Factores de Integración del Huésped
Proteinas bacterianas utilizadas por BACTERIÓFAGOS para incorporar su ADN dentro del ADN de la bacteria "huesped". Hay proteinas unidas al ADN que actúan en recombinación genética así como en la regulación de la transcripción y la trazducción.
Bacteriófago lambda
Fago temperado inducible y especie típica del género Fago lamba-semejante, en la familia SIPHOVIRIDAE. Su hospedero natural es la E. coli K12. Su virión contiene un ADN lineal de dóble hebra, excepto por 12 bases complementarias en el extemo 5-terminal de las cadenas de polinucleótidos. El ADN se torna circular durante la infección.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Proteínas de Unión al ADN
Secuencia de Bases
ARN Polimerasa Sigma 54
ARN polimerasa dirigida por el ADN que se encuentra en las BACTERIAS. Es una holoenzima que consta de múltiples subunidades, entre las que figura el factor sigma 54.
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Pseudomonas putida
Regiones Promotoras Genéticas
Plásmidos
Sitios de Ligazón Microbiológica
Determinados loci de las moléculas de ADN tanto bacterianas (attB) como del fago (attP), que forman los sitios en los que se da la recombianción entre ellos y el ADN del fago se integra con el ADN BACTERIANO, durante la LISOGENIA.
Integrasas
Recombinasas que insertan ADN exógeno en el genoma huesped. Algunos ejemplos son las proteinas codificadas por los GENES POL de los RETROVIRIDAE y también por los BACTERIÓFAGOS temperados, de los que el más conocido es el BACTERIÓFAGO LAMBDA.
Bacteriófago mu
Un Colifago (género de virus similares al mu, família MYOVIRIDAE) templado, compuesto por una molécula lineal de ADN de doble hebra, capaz de insertarse al azar en cualquier punto del cromosoma hospedero. Frecuentemente causa mutación, al interrumpir la continuidad del OPERÓN bacteriano en el sitio de inserción.
Proteínas de Escherichia coli
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
Sitios de Unión
Operón
Integración Viral
Inserción del ADN viral en el ADN de la célula huesped. Incluye la integración del ADN de fago en el ADN bacteriano (LISOGENIA) para formar un profago(PRÓFAGOS) o la integración del ADN retroviral con el ADN celular para formar un PROVIRUS.
Huella de ADN
Método para determinar la especificidad de secuencia de las proteínas que enlazan con el ADN. La dermatoglifia del ADN utiliza un agente que daña el ADN (ya sea un reactivo químico o una nucleasa) que rompe el ADN en cada par de bases. La ruptura del ADN es inhibida donde el ligando enlaza con el ADN.
Factor Proteico para Inverción de Estimulación
Proteina de unión a ADN muy abundante, cuya expresión está muy relacionada con la fase de crecimiento bacteriano. La proteina tiene una función en la regulación de la topología del ADN y la activación de la transcripción del ARN RIBOSÓMICO. Se identificó originalmente como un factor necesario para la estimulación de inversión para la recombinasa Hin de la SALMONELLA y la recombinasa de sitio específico Gin del BACTERIÓFAGO MU.
ADN Nucleotidiltransferasas
Conformación de Ácido Nucleico
Transcripción Genética
Elementos Transponibles de ADN
Segmentos discretos de ADN que pueden escindirse y reintegrarse a otro sitio del genoma. La mayoría son inactivos, es decir, no se han encontrado fuera del estado integrado. Los elementos transportables de ADN incluyen los elementos SI bacterianos (secuencias de inserción), los elementos Tn, los elementos controladores del maíz Ac y Ds, Drosophila P, elementos gitanos y pogo, los elementos humanos Tigger y los elementos Tc y marinos que se encuentran en todo el reino animal.
Desoxirribonucleasa I
Enzima que es capaz de hidrolizar el ADN altamente polimerizado quebrando los enlaces fosfodiéster, preferencialmente adyacentes a un nucleótido de pirimidina. Cataliza la segmentación endonucleolítica del ADN dando lugar a los productos finales 5'-fosfodi- y oligonucleótido. La enzima tiene preferencia por el ADN de cadena doble. EC 3.1.21.1 (anteriormente EC 3.1.4.5).
ARN Polimerasas Dirigidas por ADN
Enzimas que catalizan la extensión dirigida por el molde de ADN, del terminal 3' de una cadena de ARN, un nucleótido cada vez. Pueden iniciar una cadena de nuevo. En eucariotes, se han distinguido tres formas de la enzima en base a la sensibilidad a la alfa-amanitina y al tipo de ARN sintetizado. (Adaptación del original: Enzyme Nomenclature, 1992).
Recombinación Genética
Producción de nuevos ordenamientos del ADN por varios mecanismos tales como variación y segregación, INTERCAMBIO GENÉTICO, CONVERSIÓN GÉNICA, TRANSFORMACIÓN GENÉTICA, CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA o infección mixta por virus.
Transposasas
Enzimas que recombinan segmentos de ADN mediante un proceso que implica la formación de una sinapsis entre dos hélices de ADN, la división de cadenas simples de cada hélice de ADN y el enlace de una cadena de ADN de una hélice de ADN a otra. La estructura resultante de ADN se conoce como unión Hollida, que puede ser resuelta por REPLICACION DEL ADN o por RESOLVASAS DE UNION HOLLIDAY.
Factor sigma
Lisogenia
Fenómeno por el cual un fago temperado se incorpora al ADN de la bacteria huesped, estableciéndose un tipo de relación simbiótica entre el profago (PROFAGOS) y la bacteria, de modo que se da una perpetuación del profago en todos los decendientes de la bacteria. Hasta que la inducción (ACTIVACIÓN VIRAL) por varios agentes, como la radiación ultravioleta, libera al fago, que entonces se convierte en virulento y lisa la bacteria.
ADN Superhelicoidal
ADN duplex circular aislado a partir de los virus, bacterias y mitocondrias en forma superenrrollada o superdoblado. Este ADN superhelicoidal es rico en energía libre. Durante la transcripción, la magnitud de la iniciación es proporcional a la superhelicoidalidad del ADN.
Proteína Receptora de AMP Cíclico
Regulador transcripcional en procariotes que, cuando se activa por la unión del AMP cíclico, actúa sobre varios promotores. La proteína receptora del AMP cíclico se identificó originalmente como un catabolito de la proteína activadora del gen. Luego se demostró que regulaba varias funciones no relacionadas con el catabolismo, y que podía ser un regulador negativo o positivo de la transcripción. Los receptores del AMP cíclico en la superficie celular no se incluyen (RECEPTORES DE AMP CÍCLICO), ni las proteínas citoplasmáticas receptoras de AMP cíclico de los eucariotes, que son las subunidades reguladoras de las PROTEINO QUINASAS DEPENDIENTES DE AMP.
Unión Proteica
Mapeo Restrictivo
Mutación
Secuencia de Aminoácidos
Colifagos
Virus cuyo hospedero es la Escherichia coli.
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Factores R
Clase de plásmidos que transfieren la resistencia a antibióticos desde una bacteria a otra por conjugación.
Secuencias Reguladoras de Ácidos Nucleicos
beta-Galactosidasa
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de residuos terminales, no reductores de beta-D-galactosa en los beta-galactósidos. La deficiencia de beta-galactosidasa A1 puede causar la GANGLIOSIDOSIS GM1.
Secuencia de Consenso
Secuencia teórica de nucleótidos o aminoácidos en la cual cada nucleótido o aminoácido es él que se presenta más frecuentemente en ese sitio en las diferentes secuencias que ocurren en la naturaleza. La frase tambien se refiere a una secuencia real que se aproxima al consenso teórico. Un grupo de secuencias conservadas conocidas es representado por una secuencia de consenso. Las estructuras proteicas supersecundarias comúnmente observadas (MOTIVOS DE AMINOÁCIDOS) están frecuentemente formadas por secuencias conservadas.
Conjugación Genética
Proceso parasexual en las BACTERIAS, ALGAS, HONGOS y EUCARIOTAS ciliados para lograr el intercambio de material cromosómico durante la fusión de dos células. En las bacterias, es una transferencia unidireccional del material genético; en los protozoos es un intercambio bidireccional. En las algas y hongos, es una forma de reproducción sexual, con la unión de gametos masculinos y femeninos.
Origen de Réplica
Secuencia única de ADN de un replicón en la que se inicia la REPLICACIÓN DEL ADN y prosigue bidireccional o unidireccionalmente. Contiene los sitios en que ocurre la primera separación de las cadenas complementarias, se sintetiza un primer ARN, y tiene lugar el cambio del primer ARN a la síntesis de ADN. (Adaptación del original: Rieger et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed).
ADN Helicasas
Proteínas que catalizan la reversión del dúplex de ADN durante la replicación mediante la unión cooperativa para las regiones de cadena simple de ADN o para las regiones cortas de ADN dúplex que están experimentando apertura transitoria. Además las helicasas ADN son ATPasas dependientes de ADN que aprovechan la energía libre de la hidrólisis de ATP para trasladar los filamentos de ADN.
Proteínas Recombinantes de Fusión
Endodesoxirribonucleasas
Clonación Molecular
Mutagénesis
Proceso de generación de una MUTACIÓN genética. Puede darse espontáneamente o ser inducida por MUTÁGENOS.