Girasa de ADN
ADN topoisomerasa II bacteriano que cataliza la rotura dependiente de ATP de ambos filamentos de ADN, el paso de las hebras continuas a través de las rupturas, y re-uniones de los filamentos rotos. Las uniones de Girasa al ADN como un heterotetrámero consisten en dos subunidades A y dos B. En presencia del ATP, la girasa es capaz de convertir el ADN dúplex circular relajado en una superhélice. En la ausencia del ATP, ADN superenrollado se relajó por la ADN girasa.
Topoisomerasas de ADN Tipo II
Enzima que requiere ATP y que, en presencia de iones magnesio, introduce superenrollamientos negativos en ADN de cadena doble cerrados y posiblemente lineales. La enzima interviene en la replicación y en la transcripción del ADN. Provoca el almacenamiento de energía de presión mecánica en las vueltas superhelicoidales del ADN, a expensas de la hidrólisis del ATP. EC 5.99.1.3.
Novobiocina
Compuesto antibiótico derivado del Streptomyces niveus. Tiene una estructura química similar a la cumarina. La novobiocina se une a la ADN girasa, y bloquea la actividad de la adenosina trifosfatasa (ATPasa). (Traducción libre del original: Reynolds, Martindale The Extra Pharmacopoeia, 30th ed, p189)
ADN Superhelicoidal
ADN duplex circular aislado a partir de los virus, bacterias y mitocondrias en forma superenrrollada o superdoblado. Este ADN superhelicoidal es rico en energía libre. Durante la transcripción, la magnitud de la iniciación es proporcional a la superhelicoidalidad del ADN.
Inhibidores de Topoisomerasa II
Compuestos que inhiben la actividad de las TOPOISOMERASAS DE ADN TIPO II. Incluidos en esta categoría hay una variedad de ANTINEOPLÁSICOS que se dirigen a la forma eucariota de la topoisomerasa II y ANTIBACTERIANOS que se dirigen a la forma procariota de la topoisomerasa II.
Aminocumarinas
CUMARINAS con un grupo amino, ejemplificadas por la NOVOBIOCINA.
Ácido Oxolínico
Topoisomerasa de ADN IV
Topoisomerasa bacteriana de ADN II que cataliza la rotura dependiente de ATP de ambas hebras de ADN, el paso de hebras sin romper a través de las roturas y la unión, de nuevo, de las hebras rotas. La topoisomerasa IV se une al ADN como heterodímero que consta de dos subunidades parC y 2 subunidades parE. La topoisomerasa IV es una enzima separadora de los cromosmas hijos entrelazados tras la replicación del ADN.
Cumarinas
4-Quinolonas
QUINOLONAS con un grupo 4-oxo (carbonilo en posición para unido al nitrógeno). Estos compuestos inhiben la subunidad A de la GIRASA DE ADN y se utilizan como antimicrobianos. La segunda generación de 4-quinolonas también están sustituidas con un grupo 1-piperacinilo en posición 7 y un átomo de flúor en posición 6.
Fluoroquinolonas
Grupo de QUINOLONAS que poseen, al menos, un átomo de cloro y un grupo piperacinilo.
Quinolonas
Ácido Nalidíxico
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Antiinfecciosos
Topoisomerasas de ADN Tipo I
Enzima que cataliza la ruptura independiente de ATP de un ADN de cadena simple, seguida por el paso y reagrupamiento de otra hebra simple del ADN. Esta clase de enzima realiza la conversión de un topoisómero de ADN en otro, por ejemplo, el relajamiento de las vueltas superhelicoidales en el ADN, la interconversión de anillos simples y nodulares del ADN de cadena simple y el entrelazamiento de anillos de cadena simple de secuencias complementarias. EC 5.99.1.2.
Farmacorresistencia Microbiana
Norfloxacino
Fluoroquinolona sintética (FLUOROQUINOLONAS) con un amplio espectro de acción contra la mayoría de las bacterias gram-negativas y gram-positivas. Inhibe la GIRASA DE ADN bacteriana.
Ciprofloxacino
Farmacorresistencia Bacteriana
Pruebas de Sensibilidad Microbiana
Plásmidos
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Mutación
Ofloxacino
Fluoroquinolona sintética que inhibe la actividad de superenrollamiento de las bacterias GIRASA DE ADN, parando la REPLICACIÓN DEL ADN.
Enoxacino
Antibacteriano de amplio espectro formado por 6-fluoronaftiridinona estructuralmente relacionado con el ÁCIDO NALIDÍXICO.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
ADN Encadenado
ADN CIRCULAR que está entrelazado como uniones de una cadena. Es usado como un ensayo para la actividad de las TOPOISOMERASAS DE ADN. El ADN encadenado se diferencia del ADN CONCATENADO en que aquel la unión es eslabón a eslabón y en éste la unión es final con final.
Naftiridinas
Inhibidores de Topoisomerasa
Compuestos que inhiben la actividad de las TOPOISOMERASAS del ADN.
Secuencia de Bases
Topoisomerasas de ADN
Enzimas que regulan la topología del ADN mediante acciones como la rotura, relajación, paso y reunión de las cadenas de ADN en las células. Estas enzimas son componentes importantes del sistema de replicación del ADN. Se clasifican por las especificidades del sustrato. Las enzimas TOPOISOMERASAS DE ADN TIPO I actuan sobre una cadena única del ADN. Las enzimas TOPOISOMERASAS DE ADN TIPO II actuan sobre cadenas dobles de ADN.
Pefloxacina
Un agente antibacteriano quinolónico de amplio espectro, administrado oralmente, activo contra la mayoría de las bacterias gram-negativa y gram-positiva. Es eficaz contra las infecciones del tracto urinario así como contra otras infecciones sistémicas. La droga es bien tolerada en audultos, pero no debe darse a niños ni mujeres embarazadas.
Adenilil Imidodifosfato
Ácido 5'-adenílico, monoanhídrido con ácido imidodifosfórico. Análogo del ATP, en el que el átomo de oxígeno que hace de puente entre el fosfato beta y gamma es reemplazado por un átomo de nitrógeno. Es un potente inhibidor competitivo de la ATPasa mitocondrial soluble y unida a la membrana, y tambien inhibe las reacciones de fosforilación oxidativa dependientes del ATP.
Mycobacterium smegmatis
Levofloxacino
Isómero L del Ofloxacino.
Staphylococcus aureus
Secuencia de Aminoácidos
Adenosina Trifosfatasas
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis del ATP. La reacción de hidrólisis usualmente es acoplada con otra función, tal como transportar Ca(2+) a través de la membana. Estas enzimas pueden ser dependientes de Ca(2+), Mg(2+), aniones, H+, o ADN.
Micrococcus
Conformación de Ácido Nucleico
Adenosina Trifosfato
Bacteriófago mu
Un Colifago (género de virus similares al mu, família MYOVIRIDAE) templado, compuesto por una molécula lineal de ADN de doble hebra, capaz de insertarse al azar en cualquier punto del cromosoma hospedero. Frecuentemente causa mutación, al interrumpir la continuidad del OPERÓN bacteriano en el sitio de inserción.
Mycoplasma hominis
Replicación del ADN
Los procesos mediante los cuales las dos cadenas de la doble hélice del ADN se separan, permitiendo que cada cadena actúe como plantilla para la síntesis de una cadena complementaria mediante el pareamiento de bases específicas. Comprende la replicación autónoma pero no la REPLICACION VIRAL.
Inhibidores de Topoisomerasa I
Compuestos que inhiben la actividad de la TOPOISIMERASA I del ADN.
Hexilresorcinol
Streptococcus pneumoniae
Inhibidores Enzimáticos
Proteínas de Escherichia coli
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Quinolinas
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Bacteriocinas
Concentración 50 Inhibidora
Concentración de un compuesto necesaria para reducir in vitro el crecimiento poblacional de organismos, incluidas las células eucariotas, en un 50 por ciento. Aunque a menudo se expresa para denotar la actividad antibacteriana in vitro, se utiliza también como un patrón de citotoxicidad a las células eucariotas en cultivo.
Cromosomas Bacterianos
Estructuras dentro del núcleo de las células de bacterias que consisten en o contienen ADN el cual porta la información genética esencial de la célula.
ADN Circular
Cualquiera de las moléculas de ADN covalentemente cerradas que se encuentran en bacterias, muchos virus, mitocondrias, plástidos, y plásmidos. También se han observado ADNs pequeños, circulares y polidispersos en un número de organismos eucarióticos y se ha sugerido que tienen homología con el ADN cromosómico y en la capacidad de insertarse en él, y escindirse del ADN cromosómico. Es un fragmento de ADN formado por un proceso de formación y de deleción de un asa , que contiene una región constante de la cadena pesada mu y la parte 3 de la región de cambio mu. El ADN circular es un producto normal de la reordenación entre los segmentos del gen que codifica las regiones variables de las cadenas ligeras y pesadas de las inmunoglobulinas, así como de los receptores de las células T.
Xanthomonas
Factor F
Plásmido cuya presencia en las células, sea extracromosomal o integrado en los CROMOSOMAS BACTERIANOS, determina el "sexo" de la bacteria, la movilización del cromosoma huésped, transferencia por medio de la CONJUGACIÓN GENÉTICA del material genético, y la formación de PILI SEXUAL.
Quinolizinas
Electroforesis en Gel de Agar
Sustancias Macromoleculares
Compuestos y complejos moleculares consistentes en un gran número de átomos generalmente sobre 500 kD de tamaño. En los sistemas biológicos las substancias macromoleculares se pueden visualizar generalmente usando MICROSCOPIO ELECTRÓNICO y se distinguen de los ORGANELOS por la carencia de estructura membranosa.
Glicósidos
Cualquier compuesto que tiene una molécula de carbohidrato (azúcar), en particular cualquier producto natural de ese tipo que se encuentra en las plantas y que puede convertirse, mediante fragmentación hidrolítica, en un componente de azúcar y uno que no es de azúcar (aglucona) y que recibe un nombre específico según el azúcar que contiene, como glucósido (glucosa), pentósido (pentosa), fructósido (fructosa), etc. (Dorland, 28a ed)
Relación Estructura-Actividad
Modelos Moleculares
Isopropil Tiogalactósido
Streptomyces
Género de bacterias que forman micelas aéreas no fragmentadas. Se han identificado muchas especies de las que algunas son patógenas. Este género es responsable de la producción de la mayoría de los AGENTES ANTIBACTERIANOS de uso práctico.
Péptidos Cíclicos
Péptidos cuyos extremos amino y carboxi están unidos mediante unión peptídica formando una cadena circular. Algunos de estos compuestos son AGENTES ANTIINFECCIOSOS. Algunos de ellos son de síntesis no ribosómica (BIOSÍNTESIS PEPTÍDICA NO RIBOSÓMICA).
Cristalografía por Rayos X
Sitios de Unión
Mycobacterium
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
Compuestos Aza
Subunidades de Proteína
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Isomerasas de Aminoácido
Bacteriófago lambda
Fago temperado inducible y especie típica del género Fago lamba-semejante, en la familia SIPHOVIRIDAE. Su hospedero natural es la E. coli K12. Su virión contiene un ADN lineal de dóble hebra, excepto por 12 bases complementarias en el extemo 5-terminal de las cadenas de polinucleótidos. El ADN se torna circular durante la infección.