Proteínas Ribosómicas
Proteínas que se encuentran en los ribosomas. Se cree que tengan una función catalítica en la reconstrucción de las subunidades ribosomales biológicamente activas.
Proteína S6 Ribosómica
Proteína ribosómica que puede intervenir en el control del crecimiento y proliferación celular. Es un sustrato importante de las PROTEIN S6 QUINASAS RIBOSÓMICAS y juega un papel en la regulación de la traslación (TRASLACIÓN GENÉTICA) de los ARNs que contienen una SECUENCIA DE OLIGOPIRIMIDINA ARN 5' TERMINAL.
Ribosomas
Estructuras con múltiples componentes que se encuentran en el CITOPPLASMA de todas las células, y en las MITOCONDRIAS y en los PLASTIDIOS. Desempeñan función en la BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS a través de la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Proteínas Quinasas S6 Ribosómicas
Familia de las proteínas quinasas serina/treonina, que actúan como intermediarios de la señalización intracelular. Las proteínas quinasas S6 ribosómicas son activadas mediante la fosforilación, en respuesta a distintas HORMONAS y PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS DE SEÑALIZACIÓN INTERCELULAR. La fosforilización de la PROTEÍNA S6 RIBOSÓMICA por enzimas de esta clase da lugar a una expresión aumentada del 5' TOP MRNAS. Aunque específicas para los miembros de la PROTEÍNA S6 RIBOSÓMICA de esta clase de quinasas, pueden actuar sobre numerosos sustratos dentro de la célula. El inmunosupresor SIROLIMUS inhibe la activación de las proteínas quinasas S6 ribosómicas.
ARN Ribosómico
La forma más abundante de ARN; junto con las proteínas, constituye los ribosomas, desempeñando un papel estructural y un papel en la unión ribosómica del ARNm y los ARNt. Las cadenas individuales se designan, de forma convencional, por sus coeficientes de sedimentación. En los eucariotas existen cuatro cadenas grandes, sintetizadas en el nucleolo y que constituyen aproximadamente el 50 por ciento del ribosoma. (Dorland, 28a ed)
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Secuencia de Bases
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Secuencia de Aminoácidos
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Proteínas Quinasas S6 Ribosómicas 70-kDa
Familia de proteínas quinasas S6 ribosómicas que se consideran las principales quinasas fisiológicas de la PROTEÍNA S6 RIBOSÓMICA. A diferencia de las PROTEÍNAS QUINASAS S6 RIBOSÓMICAS, las proteinas de 90 kD de esta familia son sensibles a los efectos inhibifores de la RAPAMICINA y contiene un dominio único de quinasa. Se les conoce como proteínas de 70 kD, aunque el EMPALME ALTERNATIVO de los ARNm para proteínas de esta clase también se da en las variantes de 85 kD que se forman.
Anemia de Diamond-Blackfan
Anemia hipoplásica congénita, rara, que suele presentarse en la primera infancia. Esta enfermedad se caracteriza por una anemia macrocítica moderada o intensa, ocasionalmente acompañada de neutropenia o trombocitosis, una médula ósea normocelular con hipoplasia eritroidea, y un mayor riesgo de desarrollo de leucemia. (Curr Opin Hematol 2000 Mar;7(2):85-94)
Saccharomyces cerevisiae
Subunidades Ribosómicas Grandes de Eucariotas
Subunidad mayor del ribosoma 80s de eucariotas. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 28S, de ARN RIBOSÓMICO 5.8S, de ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 50 diferentes PROTEÍNAS RIBOSOMALES.
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
ARN Bacteriano
Mutación
Polirribosomas
Estructura multirribosómica que representa una secuencia lineal de RIBOSOMAS los cuales se mantienen unidos por el ARN MENSAJERO. Estos polirribosomas constituyen los complejos activos en la síntesis proteica celular y son capaces de incorporar los aminoácidos a los polipéptidos tanto in vivo como in vitro. (From Rieger, et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed).
Conformación de Ácido Nucleico
Subunidades Ribosómicas Pequeñas de Eucariotas
Subunidad menor de los ribosomas 80s de eucariotas. Está formada por ARN RIBOSÓMICO 18S y alrededor de 32 diferentes PROTEÍNAS RIBOSOMALES.
Geobacillus stearothermophilus
Thermus thermophilus
Nucléolo Celular
Región diferente, no delimitada por una membrana, que se encuentra dentro del NÚCLEO CELULAR de la mayoría de las células eucariotas, en el mismo se sintetizan algunas especies de ARNr (ARN RIBOSÓMICO) y se ensamblan con unidades de ribonucleoproteínas del ribosoma. En el nucléolo el ARNr se transcribe a partir de un organizador nucleolar, es decir, un grupo de genes cromosomales en línea que codifican al ARNr y que son transcriptos por la ARN polimerasa I.
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
ARN Ribosómico 5S
Proteínas Quinasas S6 Ribosómicas 90-kDa
Familia de proteínas quinasas S6 ribosómicas que se diferencian estructuralmente de las PROTEÍNAS QUINASAS S6 RIBOSÓMICAS 70-KDA por su tamaño molecular evidente y porque contienen dos dominios funcionales de quinasa. Aunque las PROTEÍNAS QUINASAS S6 RIBOSÓMICAS se consideran miembros de esta familia, son activadas mediante el SISTEMA DE SEÑALIZACIÓN DE QUINASAS PAM y se ha demostrado que actúan sobre un orden diverso de sustratos que están implicados en la regulación celular como la PROTEÍNA S6 RIBOSÓMICA y la PROTEÍNA DE UNIÓN A ELEMENTO DE RESPUESTA AL AMP CÍCLICO.
Transcripción Genética
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Genes
ARN Ribosómico 23S
Constituyente de la subunidad 50S de los ribosomas procarióticos que contienen alrededor de 3200 nucleótidos. El rARN 23S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
Operón
En las bacterias, grupo de genes metabólicamente relacionados, con un promotor común, cuya transcripción a un ARN MENSAJERO policistrónico único está bajo control de una región OPERADORA.
Electroforesis en Gel de Poliacrilamida
Homología de Secuencia de Aminoácido
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Poli U
Unión Proteica
Proteínas de Unión al ARN
Proteínas que se unen a moléculas de ARN. Están incluidas aquí las RIBONUCLEOPROTEÍNAS y otras proteínas cuya función es unirse especificamente al ARN.
Subunidades Ribosómicas Grandes
El componente mayor de las ribonucleoproteínas de los RIBOSOMAS. Contiene los dominios que catalizan la formación del enlace del péptido y del desplazamiento del ribosoma a lo largo del ARN MENSAJERO durante la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Subunidades Ribosómicas Pequeñas Bacterianas
Subunidad pequeña de los RIBOSOMAS de las eubacterias. Está formada por ARN RIBOSÓMICO 16S y alrededor de 23 PROTEÍNAS RIBOSÓMICAS distintas.
Factores de Elongación de Péptidos
Serina-Treonina Quinasas TOR
Serina treonina quinasa que controla un amplio rango de procesos celulares relacionados con el crecimiento. La proteína es conocida como el objetivo de la RAPAMICINA debido al descubrimiento de que SIROLIMUS (comúnmente conocido como rapamicina) forma un complejo inhibidor con la PROTEÍNA 1A DE UNIÓN A TACROLIMUS que bloquea la acción de su actividad enzimática.
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Sitios de Unión
Fosforilación
Proteínas Quinasas
Proteínas de Saccharomyces cerevisiae
Proteínas obtenidas de las especies SACCHAROMYCES CEREVISIAE. La función de proteínas específicas de este organismo ha despertado un alto interés científico y se ha utilizado para derivar el conocimiento basico del funcionamiento de proteínas similares en eucariotas superiores.
Proteínas de Escherichia coli
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
Cloroplastos
Cuerpos de inclusión de las células vegetales que contienen el pigmento fotosintético CLOROFILA, asociado con la membrana de los TILACOIDES. Los cloroplastos se encuentran en los tallos jóvenes y hojas de las plantas superiores. También se encuentran en algunas formas de FITOPLANCTON como la HAPTOPHYTA; DINOFLAGELADOS; DIATOMEAS; y CRPTÓFITAS.
ARN de Hongos
Halobacterium
Emetina
Principal alcaloide de la ipeca, de las raíces de Uragoga (o Cephaelis) ipecacuanha o U. acuminata, de las Rubiaceae. Se utiliza como amebicida en muchos preparados y puede ocasionar graves daños cardiacos, hepáticos o renales y diarrea y vómitos violentos. La emetina inhibe la síntesis proteica en las CÉLULAS EUCARIOTAS pero no en las CÉLULAS PROCARIOTAS.
ARN Ribosómico 18S
Constituyente de la subunidad 40S de los ribosomas de eucariotas. El rARN 18S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos en eucariotas.
Tioestreptona
Uno de los PÉPTIDOS CÍCLICOS del streptomyces que es activo contra las bacterias gram positivas. En veterinaria se ha usado en la mastitis causada por organismos gram negativos y en afecciones dermatológicas. ntibiótico que contiene un polipéptido aislado de una especie de Streptomyces en el suelo de Nuevo México. Parece ser altamente activo contra las bacterias gram-positivas. En la medicina veterinaria, la tiostreptona ha sido empleada en la mastitis provocada por organismos gram-negativos y en trastornos dermatológicos.
Subunidades Ribosómicas Pequeñas
Componente pequeño de ribonucleoproteínas de los RIBOSOMAS. Contiene el sitio de unión del ARN MENSAJERO y dos sitios de unión para el ARN DE TRANSFERENCIA - uno para el AMINOACIL ARNt (sitio A) y el otro (sitio P) para el peptidil ARNt que porta la cadena peptídica de elongación.
Codón
Conjunto de tres nucleótidos en una secuencia de codificación de proteínas que especifica los aminoácidos individuales o una señal de terminación (CODÓN DE TERMINACIÓN). La mayoría de los codones son universales, pero algunos organismos no producen los ARN DE TRANSFERENCIA complementarios para todos los codones. Estos codones se conocen como codones no asignados (CODÓN SIN SENTIDO).
Regulación Fúngica de la Expresión Génica
ARN de Transferencia
Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.
Modelos Moleculares
Electroforesis en Gel Bidimensional
Plásmidos
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Estreptomicina
O-2-Deoxi-2-(metilamino)-alfa-L-glucopiranosil-(1-2)-O-5- deoxi-3-C-formil-alfa-L-lixofuranosil-(1-4)-N,N'-bis- (aminoiminometil)-D-streptamina. Sustancia producida por el actinomycete Streptomyces griseus de la tierra. Actúa a través de la inhibición de los procesos de iniciación y elongación durante la síntesis de proteínas.
Aminoácidos
Compuestos orgánicos que generalmente contienen un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH). Veinte aminoácidos alfa son las subunidades que se polimerizan para formar proteínas.
Mapeo Restrictivo
Iniciación de la Cadena Peptídica Traduccional
Proceso de TRADUCCIÓN GENÉTICA en el que se inicia la formación de una cadena peptídica. Incluye la reunión de los componentes de los RIBOSOMAS, la realización de la codificación del ARN MENSAJERO para el polipéptido, ARNT INICIADOR, FACTORES DE INICIACIÓN DE PÉPTIDOS y colocación del primer aminoácido en la cadena peptídica. Los detalles y componentes de este proceso son únicos en la biosintesis de las proteinas procarióticas y eucariótica.
Sirolimus
Un compuesto macrólido obtenido del Streptomyces hygroscopicus que actúa bloqueando selectivamente la activación transcripcional de las citoquinas inhibiendo por consiguiente la producción de citoquinas. Es bioactiva solamente cuando se encuentra unida a las INMUNOFILINAS. El sirolimus es un potente inmunosupresor y posee propiedades antifúngicas y antineoplásicas.
Precursores del ARN
Transcripciones de ARN del ADN que se encuentran en alguna etapa inconclusa de procesamiento post-transcripcional ( PROCESAMIENTO POSTRANSCRIPCIONAL DEL ARN ) necesarios para la función. Precursores de ARN pueden someterse a varias etapas del EMPALME DEL ARN durante el cual los enlaces fosfodiesterasas en los límites exón-intrón se escinden y se extraen los intrones. En consecuencia se forma un nuevo enlace entre los extremos de los exones. Resultantes de ARN maduros se pueden utilizar, por ejemplo, ARNm maduro (ARN MENSAJERO) se usa como una plantilla para la producción de proteínas.
Intrones
Secuencias no codificadoras e interventoras de ADN que son transcriptas, pero que son removidas en la transcripción génica primaria y degradadas rápidamente durante la maduración del ARN mensajero. La mayoría de los genes en los núcleos de eucariotes contienen intronas, al igual que los genes mitocondriales y del cloroplasto.
Especificidad de la Especie
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Northern Blotting
Detección del ARN que ha sido separado electroforéticamente e inmovilizado mediante secado en papel de nitrocelulosa u otro tipo de papel o membrana de nylon.
Procesamiento Postranscripcional del ARN
Subunidades Ribosómicas
Los dos complejos de ribonucleoproteína, de diferente tamaño, que constituyen un RIBOSOMA - la subunidad ribosómica mayor y la subunudad ribosómica menor. El ribosoma eucariótico de 80S está constituido por una subunidad mayor, de 60S, y una subunidad menor, de 40S. El ribosoma bacteriano de 70S está formado por una subunidad mayor, de 50S, y una subunidad menor, de 30S.
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Regulación de la Expresión Génica
Cualquiera de los procesos por los cuales factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen en el control diferencial (inducción o represión), de la acción de genes a nivel de transcripción o traducción.
ARN Ribosómico 16S
Constituyente de la subunidad 30S de los ribosomas procarióticos que contiene 1600 nucleótidos y 21 proteínas. El rARN 16S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos.
Extensión de la Cadena Peptídica de Translación
Proceso de TRADUCCIÓN GENÉTICA en el que un aminoácido se transfiere de su cognado ARN DE TRANSFERENCIA a la cadena extendida de PÉPTIDOS.
Fosfoproteínas
Haloarcula marismortui
Especie de archaea halofílica que se distingue por su producción de ácido a partir del azúcar. Esta especie se llamó previamente Halobacterium marismortui.
Subunidades Ribosómicas Grandes Bacterianas
Subunidad mayor del ribosoma 70S de eubacterias. Se compone de ARN RIBOSÓMICO 23S, ARN RIBOSÓMICO 5S y de aproximadamente 37 diferentes PROTEÍNAS RIBOSOMALES.
Imidoésteres
Esteres de los hipotéticos ácidos imídico. Reaccionan con las aminas o aminoácidos para formar amidinas y son por lo tanto utilizados para modificar la estructura proteica y como agentes para formar enlaces cruzados.
Factores de Iniciación de Péptidos
Tricodermina
Un metabolito antifúngico proveniente de varios hongos, principalmente Trichoderma viride; inhibe la síntesis proteíca al unirse a los ribosomas; se ha propuesto como antifúnfico y antineoplásico; es utilizado como una herramiente en la bioquímica celular.
ARN
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Factor G de Elongación Peptídica
El Factor G de Elongación Peptídica cataliza la translocación de peptidil-ARNt del sitio A hacia el sitio P de los ribosomas bacterianos, mediante un proceso vinculado a la hidrólisis de GTP a GDP.
Plantas
Formas de vida multicelular, eucariótica del reino Plantae (sensu lato), comprende las VIRIDIPLANTAE, RHODOPHYTA y GLAUCOPHYTA, todas las cuales adquieren cloroplastos mediante endosimbiosis directa de las CIANOBACTERIAS. Se caracterizan por tener un modo de nutrición fundamentalmente fotosintético; crecimiento esencialmente ilimitado en regiones localizadas de división celular (MERISTEMO); la celulosa en el interior de las células les aporta rigidez; la ausencia de órganos de locomoción; ausencia de nervios y sistema sensorial; y una alteración de generaciones haploides y diploides.
ARN Ribosómico 28S
Constituyente de la subunidad 60S de los ribosomas eucarióticos. El rARN 28S participa en la iniciación de la síntesis de polipéptidos en eucariotas.
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Regiones Promotoras Genéticas
Factor 2 de Elongación Peptídica
El Factor 2 de elongación peptídica cataliza la translocación de peptidil-ARNt del sitio A al sitio P de los ribosomas eucarióticos, mediante un proceso vinculado a la hidrólisis de GTP a GDP.
Centrifugación por Gradiente de Densidad
Familia de Multigenes
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Factor 4E Eucariótico de Iniciación
Factor de iniciación de péptidos que se une específicamente a CAPERUZAS DE ARN 5' del ARNM en el CITOPLASMA. Es un componente del complejo trimérico EIF4F.
Mapeo Cromosómico
Cualquier método empleado para determinar la localización y distancias relativas entre los genes en un cromosoma.