNt. El codón de terminación no especifica aminoácidos.
Plásmidos
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Proteínas de Unión al ARN
Proteínas que se unen a moléculas de ARN. Están incluidas aquí las RIBONUCLEOPROTEÍNAS y otras proteínas cuya función es unirse especificamente al ARN.
Electroforesis en Gel de Poliacrilamida
Línea Celular
Sistema Libre de Células
Extracto celular fraccionado que mantiene una función biológica. Fracción subcelular aislada por ultracentrifugación u otro medio con el uso de técnicas de separación; primero debe estar aislado para que el proceso pueda estudiarse libre de todas las reacciones complejas que ocurren en una célula. El sistema libre de células, por tanto, se utiliza mucho en la biología celular.
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Factor Tu de Elongación Peptídica
Proteína que se encuentra en bacterias y en las mitocondrias de eucariotas, que entrega los aminoacil-ARNt al sitio A del ribosoma. El aminoacil-ARNt está primero enlazado a un complejo de factor Tu de elongación, que contiene una molécula de GTP enlazada. El complejo resultante entonces se enlaza al complejo de iniciación 70S. Simultáneamente, el GTP es hidrolizado y el complejo Tu-GDP es liberado del ribosoma 70S. El complejo Tu-GTP es regenerado a partir del complejo Tu-GDP por el factor Ts de elongación y GTP.
ARN de Hongos
Ácido ribonucleico de hongos que tienen función reguladora y catalítica así como participan en la síntesis de proteínas.
Evolución Molecular
ARN
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Nucléolo Celular
Región diferente, no delimitada por una membrana, que se encuentra dentro del NÚCLEO CELULAR de la mayoría de las células eucariotas, en el mismo se sintetizan algunas especies de ARNr (ARN RIBOSÓMICO) y se ensamblan con unidades de ribonucleoproteínas del ribosoma. En el nucléolo el ARNr se transcribe a partir de un organizador nucleolar, es decir, un grupo de genes cromosomales en línea que codifican al ARNr y que son transcriptos por la ARN polimerasa I.
Células HeLa
ARN Ribosómico 28S
Constituyente de la subunidad 60S de los ribosomas eucarióticos. El rARN 28S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos en eucariotas.
Proteínas Recombinantes de Fusión
Células Procariotas
Células que carecen de membrana nuclear y por tanto el material nuclear está diseminado en el citoplasma o acumulado en una región nucleoide.
Fenilalanina
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Caperuzas de ARN
Estructuras de ácido nucleico que se encuentran en el extremo 5' del ARN mensajero celular de eucariotes y de virus y de algunos ARN nucleares heterogéneos. Estas estructuras, que tienen carga positiva, protegen en sus sitios terminales a los ARNs especificados antes contra el ataque de fosfatasas y otras nucleasas y estimulan el funcionamiento del ARN mensajero en el inicio de la traducción. Los ANÁLOGOS DE CAPERUZA DE ARN, que no poseen carga positiva e inhiben la iniciación de la síntesis de proteínas.
Factor 1 Eucariótico de Iniciación
Factor de iniciación eucariótico que se une a las subunidades 40S ribosómicas. Aunque se considera inicialmente un factor "no esencial" para la iniciación de la transcripción eucariótica, ahora se cree que el factor 1 de iniciación eucariótico para jugar un papel importante en la localización de RIBOSOMAS en el codón de iniciación del ARNm.
Thermus thermophilus
Ricina
Factores de Terminación de Péptidos
Proteínas que participan en la reacción de terminación de la cadena peptídica (TERMINACIÓN DE LA CADENA PEPTÍDICA TRADUCCIONAL)de los RIBOSOMAS. Incluyen factores especificos de liberación de codón de clase I, que reconocen las señales de parada (CODÓN TERMINADOR) en el ARN MENSAJERO; y factores no especificos de liberación de codón de clase II.
Factor 1 de Elongación Peptídica
El factor 1 de elongación peptídica es una proteína con muchas subunidades, responsable del enlace dependiente de GTP, de los aminoacil-ARNt's a los ribosomas eucarióticos. La subunidad alfa (EF-1alfa) se une al aminoacil-ARNt y los transfiere al ribosoma, en un proceso vinculado a la hidrólisis del GTP. Las subunidades beta y delta (EF-1beta, EF-1delta) participan en la conversión de GDP a GTP. La subunidad gamma (EF-1gamma) es un componente estructural.
Cristalografía por Rayos X
Ribonucleasas
ARN de Transferencia de Fenilanina
ARN de transferencia que es específico para transportar fenilalanina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Citoplasma
Tioestreptona
Uno de los PÉPTIDOS CÍCLICOS del streptomyces que es activo contra las bacterias gram positivas. En veterinaria se ha usado en la mastitis causada por organismos gram negativos y en afecciones dermatológicas. ntibiótico que contiene un polipéptido aislado de una especie de Streptomyces en el suelo de Nuevo México. Parece ser altamente activo contra las bacterias gram-positivas. En la medicina veterinaria, la tiostreptona ha sido empleada en la mastitis provocada por organismos gram-negativos y en trastornos dermatológicos.
Factores de Elongación Enlazados a GTP Fosfohidrolasas
Factores que utilizan energía de la hidrólisis del GTP a GDP para la elongación de la cadena peptídica. EC 3.6.1.-.
Conejos
Microscopía Electrónica
Microscopía usando un haz de electrones, en lugar de luz, para visualizar la muestra, permitiendo de ese modo mucha mas ampliación. Las interacciones de los ELECTRONES con los materiales son usadas para proporcionar información acerca de la estructura fina del material. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN las reacciones de los electrones transmitidos a través del material forman una imagen. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE RASTREO un haz de electrones incide en un ángulo no normal sobre el material y la imagen es producida a partir de las reacciones que se dan sobre el plano del material.
Relación Estructura-Actividad
Proteínas
POLIPÉPTIDOS lineales sintetizados en los RIBOSOMAS y que ulteriormente pueden ser modificados, entrecruzados, divididos o unidos en proteinas complejas, con varias subunidades. La secuencia específica de AMINOÁCIDOS determina la forma que tomará el polipéptido durante el PLIEGUE DE PROTEINA.
Magnesio
Elemento metálico con el símbolo atómico Mg, número atômico 12 y masa atómica 24,31. Es importante para la actividad de muchas enzimas, especialmente las que están involucradas con la FOSFORILACIÓN OXIDATIVA.
Factor 4A Eucariótico de Iniciación
Componente del factor de iniciación eucariótico 4F, que es una ARN helicasa implicada en el desenrollamiento de la estructura secundaria de la REGIONES NO TRADUCIDAS 5' del ARNM. El desenrollamiento facilita la unión de la subunidad ribosómica 40S.
Procesamiento Postranscripcional del ARN
Modificación biológica postranscripcional de ARNs mensajeros, de transferencia o ribosómicos o sus precursores. Incluyen la ruptura, metilación, tiolación, isopentilación, formación de pseudoridina, alteraciones conformacionales y la asociación con proteínas ribosómicas.
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Aminoácidos
Compuestos orgánicos que generalmente contienen un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH). Veinte aminoácidos alfa son las subunidades que se polimerizan para formar proteínas.
Mutagénesis Sitio-Dirigida
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Péptidos
Miembros de la clase de compuestos formados por AMINOÁCIDOS unidos por enlaces peptídicos entre aminoácidos adyacentes en estructuras lineales, ramificadas o cíclicas. Los OLIGOPÉPTIDOS están compuestos por aproximadamente 2-12 aminoácidos. Los polipéptidos están compuestos por aproximadamente 13 o mas aminoácidos. Las PROTEINAS son polipéptidos lineales que normalmente son sintetizadas en los RIBOSOMAS.
Sistemas de Lectura Abierta
Secuencia de tripletes de nucleótidos sucesivos que son leidos como un CODÓN especificador de AMINOÁCIDOS y que comienza con un CODÓN INICIADOR y termina con un codón de parada (CODÓN TERMINADOR).
Especificidad de la Especie
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Especificidad por Sustrato
Fosforilación
Reactivos de Enlaces Cruzados
Reactivos con dos grupos reactivos, usualmente en extremos opuestos de la molécula, que son capaces de reaccionar y así formar puentes entre las cadenas laterales de los aminoácidos de las proteínas; las locaciones de las áreas naturalmente reactivas dentro de las proteínas pueden identificarse de esta forma; también pueden utilizarse para otras macromoléculas, como las glicoproteínas, ácidos nucleicos, u otros.
Peptidil Transferasas
Aciltransferasas que usan AMINOACIL ARNT como aminoácido donante en la formación de una unión peptídica. existen peptidil transferasas ribosómicas y no ribosómicas.
Proteínas de la Membrana
Proteínas que se encuentran en las membranas celulares e intracelulares. Están formadas por dos tipos, las proteínas periféricas y las integrales. Incluyen la mayoría de las enzimas asociadas con la membrana, proteínas antigénicas, proteínas transportadoras, y receptores de drogas, hormonas y lectinas.
Inhibidores de la Síntesis de la Proteína
Compuestos que inhiben la síntesis de proteínas. Generalmente son AGENTES ANTIBACTERIANOS o toxinas. El mecanismo de acción de la inhibición incluye la interrupción de la prolongación de la cadena peptídica, el bloqueo del sitio A de los ribosomas, la lectura errónea del código genético o el impedimiento de la unión de las cadenas laterales de los oligosacáridos con las glicoproteínas.
Anticodón
Conjunto secuencial de tres nucleótidos en el ARN DE TRANSFERENCIA, que interactúa con su secuencia complementaria en el ARN MENSAJERO, el CODÓN, durante el proceso de traducción en el ribosoma.
Plantas
Formas de vida multicelular, eucariótica del reino Plantae (sensu lato), comprende las VIRIDIPLANTAE, RHODOPHYTA y GLAUCOPHYTA, todas las cuales adquieren cloroplastos mediante endosimbiosis directa de las CIANOBACTERIAS. Se caracterizan por tener un modo de nutrición fundamentalmente fotosintético; crecimiento esencialmente ilimitado en regiones localizadas de división celular (MERISTEMO); la celulosa en el interior de las células les aporta rigidez; la ausencia de órganos de locomoción; ausencia de nervios y sistema sensorial; y una alteración de generaciones haploides y diploides.
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Fraccionamiento Celular
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Adenosina Trifosfatasas
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis del ATP. La reacción de hidrólisis usualmente es acoplada con otra función, tal como transportar Ca(2+) a través de la membana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca(2+), Mg(2+), aniones, H+, o ADN.
Retículo Endoplásmico
Sistema de cisternas en el CITOPLASMA de muchas células. En algunos lugares, el retículo endoplásmico es continuo con la membrana plasmática (MEMBRANA CELULAR) o la membrana externa de la cubierta nuclear. Si las superficies externas de las membranas del retículo endoplásmico están cubiertas con ribosomas, se dice que el retículo endoplásmico presenta una superficie rugosa (RETICULO ENDOPLASMICO ASPERO); si no es así se le denomina de superficie lisa (RETICULO ENDOPLASMICO LISO). (King & Stansfield, A Dictionary of Genetics, 4th ed)
Factor 2B Eucariótico de Iniciación
Factor de intercambio del nucleótido de guanina que actúa restaurando el FACTOR 2 EUCARIÓTICO DE INICIACIÓN a su forma de unión con GTP.
Proteínas Nucleares
Proteínas que se encuentran en los núcleos de las células. No se confunden con las NUCLEOPROTEÍINAS que son proteínas conjugadas con ácidos nucleicos, que no están necesariamente presentes en el núcleo.
Proteínas de Unión al ADN
Factor 5 Eucariótico de Iniciación
Factor de iniciación eucariótico que interacciona con el complejo de iniciación 40S y estimula la hidrolisis de la unión GTP. La hidrolisis de GTP provoca la liberación del FACTOR 2 EUCARIÓTICO DE INICIACIÓN y el FACTOR 3 EUCARIÓTICO DE INICIACIÓN desde la subunidad 40S y la unión subsiguiente de la subunidad cromosómica 80S al complejo 40S para formar el complejo de iniciación funcional 80S.
Dimerización
Complejos Multiproteicos
Complejos macromoleculares formados de la asociación de subunidades definidas de proteínas.
Transporte de Proteína
El proceso de movimiento de proteínas de un compartimiento celular (incluyendo extracelular) para otro por varias clasificaciones y mecanismos de transporte, tales como transporte de compuerta, desplazamiento de proteína y transporte vesicular.
Esparsomicina
Levaduras
Término general para hongos redondos unicelulares que se reproducen por brotes. Los hongos de los panaderos y cerveceros son el SACCHAROMYCES CEREVISIAE; la levadura terapéutica seca es LEVADURA, SECA.
Transfección
Incorporación de ADN desnudo o purificado dentro de las CÉLULAS, usualmente eucariotas. Es similar a la TRANSFORMACION BACTERIANA y se utiliza de forma rutinaria en las TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Precursores del ARN
Transcripciones de ARN del ADN que se encuentran en alguna etapa inconclusa de procesamiento post-transcripcional ( PROCESAMIENTO POSTRANSCRIPCIONAL DEL ARN ) necesarios para la función. Precursores de ARN pueden someterse a varias etapas del EMPALME DEL ARN durante el cual los enlaces fosfodiesterasas en los límites exón-intrón se escinden y se extraen los intrones. En consecuencia se forma un nuevo enlace entre los extremos de los exones. Resultantes de ARN maduros se pueden utilizar, por ejemplo, ARNm maduro (ARN MENSAJERO) se usa como una plantilla para la producción de proteínas.
Estructura Secundaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Temperatura Ambiental
Estructura Cuaternaria de Proteína
Forma tridimensional y ordenamiento característico de las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Ácido Fusídico
Membrana Celular
Membrana selectivamente permeable que contiene proteínas y lípidos y rodea el citoplasma de las células procariotas y eucariotas.
Modelos Genéticos
Cloranfenicol
Un antibiótico que fue por primera vez aislado de cultivos de Streptomyces venequelae in 1947 pero que es producido sintéticamente en la actualidad. Tiene una estructura relativamente simple y fue el primer antibiótico de amplio espectro que fue descubierto. Actúa interfiriendo con la síntesis bacteriana de proteínas y es principalmente un bacteriostático.
Archaea
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
Mitocondrias
Organelas semiautónomas que se reproducen por sí mismas y se presentan en el citoplasma de la mayoría de las células eucariotas, pero no en todas. Cada una está rodeada por una doble membrana limítrofe. La membrana interna presenta múltiples invaginaciones y sus proyecciones se denominan crestas. La mitocondria es el lugar de las reacciones de fosforilación oxidativa que dan lugar a la formación de ATP. Contienen RIBOSOMAS, varios ARN DE TRANSFERENCIA, SINTETASAS AMINOACIL-ARN T y factores de elongación y terminación. Las mitocondrias dependen de los genes del núcleo, de las células en que residen, para muchos ARN MENSAJEROS. Se cree que las mitocondrias se han originado a partir de bacterias aerobiass que establecieron una relación simbiótica con los protoeucariotas primitivos. (King & Stansfield, A Dictionary of Genetics, 4th ed)
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Regulación de la Expresión Génica
Cualquiera de los procesos por los cuales factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen en el control diferencial (inducción o represión), de la acción de genes a nivel de transcripción o traducción.
Endorribonucleasas
Familia de enzimas que catalizan la segmentación endonucléolítica del ARN. Incluye EC 3.1.26.-, EC 3.1.27.-, EC 3.1.30.- y EC 3.1.31.-.
Proteínas Portadoras
ADN Complementario
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
Genes Bacterianos
Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Bovinos
Animales bovinos domesticados del género Bos, que usualmente se mantienen en una granja o rancho y se utilizan para la producción de carne o productos lácteos o para trabajos pesados.
Secuencias de Aminoácidos
Componentes estructurales de proteínas, comunmente observados, formados por combinaciones simples de estructuras secundarias adyacentes. Una estructura comunmente observada puede estar compuesta por una SECUENCIA CONSERVADA que puede estar representada por una SECUENCIA DE CONSENSO.
Subunidades beta de la Proteína de Unión al GTP
Subunidades heterotriméricas de la proteína de unión al GTP que se asocian firmemente a las SUBUNIDADES GAMMA DE LA PROTEÍNA DE UNIÓN AL GTP. Se forma un dímero de subunidades beta y gamma cuando la SUBUNIDAD ALFA DE LA PROTEÍNA DE UNIÓN AL GTP se disocia del complejo heterotrimérico de la proteína de unión al GTP. El dímero beta-gamma puede desempeñar un papel importante en la transducción de señales al interactuar con diversos segundos mensajeros.
Cloroplastos
Cuerpos de inclusión de las células vegetales que contienen el pigmento fotosintético CLOROFILA, asociado con la membrana de los TILACOIDES. Los cloroplastos se encuentran en los tallos jóvenes y hojas de las plantas superiores. También se encuentran en algunas formas de FITOPLANCTON como la HAPTOPHYTA; DINOFLAGELADOS; DIATOMEAS; y CRPTÓFITAS.
Subunidades gamma de la Proteína de Unión al GTP
Subunidades de proteínas de unión al GTP heterotriméricas muy asociadas con SUBUNIDADES BETA DE PROTEINA DE UNIÓN AL GTP. Un dímero de subunidades beta y gamma se forma cuando la SUBUNIDAD ALFA DE PROTEINA DE UNIÓN A GTP se disocia del complejo heterotrimérico de proteínas de enlace a GTP. El dímero beta-gamma puede jugar un importante rol en la transducción de señal interactuando con una variedad de mensajeros secundarios.
Proteínas de Plantas
ARN Ribosómico 5.8S
Constituyente de la subunidad 60S de los ribosomas de eucariotes. El rARN 5.8S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos de eucariotas.
Ultracentrifugación
Procesamiento Proteico-Postraduccional
Cualquiera de las diversas modificaciones post-traduccionales de PÉPTIDOS o PROTEÍNAS catalizadas enzimáticamente en la célula de origen. Estas modificaciones comprenden la carboxilación, HIDROXILACIÓN, ACETILACIÓN, FOSFORILACIÓN, METILACIÓN, GLICOSILACIÓN, ubiquitinación, oxidación, proteólisis y formación de enlaces cruzados y dan lugar a cambios en el peso molecular y en la motilidad electroforética.
Viomicina
Un complejo antibiótico fuertemente básico, derivado de varias cepas de Streptomyces. Es alergénico y tóxico para los riñones y el laberinto. La viomicina se emplea en la tuberculosis como diferentes sales y en combinación con otros agentes.
Dominio Catalítico
Mutagénesis
Proceso de generación de una MUTACIÓN genética. Puede darse espontáneamente o ser inducida por MUTÁGENOS.
Proteínas Quinasas
Catálisis
Eliminación de Gen
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Chaperones Moleculares
Familia de proteínas celulares que median en la correcta conformación o desmontaje de polipéptidos y sus ligandos asociados. A pesar de que participan en el proceso de ensamblaje las chaperonas moleculares no son componentes de las estructuras finales.
Regulación Fúngica de la Expresión Génica
Adenosina Trifosfato
Guanosina Difosfato
Multimerización de Proteína
El montaje de la ESTRUCTURA CUATERNARIA DE PROTEÍNA de las proteínas multiméricas (COMPLEJOS MULTIPROTEÍNAS) desde sus compuestos de las SUBUNIDADES DE PROTEÍNA.
Western Blotting
Bacterias
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son Eukarya y ARCHAEA), también llamado Eubacteria. Son microorganismos procarióticos unicelulares que generalmente poseen paredes celulares rígidas, se multiplican por división celular y muestran tres formas principales: redonda o cocos, bastones o bacilos y espiral o espiroquetas. Las bacterias pueden clasificarse por su respuesta al OXÍGENO: aerobias, anaerobias o facultativamente anaerobias; por su modo de obtener su energía: quimiotróficas (mediante reacción química) o fototróficas (mediante reacción luminosa); las quimiotróficas por su fuente de energía química: litotróficas (a partir de compuestos inorgánicos) u organotróficas (a partir de compuestos orgánicos); y por donde obtienen su CARBONO: heterotróficas (de fuentes orgánicas)o autotróficas (a partir del DIÓXIDO DE CARBONO). También pueden ser clasificadas según tiñan o no(basado en la estructura de su PARED CELULAR) con tintura VIOLETA CRISTAL: gramnegativa o grampositiva.
Sistema de Lectura Ribosómico
Alteración dirigida en los SISTEMAS DE LECTURA de traducción, que permite la producción de una proteína única a partir de dos o más GENES SOBREPUESTOS. El proceso es programado por la secuencia de nucleótidos del ARNm y a veces también es afectado por la estructura secundaria o terciaria del ARNm. Ha sido descrito principalmente en VIRUS (especialmente en los RETROVIRUS), RETROTRANSPOSONES y en elementos de inserción bacteriana, aunque también en algunos genes celulares.
Complejos Multienzimáticos
Sistemas de enzimas que funcionan secuencialmente, catalizando reacciones consecutivas conectadas por intermediarios metabólicos comunes. Pueden implicar simplemente una transferencia moléculas de agua o de átomos de hidrógeno o estar asociadas a grandes estructuras supramoleculares, como la MITOCONDRIA o los RIBOSOMAS.
Expresión Génica
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Proteínas de Unión al GTP
Proteínas reguladoras que actúan como interruptores moleculares. Controlan una vasta gama de procesos biológicos, que incluyen: señalización del receptor, vías de transducción de señal intracelular y síntesis protéica. Su actividad es regulada por los factores que controlan su capacidad de unirse e hidrolizar el GTP a GDP. EC 3.6.1.-.
Genes
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Fragmentos de Péptidos
Proteínas parciales formadas por hidrólisis parcial de proteínas o generadas a través de técnicas de INGENIERÍA DE PROTEÍNAS.
Transducción de Señal
La transferencia de información intracelular (biológica activación / inhibición), a través de una vía de transducción de señal. En cada sistema de transducción de señal, una señal de activación / inhibición de una molécula biológicamente activa (hormona, neurotransmisor) es mediada por el acoplamiento de un receptor / enzima a un sistema de segundo mensajería o a un canal iónico. La transducción de señal desempeña un papel importante en la activación de funciones celulares, diferenciación celular y proliferación celular. Ejemplos de los sistemas de transducción de señal son el sistema del canal de íon calcio del receptor post sináptico ÁCIDO GAMMA-AMINOBUTÍRICO, la vía de activación de las células T mediada por receptor, y la activación de fosfolipases mediada por receptor. Estos, más la despolarización de la membrana o liberación intracelular de calcio incluyen activación de funciones citotóxicas en granulocitos y la potenciación sináptica de la activación de la proteína quinasa. Algunas vías de transducción de señales pueden ser parte de una vía más grande de transducción de señales.
Hígado
Tritio
Prueba de Complementación Genética
Estabilidad del ARN
Grado en el que una molécula de ARN retiene la integridad estructural y resiste a la degradación por ARNasas y a HIDRÓLISIS catalizada por base, bajo condiciones variables in vivo o in vitro.
Triticum
Género de plantas de la familia POACEAE es la fuente de GRANOS COMESTIBLES. Un híbrido con Centeno (SECALE CEREALE) es llamado TRITICALE. La semilla se muele en HARINA y se utiliza para hacer PAN, y es la fuente de AGLUTININAS DEL GERMEN DE TRIGO.
Complejo de la Endopetidasa Proteasomal
Un gran complejo multisubunidades que juega un importante rol en la degradación de la mayoría de las proteínas citosólicas y nucleares en células eucariotas. Contiene un sub-complejo catalítico 700-kDa y dos sub-complejos regulatorios 700-kDa. El complejo condensa proteínas ubiquitarias y proteínas activadas vía entienzima ornitina decarboxilasa.