Proteínas de Unión al ADN
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Secuencia de Bases
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
ADN de Cadena Simple
Sitios de Unión
Secuencia de Aminoácidos
Unión Proteica
Regiones Promotoras Genéticas
Transcripción Genética
Secuencias Hélice-Giro-Hélice
Primer motivo proteico reconocido que se une al ADN. Los motivos de hélice-giro-hélice fueron identificados originalmente en las proteínas bacterianas, pero desde entonces se han hallado en cientos de PROTEINAS QUE SE UNEN AL ADN tanto de eucariotas como de procariotas. Estan formados por dos alfa hélices conectadas por una corta cadena extendida de aminoácidos que constituye el "giro". Las dos hélices se mantienen en un ángulo fijo, ante todo mediante interacciones entre las dos hélices.
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
Dedos de Zinc
Motivos de las proteínas que se unen al ADN y al ARN cuyos aminoácidos se pliegan en una sola unidad estructural alrededor de un átomo de zinc. En el dedo de zinc clásico, un átomo de zinc se encuentra unido a dos cisteínas y dos histidinas. Entre las cisteínas y las histidinas hay 12 residuos que forman una yema de dedo que se une al ADN. Por variaciones en la composición de las secuencias de la yema de dedo y el número y espaciado de las repeticiones en tándem del motivo, los dedos de zinc pueden formar un gran número de sitios específicos de unión con diferente secuencia.
Proteínas Nucleares
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Replicación del ADN
Los procesos mediante los cuales las dos cadenas de la doble hélice del ADN se separan, permitiendo que cada cadena actúe como plantilla para la síntesis de una cadena complementaria mediante el pareamiento de bases específicas. Comprende la replicación autónoma pero no la REPLICACION VIRAL.
ADN Helicasas
Proteínas que catalizan la reversión del dúplex de ADN durante la replicación mediante la unión cooperativa para las regiones de cadena simple de ADN o para las regiones cortas de ADN dúplex que están experimentando apertura transitoria. Además las helicasas ADN son ATPasas dependientes de ADN que aprovechan la energía libre de la hidrólisis de ATP para trasladar los filamentos de ADN.
Mutación
Plásmidos
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Homología de Secuencia de Aminoácido
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Transactivadores
Productos genéticos difusibles que actúan sobre moléculas homólogas o heterólogas de ADN viral o celular para regular la expresión de proteínas.
Oligodesoxirribonucleótidos
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Línea Celular
Células HeLa
Proteinopatías TDP-43
Enfermedades caracterizadas por la anormal presencia proteínas TDP-43 de enlace a ADN divididas, fosforiladas, ubiquitinadas, en el encéfalo y médula espinal afectada. Las inclusiones de la proteína patológica en las neuronas y células gliales, sin la presencia de AMILOIDE, es la característica principal de estas afecciones, haciendo de estas proteinopatías distintas a los otros trastornos neurodegenerativos en los que la mayoría de las proteínas mal plegadas conducen a amiloidosis cerebral. Tanto la degeneración frontotemporal y ESCLEROSIS MIOTRÓFICA LATERAL exhiben un modo común de patogénesis y por lo tanto pueden representar los dos extremos de un espectro clínico-patológico continuo de una enfermedad.
Ensayo de Cambio de Movilidad Electroforética
Técnica electroforética para identificación de ligaciones de un compuesto al otro. Márcase un compuesto para seguir su movilidad durante la electrofóresis. Si el compuesto marcado presentarse unido a un otro compuesto, entonces la movilidad del compuesto marcado por el medio electroforético será retardada.
Proteínas Recombinantes de Fusión
Regulación de la Expresión Génica
Cualquiera de los procesos por los cuales factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen en el control diferencial (inducción o represión), de la acción de genes a nivel de transcripción o traducción.
Activación Transcripcional
Proteína 1 de Unión a la Caja Y
Proteína de Replicación A
Proteína de unión al ADN monocatenario, que está presente en las CÉLULAS EUCARIOTAS. Esta proteína es necesaria para la REPLICACIÓN DEL ADN, la REPARACIÓN DEL ADN y la RECOMBINACIÓN GENÉTICA.
Desoxirribonucleasa I
Enzima que es capaz de hidrolizar el ADN altamente polimerizado quebrando los enlaces fosfodiéster, preferencialmente adyacentes a un nucleótido de pirimidina. Cataliza la segmentación endonucleolítica del ADN dando lugar a los productos finales 5'-fosfodi- y oligonucleótido. La enzima tiene preferencia por el ADN de cadena doble. EC 3.1.21.1 (anteriormente EC 3.1.4.5).
Modelos Moleculares
Factores de Transcripción NFI
Factores de transcripción originalmente identificados como proteínas de unión al ADN específicas de sitios, esenciales para la REPLICACIÓN DEL ADN en los ADENOVIRUS. Son importantes para el desarrollo y el funcionamiento de la GLÁNDULA MAMARIA.
Conformación de Ácido Nucleico
Sondas de Oligonucleótidos
Oligonucleótidos sintéticos o naturales utilizados en estudios de hibridización con el propósito de identificar y estudiar fragmentos específicos de ácidos nucleicos, ejemplo, segmentos de ADN cercanos o que están dentro de locus específicos del gen o de genes. La sonda hibridiza con un ARNm específico, si está presente. Las técnicas convencionales utilizadas para evaluar el producto de hibridización incluyen el ensayo de dot blot, ensayo de Southern blot, y las pruebas de anticuerpos específicos de híbridos de ADN:ARN. Las marcas convencionales para la sonda incluyen el marcaje con radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina.
Secuencias Reguladoras de Ácidos Nucleicos
Secuencias de ácido nucléico que intervienen en la regulación de la expresión de genes.
Degeneración Lobar Frontotemporal
Grupo heterogéneo de trastornos neurodegenerativos caracterizados por atrofia del lóbulo temporal y frontal asociada a pérdida neuronal, gliosis, y demencia. Los pacientes exhiben cambios progresivos en su vida social, comportamiento y / o en las funciones del lenguaje. Muchos subtipos o formas se reconocen en base a la presencia o ausencia de inclusiones de la PROTEÍNA TAU. Las FTLD incluyen tres síndromes clínicos: DEMENCIA FRONTOTEMPORAL, demencia semántica y AFASIA NO FLUENTE PROGRESIVA PRIMARIA.
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Secuencia de Consenso
Secuencia teórica de nucleótidos o aminoácidos en la cual cada nucleótido o aminoácido es él que se presenta más frecuentemente en ese sitio en las diferentes secuencias que ocurren en la naturaleza. La frase tambien se refiere a una secuencia real que se aproxima al consenso teórico. Un grupo de secuencias conservadas conocidas es representado por una secuencia de consenso. Las estructuras proteicas supersecundarias comúnmente observadas (MOTIVOS DE AMINOÁCIDOS) están frecuentemente formadas por secuencias conservadas.
Elementos de Facilitación Genéticos
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Mapeo Restrictivo
Proteínas Recombinantes
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Oligonucleótidos
Polímero constituido por pocos nucleótidos (de 2 a 20). En genética molecular, secuencia pequeña sintetizada para igualar a una región donde se sabe que ocurre una mutación y luego usada como detector (SONDA DE OLIGONUCLEÓTIDO). (Dorland, 28a ed)
Huella de ADN
Método para determinar la especificidad de secuencia de las proteínas que enlazan con el ADN. La dermatoglifia del ADN utiliza un agente que daña el ADN (ya sea un reactivo químico o una nucleasa) que rompe el ADN en cada par de bases. La ruptura del ADN es inhibida donde el ligando enlaza con el ADN.
Conformación Proteica
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Saccharomyces cerevisiae
Adenovirus Humanos
Las especies del género MASTADENOVIRUS, que causa una amplia gama de enfermedades en los seres humanos. Las infecciones son principalmente asintomáticas, pero pueden estar asociados con las enfermedades de los aparatos respiratorio, ocular y gastrointestinales. Los serotipos (nombres con números arábigos) se han agrupado en las especies designadas adenovirus humano A-F.
Cromatografía de Afinidad
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Regiones Operadoras Genéticas
Proteínas de Escherichia coli
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
ADN Polimerasa Dirigida por ADN
ADN polimerasas dependientes de ADN, que se encuentran en bacterias, animales y vegetales. Durante el proceso de replicación, estas enzimas catalizan la adición de residuos de desoxirribonucleótidos al extremo de una cadena de ADN en presencia de ADN como modelo-iniciador. También poseen actividad exonucleasa y por lo tanto funcionan en la reparación del ADN.
Dimerización
Proteínas del Grupo de Alta Movilidad
Transfección
Incorporación de ADN desnudo o purificado dentro de las CÉLULAS, usualmente eucariotas. Es similar a la TRANSFORMACION BACTERIANA y se utiliza de forma rutinaria en las TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
Leucina Zippers
Motivos que se unen al ADN formados por dos alfa hélices que se entrelazan durante 8 giros en una espiral enrollada y luego se bifurcan para formar unas estructuras en forma de Y. Las leucinas que ocurren en repeticiones heptádicas terminan en los mismos lados de las hélices y son adyacentes unas a otras en el tronco de la Y (la región "zipper"). Los residuos que se unen al ADN se encuentran en la región bifurcada de la Y.
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Genes Reguladores
Genes que regulan o circunscriben la actividad de otros genes, específicamente genes que codifican para PROTEINAS o ARNs, que tienen funciones de REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA.
Unión Competitiva
Electroforesis en Gel de Poliacrilamida
Proteínas E2 de Adenovirus
Proteínas que se transcriben a partir de la región E2 de los adenovirus (ADENOVIRIDAE). Varias de ellas son necesarias para la replicación del ADN viral.
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Simplexvirus
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Proteínas de Homeodominio
Proteínas que se codifican por los genes "homeobox" (GENES, HOMEOBOX) que muestran similitud estructural con ciertas proteínas unidas al ADN de procariotes y eucariotes. Las proteínas del homeodominio participan en el control de la expresión genética durante la morfogénesis y el desarrollo (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN DEL GEN, DESARROLLO).
Proteínas Potenciadoras de Unión a CCAAT
Una clase de proteínas que fueron originariamente identificadas por su habilidad de ligarse a la secuencia de CCAAT del ADN. La proteína potenciadora de unión a CCAAT típica forma dímeros y consiste de un dominio de activación, una región básica de unión a ADN, y un dominio de dimerización rico en leucina (LEUCINA ZIPPERS). FACTOR DE ENLACE A CCAAT es estructuralmente un tipo distinto de proteína potenciadora de unión a CCAAT que consiste de un trímero de tres diferentes subunidades.
Secuencias Repetitivas de Ácidos Nucleicos
Secuencias de ADN o ARN que se producen en múltiples copias. Existen varios tipos: SECUENCIAS REPETITIVAS ESPARCIDAS son copias de elementos transponibles (ELEMENTOS TRANSPONIBLES DE ADN o RETROELEMENTOS) dispersos a través del genoma. Las SECUENCIAS REPETIDAS TERMINALES flanquean ambos extremos de una otra secuencia, por ejemplo, las repeticiones terminales largas (LTRs) en los RETROVIRUS. Las variaciones pueden ser repeticiones directas, ocurriendo en la misma dirección, o repeticiones invertidas, en dirección opuesta a cada una. Las SECUENCIAS REPETIDAS EN TANDEM son copias que se encuentran adyacentes unos a otros, directas o invertidas (SECUENCIAS REPETIDAS INVERTIDAS).
Southwestern Blotting
Método que se utiliza para detectar interacciones entre ADN-proteína. Las proteínas se separaron por electroforesis y se transfieren a una membrana de nitrocelulosa similar a WESTERN BLOTTING, pero las proteínas son identificados cuando se las unen sondas de ADN marcadas (como en el SOUTHERN BLOTTING) en lugar de anticuerpos.
Sustancias Macromoleculares
Compuestos y complejos moleculares consistentes en un gran número de átomos generalmente sobre 500 kD de tamaño. En los sistemas biológicos las substancias macromoleculares se pueden visualizar generalmente usando MICROSCOPIO ELECTRÓNICO y se distinguen de los ORGANELOS por la carencia de estructura membranosa.
Proteínas Portadoras
Prueba de Complementación Genética
Mutagénesis Sitio-Dirigida
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Proteínas Proto-Oncogénicas c-myb
Proteínas celulares, que se unen al ADN, y que son codificadas por el gen myb (GENES, MYB). Ellas se expresan en una gran variedad de células entre las que se incluyen los timocitos y linfocitos, y regulan la diferenciación celular. La sobrexpresión del myb se asocia con enfermedades autoinmunes y malignas.
Eliminación de Secuencia
ADN Primasa
Bacteriófago T7
Bacteriófago virulento y especie típica del género Fago T7-Semejante, en la familia PODOVIRIDAE, que infecta a la E. coli. Está constituido por ADN de doble hebra, terminalmente redundante, y no permutada.
Factores de Transcripción con Cremalleras de Leucina de Carácter Básico
Gran superfamilia de factores de transcripción que contienen una región rica en residuos de AMINOÁCIDOS BÁSICOS seguida por un dominio CREMALLERA DE LEUCINAS.
Cromatina
El material de los CROMOSOMAS. Es un complejo del ADN, HISTONAS y proteinas no histona (PROTEÍNAS CROMOSÓMICAS NO HISTONA)que se encuentran dentro del núcleo celular.
Rayos Ultravioleta
La parte del espectro electromagnético que está inmediatamente debajo del rango visible y se extiende hasta las frecuencias de rayos x. Las longitudes de ondas más largas (rayos cercanos a UV, o bióticos, o vitales) son necesarias para la síntesis endógena de la vitamina D y también son conocidos como rayos antirraquíticos; las longitudes de onda más cortas, ionizantes, (rayos lejanos de UV, o abióticos, o extravitales) son viricidas, bactericidas, mutagénicos y carcinogénicos y se emplean como desinfectantes.
Proteínas de Drosophila
Proteínas que se originan en especies de insectos pertenecientes al género DROSOPHILA. Las proteínas de la especie mas estudiada de la drosophila, la DROSOPHILA MELANOGASTER, son las que mas interés tienen en el área de la MORFOGÉNESIS y el desarrollo.
Rec A Recombinasas
Familia de recombinasas identificadas inicialmente en las BACTERIAS. Catalizan el intercambio de cadenas del ADN conducido por el ATP en la RECOMBINACIÓN GENÉTICA. El producto de la reacción consiste en un duplex y un asa de cadena simple desplazada, que tiene la forma de la letra D, razón por la que se denomina como una estructura en asa D.
Factores de Integración del Huésped
Proteinas bacterianas utilizadas por BACTERIÓFAGOS para incorporar su ADN dentro del ADN de la bacteria "huesped". Hay proteinas unidas al ADN que actúan en recombinación genética así como en la regulación de la transcripción y la trazducción.
Secuencia Rica en At
Desoxirribonucleoproteínas
Sondas de ADN
ADN específico de especies o subespecies (incluyendo ADN COMPLEMENTARIO; genes conservados, cromosomas enteros, o genomas enteros) utilizado en estudios de hibridación con el fin de identificar los microorganismos, para medir homologías ADN-ADN, agrupar subespecies, etc. La sonda de ADN se hibrida con un ARNm específico, si está presente. Entre las técnicas convencionales que se utilizan para determinar el producto de hibridación se encuentran ensayos de "dot blot" (o inmunotransferencia por puntos), ensayos de "Southern blot" (o inmunotransferencia de Southern), y pruebas de anticuerpos específicos de híbridos ADN:ARN. Entre los marcadores convencionales de las sondas de ADN se encuentran los marcadores radioactivos 32P y 125I y el marcador químico biotina. El empleo de sondas de ADN proporciona un sustituto específico, sensible, rápido, y barato de técnicas de cultivo celular para el diagnóstico de las infecciones.
Secuencias AT-Hook
Secuencias unidas al ADN, descritas por primera vez en una de las PROTEÍNAS HMGA, la PROTEÍNA HMGA1a. Consisten en secuencias cargadas positivamente de nueve aminoácidos centrados en el tripéptido invariable glicina-arginina-prolina. Actúan sujetando las proteínas a una SECUENCIA RICA EN AT en el ADN.
Drosophila
Relación Estructura-Actividad
Estructura Secundaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Proteína B del Centrómero
Proteína de unión al ADN que interacciona con una secuencia del par de bases 17 conocida como motivo CENP-B box. Esta proteína está localizada en el CENTRÓMERO y desempeña un importante papel en su mantenimiento.
ADN Complementario
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
Temperatura Ambiental
Expresión Génica
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Genes Reporteros
Genes
Inmunoprecipitación de Cromatina
Técnica para identificar secuencias de ADN que se enlazan, en vivo, a proteínas de interés. Involucra fijación formaldehido de CROMATINA para entrelazar el ADN PROTEINAS DE ENLACE DE ADN. Después de cortar el ADN en pequeños fragmentos, los complejos de proteína ADN específicos se aislan por inmunoprecipitación con proteínas específicas de ANTICUERPOS. Luego, el ADN aislado del complejo puede ser identificado por amplificación y secuencia de RCP.
Factores de Unión al ADN Específico de las Células Eritroides
Grupo de factores de transcripción que originalmente se describieron como específicos de las CÉLULAS ERITROIDES.
Factores de Unión a la Caja G
Familia de factores de transcripción que se encuentran principalmente en las PLANTAS y se unen a la secuencia CACGTG de la caja G del ADN o a una secuencia consenso CANNTG.
Proteínas de Unión a Telómeros
Secuencias Hélice-Asa-Hélice
Estructuras supersecundarias recurrentes caracterizadas por 20 aminoácidos que se pliegan en dos alfa hélices conectadas por un segmento de "lazo" no helicoidal. Se encuentran en muchas secuencias específicas de PROTEINAS QUE SE UNEN AL ADN y de PROTEINAS QUE SE UNEN AL CALCIO.
Moldes Genéticos
Moldes macromoleculares para la síntesis de macromoléculas complementarias, como ocurre en la REPLICACIÓN DEL ADN, TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA de ADN a ARN y la TRADUCCIÓN GENÉTICA de ARN a POLIPÉPTIDOS.
Regulación Fúngica de la Expresión Génica
Proteína FUS de Unión a ARN
Ribonucleoproteína heterogénea-nuclear multifuncional que puede desempeñar un papel en el apareamiento y recombinación de ADN homológo. La porción N-terminal de la proteína es un potente activador transcripcional, mientras que se requiere el extremo C para la unión al ARN. El nombre FUS hace referencia al hecho de que los fenómenos de recombinación genética dan lugar a proteteínas oncogénicas de fusión (PROTREÍNAS ONCOGÉNICAS) que contienen la región N-terminal de esta proteína. Se han encontrado estas proteínas de fusión en el liposarcoma mixoide (LIPOSARCOMA MIXOIDE) y en la leucemia mieloide aguda.
Secuencias de Aminoácidos
Componentes estructurales de proteínas, comunmente observados, formados por combinaciones simples de estructuras secundarias adyacentes. Una estructura comunmente observada puede estar compuesta por una SECUENCIA CONSERVADA que puede estar representada por una SECUENCIA DE CONSENSO.
Represoras Lac
Proteínas represoras bacterianas que se unen a las OPERÓN LAC y evitan así la síntesis de proteínas implicadas en el catabolismo de la LACTOSA. Cuando los niveles de la lactosa son más altos que los represores lac experimentan un cambio alostérico que causan su liberación desde el ADN y la reanudación de la transcripción del operón lac.
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Técnicas del Sistema de Dos Híbridos
Técnicas de cribado concebidas inicialmente en levaduras para identificar genes que codifican proteínas interactuantes. Se usan variantes para evaluar la interrelación entre las proteínas y otras moléculas. Las técnicas de dos híbridos se refieren al análisis de interacciones entre proteínas; las técnicas de un híbrido, a las interacciones entre ADN y proteína; las técnicas de tres híbridos, a las interacciones entre ARN y proteína o entre ligando y proteína. Las técnicas de n híbridos en configuración inversa se refieren al análisis de mutaciones o de moléculas pequeñas que disocian las interacciones conocidas.
Drosophila melanogaster
Proteína 1 de Unión a Repeticiones Teloméricas
Proteína unida a telómero manifestado de manera ubícua, que está presente en los telómeros (TELÓMERO) en todo el CICLO CELULAR. Es un supresor de la elongación del telómero y puede estar implicado en la estabilización de la longitud del telómero. Es estructuralmente diferente de la PROTEÍNA 2 DE UNIÓN A REPETICIONES TELOMÉRICAS ya que contiene resíduos de aminoácidos acídicos N-terminal.
ADN Superhelicoidal
ADN duplex circular aislado a partir de los virus, bacterias y mitocondrias en forma superenrrollada o superdoblado. Este ADN superhelicoidal es rico en energía libre. Durante la transcripción, la magnitud de la iniciación es proporcional a la superhelicoidalidad del ADN.
Cristalografía por Rayos X
Daño del ADN
Lesiones en el ADN que introducen distorsiones de su estructura normal intacta y que puede, si no se restaura, dar lugar a una MUTACIÓN o a un bloqueo de la REPLICACIÓN DEL ADN. Estas distorsiones pueden estar causadas por agentes físicos y químicos y se producen por circunstancias introducidas, naturales o no. Estas incluyen la introducción de bases ilegítimas durante la replicación o por desaminación u otra modificación de las bases; la pérdida de una base del ADN deja un lugar abásico; roturas de filamentos únicos; roturas de filamentos dobles; intrafilamentoso (DÍMEROS DE PIRIMIDINA) o uniones cruzadas interfilamentosas. El daño con frecuencia puede ser reparado (REPARACIÓN DEL ADN). Si el daño es grande, puede inducir APOPTOSIS.
Metilación
Adición de grupos metilo. En histoquímica, la metilación se usa para esterificar grupos sulfato tratando cortes de tejido con metanol caliente en presencia de ácido clorhídrico. (Stedman, 25a ed)
Especificidad por Sustrato
Bacteriófago T4
Bacteriófago virulento y especie típica del género fago semejante a T4, de la familia MYOVIRIDAE. Infecta a la E. coli y es el fago mejor conocido del par T. Su virión contiene ADN de doble hebra, con terminación redundante y permutado circularmente.
Proteínas de Plantas
Mutagénesis
Proceso de generación de una MUTACIÓN genética. Puede darse espontáneamente o ser inducida por MUTÁGENOS.
Reparación del ADN
La reconstrucción de una molécula de ADN de doble cadena continua sin defectos a partir de una molécula contenida en regiones dañadas. Los principales mecanismos de reparación son la reparación por extirpación, en la que las regiones defectuosas en una cadena son extirpadas y resintetizadas usando la información complementaria de pareamento de las bases que está en la cadena intacta.
Recombinación Genética
Producción de nuevos ordenamientos del ADN por varios mecanismos tales como variación y segregación, INTERCAMBIO GENÉTICO, CONVERSIÓN GÉNICA, TRANSFORMACIÓN GENÉTICA, CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA o infección mixta por virus.
Análisis Mutacional de ADN
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Familia de Multigenes
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Elementos de Respuesta
Secuencias de nucleótidos, generalmente al inicio de la cadena, que son reconocidas por factores de transcripción reguladores específicos, provocando la respuesta del gen a los distintos agentes reguladores. Estos elementos pueden encontrarse tanto en regiones promotoras como intensificadoras.
Factor de Transcripción Sp1
Factor de transcripción promotor de la polimerasa II específica del ARN, que se une a la GC box, uno de los elementos promotor en las células de mamíferos. El enlace del Sp1 es necesario para iniciar la transcripción en los promotores de distintos GENES celulares y virales.
Cloranfenicol O-Acetiltransferasa
Enzima que cataliza la acetilación del cloranfenicol para formar cloranfenicol 3-acetato. Como el cloranfenicol 3-acetato no se enlaza con los ribosomas bacterianos y no es un inhibidor de peptidiltransferasa, la enzima es la responsable de la resistencia natural al cloranfenicol en las bacterias. La enzima, de la cual se conocen variantes, está presente en bacterias tanto gramnegativas como granpositivas. EC 2.3.1.28.
Histonas
Pequeñas proteínas cromosomales (aproximadamente de 12-20 kD) que poseen una estructura abierta, no doblada y que se unen al ADN en el núcleo celular por enlaces iónicos. La clasificación en los diversos tipos (denominadas histona I, histona II, etc.) se basa en las cantidades relativas de arginina y lisina de cada una.
Biblioteca de Genes
Gran colección de fragmentos de ADN clonados (CLONACIÓN MOLECULAR)de un determinado organismo, tejido, órgano o tipo celular. Puede contener secuencias genómicas completas (BIBLIOTECA GENÓMICA) o secuencias complementarias de ADN, éstas formadas a partir de ARN mensajero y sin secuencias intrónicas.
Factor de Transcripción Ikaros
Fosforilación
Antígenos Nucleares
Sustáncias que se detectan por medio de reacciones inmunológicas y que se encuentran en el NÚCLEO CELULAR.
Proteína de Unión a la Señal Recombinante J de las Inmunoglobulinas
Esclerosis Amiotrófica Lateral
Trastorno degenerativo que afecta las NEURONAS MOTORAS superiores en el cerebro y las neuronas motoras inferiores en el tronco cerebral y la MÉDULA ESPINAL. El comienzo de la enfermedad es usualmente después de los 50 años de edad y el proceso usualmente es fatal en 3 a 6 años. Las manifestaciones clínicas incluyen debilidad progresiva, atrofia, FASCICULACIÓN, hiperreflexia, DISARTRIA, disfagia, y parálisis eventual de la función respiratoria. Las características patológicas incluyen el reemplazo de las neuronas motoras con ASTROCITOS fibrosos y atrofia de las RAÍCES DE LOS NERVIOS ESPINALES anteriores y de los tractos corticoespinales.
Adenosina Trifosfatasas
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis del ATP. La reacción de hidrólisis usualmente es acoplada con otra función, tal como transportar Ca(2+) a través de la membana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca(2+), Mg(2+), aniones, H+, o ADN.
Células Tumorales Cultivadas
Análisis de Secuencia
Eliminación de Gen
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Factor Proteico para Inverción de Estimulación
Proteina de unión a ADN muy abundante, cuya expresión está muy relacionada con la fase de crecimiento bacteriano. La proteina tiene una función en la regulación de la topología del ADN y la activación de la transcripción del ARN RIBOSÓMICO. Se identificó originalmente como un factor necesario para la estimulación de inversión para la recombinasa Hin de la SALMONELLA y la recombinasa de sitio específico Gin del BACTERIÓFAGO MU.
Telómero
Nucleosomas
Proteínas Proto-Oncogénicas
Regulación Viral de la Expresión Génica
Replicación Viral
Bacteriófago mu
Un Colifago (género de virus similares al mu, família MYOVIRIDAE) templado, compuesto por una molécula lineal de ADN de doble hebra, capaz de insertarse al azar en cualquier punto del cromosoma hospedero. Frecuentemente causa mutación, al interrumpir la continuidad del OPERÓN bacteriano en el sitio de inserción.
ADN Polimerasa III
ADN polimerasa dependiente de ADN, descrita en E. coli y otros organismos inferiores, aunque puede estar presente en organismos superiores. Se usa también para una forma más compleja de ADN polimerasa III designada como ADN polimerasa III* o pol III*, que es 15 veces más activa biológicamente que la ADN polimerasa I en la síntesis de ADN. Esta polimerasa tiene actividad de exonucleasa tanto 3'-5'como 5'-3',es inhibida por reactivos sulfhidrílos y tiene la misma dependencia del molde-iniciador que el pol II. EC 2.7.7.7.
Células Cultivadas
Operón
En las bacterias, grupo de genes metabólicamente relacionados, con un promotor común, cuya transcripción a un ARN MENSAJERO policistrónico único está bajo control de una región OPERADORA.
Poli dA-dT
Crithidia fasciculata
Sulfolobus
Género de cocos ARCHAEA aeróbicos, quemolitotróficos cuyos organismos son termoacidofílicos. Sus células tienen forma muy irregular, a menudo lobuladas, pero ocasionalmente esféricas. Tienen una distribución mundial con organismos aislados de suelos calientes acídicos y del agua. El azufre se utiliza como fuente de energía.
Baculoviridae
Familia de VIRUS DE INSECTOS que contiene a dos subfamilias: Eubaculovirinae (baculovirus ocluidos) y Nudibaculovirinae (baculoviruses no ocluidos). La Eubaculovirinae, que contiene cuerpos de inclusión poliédricos, tiene dos géneros: NUCLEOPOLYHEDROVIRUS y granulovirus. Los vectores de los baculovirus se utilizan para la expresión de los genes foráneos en los insectos.
Pentoxil
Proteínas de Unión al ARN
Exodesoxirribonucleasas
Familia de enzimas que catalizan la segmentación exonucleolítica del ADN. Incluye miembros de la clase EC 3.1.11 que forman 5'-fosfomonoésteres como produtos de la segmentación.
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Dominios HMG-Box
Dominios de unión a ADN presentes en las proteínas de la superfamilia de la HMG-box incluyendo el arquetipo de las PROTEÍNAS HMGB, un número de secuencia de FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN específicos, y otra PROTEÍNAS DE UNIÓN AL ADN. Los dominios constan de 70-80 aminoácidos que forman un pliegue en forma de L a partir de tres segmentos de alfa-helicoidales. El dominio tiene la capacidad de reconocer y/o inducir a estructuras específicas de ADN y efectuar la accesibilidad del ADN a otras proteínas implicadas en la transcripción, recombinación, o reparación del ADN. (Tenga en cuenta que no todas las PROTEÍNAS DEL GRUPO DE ALTA MOVILIDAD contienen este dominio.)
Reactivos de Enlaces Cruzados
Reactivos con dos grupos reactivos, usualmente en extremos opuestos de la molécula, que son capaces de reaccionar y así formar puentes entre las cadenas laterales de los aminoácidos de las proteínas; las locaciones de las áreas naturalmente reactivas dentro de las proteínas pueden identificarse de esta forma; también pueden utilizarse para otras macromoléculas, como las glicoproteínas, ácidos nucleicos, u otros.
Multimerización de Proteína
Proteínas Oncogénicas v-myb
Western Blotting
Factor 1 de Transcripción de Unión a Octámeros
Factor de transcripción octámero que se manifiesta ubicuamente, que regula la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA del ARN NUCLEAR PEQUEÑO, GENES DE INMUNOGLOBULINAS y genes de HISTONAS H2b.
Fagos T
Serie de 7 fagos virulentos que infectan a la E. coli. Los fagos T-pares T2, T4 (BACTERIÓFAGO T4), y T6, y los fagos T5 se llaman "autónomamente virulentos" debido a que producen cese del metabolismo bacteriano durante la infección. Los fagos T1, T3 (BACTERIÓFAGO T3), y T7 (BACTERIÓFAGO T7) se les llama "virulento dependientes" debido a que dependen de la continuación del metabolismo bacteriano durante el ciclo lítico. Los fagos T-pares contienen 5-hidroximetilcitosina en lugar de la citosina ordinaria en su ADN.
Proteínas Proto-Oncogénicas c-ets
Familia de factores de transcripción que comparten un único dominio de unión del ADN. Debe su nombre a la proteína oncogénica v-ets del VIRUS DE LA ERITROBLASTOSIS AVIAR.
Factor de Transcripción AP-2
Familia de proteínas de unión al ADN que regulan la expresión de diversos GENES durante la DIFERENCIACIÓN CELULAR y la APOPTOSIS. Los miembros de esta familia contienen un MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE básico carboxiterminal altamente conservado, involucrado en la dimerización y la secuencia específica de unión del ADN.
Regulación del Desarrollo de la Expresión Génica
Proteína HMGB1
Proteina HMGB de 24 KD que se une y distorsione las ramas menores del ADN.
TATA Box
Una secuencia conservada rica en A-T que está contenida en los promotores para la ARN polimerasa II. El segmento tiene una longitud de siete pares de bases y los nucleótidos más comunmente hallados son TATAAAA.
Deinococcus
Género de cocos aerobios grampositivos que se encuentran en el suelo, muy resistentes a las radiaciones, especialmente a las radiaciones ionizantes (RADIACIÓN IONIZANTE). La especie tipo es Deinococcus radiodurans.
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Cuerpos de Inclusión
Término genérico utilizado para designar cualquier masa circunscrita de materiales ajenos a la célula (por ejemplo plomo o virus) o metabólicamente inactivos (por ejemplo los cuerpos ceroides o CUERPOS DE MALLORY), presentes en el citoplasma o en el núcleo de una célula. Los cuerpos de inclusión se encuentran en las células infectadas con determinados virus filtrables, observados especialmente en las células nerviosas, epiteliales o endoteliales. (Traducción libre del original: Stedman, 25th ed)
beta-Galactosidasa
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de residuos terminales, no reductores de beta-D-galactosa en los beta-galactósidos. La deficiencia de beta-galactosidasa A1 puede causar la GANGLIOSIDOSIS GM1.
Spodoptera
Modelos Genéticos
Difusión Facilitada
Movimiento pasivo de las moléculas sobrepasadas a la tasa esperada por simple difusión. No se gasta energía en el proceso. Esto se logra mediante la introducción de la difusión pasiva de moléculas a un entorno o camino que es más favorable para el movimiento de esas moléculas. Ejemplos de difusión facilitada son los transportes pasivos de sustancias hidrófilas través de una membrana de lípidos a través de poros hidrófilos que atraviesan la membrana, y el deslizamiento de una PROTEÍNA DE UNIÓN AL ADN a lo largo de una cadena de ADN.
Desoxirribonucleasas
Enzimas que catalizan la hidrólisis de enlaces éster dentro del ADN. EC 3.1.-.
Virus 40 de los Simios
Proteína Receptora de AMP Cíclico
Regulador transcripcional en procariotes que, cuando se activa por la unión del AMP cíclico, actúa sobre varios promotores. La proteína receptora del AMP cíclico se identificó originalmente como un catabolito de la proteína activadora del gen. Luego se demostró que regulaba varias funciones no relacionadas con el catabolismo, y que podía ser un regulador negativo o positivo de la transcripción. Los receptores del AMP cíclico en la superficie celular no se incluyen (RECEPTORES DE AMP CÍCLICO), ni las proteínas citoplasmáticas receptoras de AMP cíclico de los eucariotes, que son las subunidades reguladoras de las PROTEINO QUINASAS DEPENDIENTES DE AMP.
Electroforesis en Gel de Agar
Fenotipo
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Origen de Réplica
Secuencia única de ADN de un replicón en la que se inicia la REPLICACIÓN DEL ADN y prosigue bidireccional o unidireccionalmente. Contiene los sitios en que ocurre la primera separación de las cadenas complementarias, se sintetiza un primer ARN, y tiene lugar el cambio del primer ARN a la síntesis de ADN. (Adaptación del original: Rieger et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed).
Proteínas Reguladoras y Accesorias Virales
Una amplia categoría de proteínas virales que juegan roles indirectos en los procesos biológicos y actividades de los virus. Se incluyen aquí proteínas que regulan la expresión de genes virales o están implicadas en modificar las funciones de la célula huesped. Muchas de las proteínas en esta categoría realizan múltiples funciones.
Complejo Desacetilasa y Remodelación del Nucleosoma Mi-2
Complejo de enzima implicada en la remodelación de los NUCLEOSOMAS. El complejo está compuesto de al menos siete subunidades e incluye tanto la histona desacetilasa y actividades de ATPasa.