Factor sigma: Proteína que es una subunidad de la ARN polimerasa. Efectúa la iniciación de cadenas específicas de ARN a partir del ADN.Regulación Bacteriana de la Expresión Génica: Cualquiera de los procesos mediante los cuales los factores citoplasmáticos o intercelulares influyen sobre el control diferencial de la acción del gen en las bacterias.Receptores sigma: Clase de receptores de la superficie celular reconocida por su perfil farmacológico. Los receptores sigma se consideraron originalmente como receptores opioides debido a que se unen a ciertos opioides sintéticos. Sin embargo, ellos interactúan también con una variedad de otras drogas psicoactivas, y su ligando endógeno no se conoce (aunque puede reaccionar con ciertos esteroides endógenos). Los receptores sigma se encuentran en los sistemas inmune, endocrino, y nervioso, y en algunos tejidos periféricos.ARN Polimerasa Sigma 54: ARN polimerasa dirigida por el ADN que se encuentra en las BACTERIAS. Es una holoenzima que consta de múltiples subunidades, entre las que figura el factor sigma 54.Proteínas Bacterianas: Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.ARN Polimerasas Dirigidas por ADN: Enzimas que catalizan la extensión dirigida por el molde de ADN, del terminal 3' de una cadena de ARN, un nucleótido cada vez. Pueden iniciar una cadena de nuevo. En eucariotes, se han distinguido tres formas de la enzima en base a la sensibilidad a la alfa-amanitina y al tipo de ARN sintetizado. (Adaptación del original: Enzyme Nomenclature, 1992).Bacillus subtilis: Especie de bacteria grampositiva que es un saprofito común en el suelo y el agua.Regulón: En eucariotas, es una unidad genética formada por un grupo de genes no contiguos controlados por un regulador génico único. En bacterias, los regulones están formados por sistemas regulatorios globales implicados en la interacción de dominios regulatorios pleiotrópicos. Estos dominios están constituidos por varios operones (OPERÓN).Genes Bacterianos: Unidades hereditarias funcionales de las BACTERIAS.Transcripción Genética: Biosíntesis del ARN dirigida por un patrón de ADN. La biosíntesis del ADN a partir del modelo de ARN se llama TRANSCRIPCIÓN REVERSA.Datos de Secuencia Molecular: Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.Regiones Promotoras Genéticas: Secuencias de ADN que son reconocidas (directa o indirectamente) y enlazadas por una ARN polimerasa dependiente de ADN durante la iniciación de la transcripción. Entre las secuencias altamente conservadas dentro del promotor están la caja de Pribnow en las bacterias y la TATA BOX en los eucariotes.Secuencia de Bases: Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.Escherichia coli: Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).Operón: En las bacterias, grupo de genes metabólicamente relacionados, con un promotor común, cuya transcripción a un ARN MENSAJERO policistrónico único está bajo control de una región OPERADORA.Esporas Bacterianas: Cuerpos metabólicamente inactivos, resistentes al calor y a las coloraciones, formados dentro de las células vegetativas de las bacterias del género Bacillus y Clostridium.Factores de Transcripción: Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.Secuencia de Aminoácidos: El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.Proteínas de Escherichia coli: Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.Mutación: Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.ADN Bacteriano: Ácido desoxirribonucleico que constituye el material genético de las bacterias.Respuesta al Choque Térmico: Constelación de respuestas que ocurren cuando un organismo es expuesto al calor excesivo. Las respuestas incluyen síntesis de nuevas proteínas, y regulación otras.Holoenzimas: Enzimas catalíticamente activas que se forman por la combinación de una apoenzima (APOENZIMAS) y sus cofactores y grupos prostéticos apropiados.Proteínas de Choque Térmico: Las proteínas que se sintetizan en los organismos eucariotes y las bacterias en respuesta a la hipertermia y a otras tensiones ambientales. Ellos incrementan la tolerancia térmica y realizan funciones esenciales para la supervivencia celular bajo estas condiciones.Eliminación de Gen: Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.ARN Bacteriano: Ácido ribonucleico de bacterias que desempeña funciones reguladoras y catalíticas así como participa en la síntesis de proteínas.Synechocystis: Un forma del género CYANOBACTERIA unicelular del orden de los Chroococcales. Ninguna de las especies fijan NITRÓGENO, no hay vacuolas de gas, y nunca se producen capas en la envoltura.Mutagénesis Insercional: Mutagénesis en la que la mutación es provocada por la introducción de secuencias extrañas de ADN en una secuencia génica o extragénica. Esto puede ocurrir espontáneamente in vivo o puede inducirse experimentalmente in vivo o in vitro. Las inserciones de ADN provírico en un protooncogén celular o cerca de él pueden interrumpir la TRADUCCIÓN GENÉTICA de las secuencias codificadoras o interferir con el reconocimiento de elementos reguladors y pueden originar una expresión no regulada del protooncogén, con la consiguiente formación de tumores.Sitio de Iniciación de la Transcripción: El primer nucleótido de una secuencia de ADN transcrita donde la ARN polimerasa (ARN POLIMERASAS DIRIGIDAS POR ADN) comienza la síntesis de la transcripción de ARN.Alginatos: Sales de ácido algínico extraídas de algas marinas y empleadas para hacer impresiones dentales y como material absorbente para vendajes quirúrgicos.Fusión Artificial Génica: Fusión in vitro de GENES con técnicas de ADN RECOMBINANTE para analizar el comportamiento de las proteínas o la REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA o para combinar funciones proteicas para usos específicos médicos o industriales.Clonación Molecular: Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.Pseudomonas aeruginosa: Especie de bacteria aerobia gram negativa en forma de bastoncillo que comúnmente se aisla de muestras clínicas (heridas, quemaduras e infecciones del tracto urinario). Se encuentra también ampliamente disminuida en el suelo y el agua. La P. aeruginosa es un agente importante de las infecciones nosocomiales.Pentazocina: El primer analgésico mezcla de agonista-antagonista a ser comercializado. Es un agonista de los receptores kappa y sigma y tiene una acción antagonista débil del receptor mu.Virulencia: Grado de patogenicidad dentro de un grupo o especie de microorganismos o virus, indicado por la tasa de mortalidad y/o la capacidad del organismo para invadir los tejidos del huésped. La capacidad patogénica de un organismo viene determinada por los FACTORES DE VIRULENCIA.Prueba de Complementación Genética: Una prueba que se usa para determinar si tendrá lugar o no la complementación (compensación en forma de dominancia) en una célula con un fenotipo mutante dado cuando otro genoma mutante, que codifica el mismo fenotipo mutante, se introduce en dicha célula.Streptomyces coelicolor: Un actinomiceto que vive en el suelo con un ciclo de vida complejo que implica elrecimiento micelial ylaa formación de esporas. Participa en la producción de numerosos ANTIBIÓTICOS médicamente importantes.Flagelos: En las bacterias, es un apéndice de movibilidad en forma de látigo presente en la superficie de algunas especies. Los flagelos están compuestos de una proteína llamada flagelina. La bacteria puede tener un único flagelo, un grupo de éstos en un polo o múltiples flagelos que cubran toda la superficie. En las eucariótas, los flagelos son extensiones protoplasmáticas en forma de filamentos que se utilizan para impulsar a los flagelados y la esperma. Los flagelos tienen la misma estructura básica que los CILIOS pero son más largos con relación al tamaño de las células que lo presentan y se encuentran en un número mucho menor.(King & Stansfield, A Dictionary of Genetics, 4th ed)Homología de Secuencia de Aminoácido: Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.beta-Galactosidasa: Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de residuos terminales, no reductores de beta-D-galactosa en los beta-galactósidos. La deficiencia de beta-galactosidasa A1 puede causar la GANGLIOSIDOSIS GM1.Ácidos Hexurónicos: Término utilizado para designar a los ácidos tetrahidroxi aldehídicos obtenidos por la oxidación de azúcares hexosa, es decir, ácido glucurónico, ácido galacturónico, etc. Históricamente el nombre de ácido hexurónico le fue otorgado al ácido ascórbico.Proteínas de Unión al ADN: Proteínas que se unen al ADN. La familia incluye proteínas que se unen tanto al ADN de una o de dos cadenas y que incluyen también a proteínas que se unen específicamente al ADN en el suero las que pueden utilizarse como marcadores de enfermedades malignas.Ácido Glucurónico: Ácido de azúcar formado por la oxidación del carbono C-6 de la GLUCOSA. Además de ser un metabolito intermediario clave de la vía del ácido urónico, el ácido glucurónico también juega un rol en la desintoxicación de ciertas drogas y toxinas mediante la conjugación con ellas para formar GLUCURÓNIDOS.Calor: Presencia de calor o calentamiento o de una temperatura notablemente superior a una norma acostumbrada.Genoma Bacteriano: Complemento genético de una BACTERIA, representado en su ADN.Alineación de Secuencia: Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.Rhizobium etli: Una especie de bacteria gramnegativa e inoculante de nitrógeno de PHASEOLUS vulgaris.Plásmidos: Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.Unión Proteica: Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.Flagelina: Una proteína con un peso molecular de 40,000 aislada de los flagelos bacterianos. En una concentración adecuada de pH y sal, tres manómeros de flagelina pueden reagregarse espontáneamente para formar estructuras que parecen idénticas al flagelo intacto.Estrés Fisiológico: El efecto desfavorable de los factores ambientales (estresantes) en las funciones fisiológicas de un organismo. El estrés fisiológico prolongado sin resolver puede afectar la HOMEOSTASIS del organismo, y puede conducir al daño o a afecciones.Guanosina Tetrafosfato: Guanosina 5'-difosfato 2'(3')-difosfato. Nucleótido de guanina que contiene cuatro grupos fosfato. Dos que están esterificados a la molécula de azúcar en la posición 5' y los otros dos en las posiciones 2' o 3'. Este nucleótido sirve como mensajero para detener la síntesis de ARN ribosómico cuando no se dispone de aminoácidos para la síntesis de proteínas. Sinónimo: mancha mágica I.Presión Osmótica: La presión necesaria para impedir el paso del solvente a través de una membrana semipermeable que separa un solvente puro de una solución de solvente y soluto o que separa a diferentes concentraciones de una solución. Es proporcional a la osmolalidad de la solución.Plastidios: Organelos citoplásmicos de células vegetales y de algas capaces de autoreplicarse, que contienen pigmentos y pueden sintetizar y acumular varias sustancias. El GENOMA DE PLASTIDIOS es utilizado en estudios filogenéticos.Pseudomonas fluorescens: Especie de bacteria fluorescente no patógena que se encuentra en las heces, aguas albañales, el suelo y el agua, y que liquifica a la gelatina.Proteínas 14-3-3: Amplia familia de proteínas adaptadoras de transducción de señales presentes en una amplia variedad de eucariotas. Son proteínas de unión a FOSFOSERINA y FOSFOTREONINA implicadas en importantes procesos celulares, incluyendo TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL; control de CICLO CELULAR; APOPTOSIS, y respuestas al estrés celular. Las proteínas 14-3-3 funcionan mediante la interacción con otras proteínas de transducción de señales y efectúan cambios en su actividad enzimática y localización subcelular. El nombre 14-3-3 deriva de designaciones numéricas utilizadas en los patrones de fraccionamiento de las proteínas patrones.Fenazocina: Un analgésico opioide con usos similares a la MORFINA.Homología de Secuencia de Ácido Nucleico: Correspondencia secuencial de nucleótidos en una molécula de ácido nucleico con los de otra molécula de ácido nucleico. La homología de secuencia es una indicación de la relación genética de organismos diferentes y la función del gen.Análisis de Secuencia de ADN: Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.Bacitracina: Un complejo de antibióticos péptidos cíclicos producidos por la cepa Tracy-I del Bacillus subtilis. La preparación comercial es una mezcla de al menos nueve bacitracinas, siendo la bacitracina A el constituyente principal. Se usa tópicamente para tratar infecciones abiertas como ezcemas infectados y úlceras dérmicas infectadas.Mapeo Restrictivo: Uso de endonucleasas de restricción para analizar y generar un mapa físico de los genomas, genes u otros segmentos del ADN.Proteasas ATP-Dependientes: Proteasas que contienen dominios núcleo proteolíticos y dominios reguladores que contienen ATPasa. Están generalmente comprimidos en grandes ensamblajes de multi-subunidades. Los dominios pueden ocurrir dentro de una sola cadena de péptidos o en distintas subunidades.Sitios de Unión: Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.Mycobacterium tuberculosis: Especie de bacterias grampositivas y aerobias que producen TUBERCULOSIS en humanos, otros primates, BOVINOS, PERROS y algunos animales que tienen contacto con el hombre. El crecimiento tiende a ser en masas en forma de cordón, en serpentina, en las que los bacilos muestan una disposición paralela.Salmonella typhimurium: Serotipo de Salmonella entérica que es agente frecuente de la gastroenteritis por Salmonella en humanos. También produce la FIEBRE PARATIROIDEA.Mutagénesis: Proceso de generación de una MUTACIÓN genética. Puede darse espontáneamente o ser inducida por MUTÁGENOS.Genes Reguladores: Genes que regulan o circunscriben la actividad de otros genes, específicamente genes que codifican para PROTEINAS o ARNs, que tienen funciones de REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA.Sinorhizobium meliloti: Especie de bacteria gram negativa, aerobia que produce la formación de nódulos en las raíces de algunos, pero no en todos, los tipos de trébol dulce, alfalfa y alholva.Operón Lac: Unidad genética formada por tres genes estructurales, un operador y un gen regulatorio. El gen regulatorio controla la síntesis de los tres genes estructurales: BETA-GALACTOSIDASA, permeasa de beta-galactósidos (involucrada con el metabolismo de la lactosa) y la beta-tiogalatósido acetiltransferasa.Streptomyces aureofaciens: Actinomiceto del que se obtiene el antibiótico CLORTETRACICLINA.Diamida: Un reactivo sulfidrílico que oxida los grupos sulfidrilo a la forma de disulfuro. Es un agente sensibilizante a las radiaciones para las células de mamíferos y bacterias anóxicas.Secuencia de Consenso: Secuencia teórica de nucleótidos o aminoácidos en la cual cada nucleótido o aminoácido es él que se presenta más frecuentemente en ese sitio en las diferentes secuencias que ocurren en la naturaleza. La frase tambien se refiere a una secuencia real que se aproxima al consenso teórico. Un grupo de secuencias conservadas conocidas es representado por una secuencia de consenso. Las estructuras proteicas supersecundarias comúnmente observadas (MOTIVOS DE AMINOÁCIDOS) están frecuentemente formadas por secuencias conservadas.Perfilación de la Expresión Génica: La determinación de un patrón de genes expresados al nivel de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA bajo circunstancias específicas o en una célula específica.Proteína de Factor 1 del Huésped: Factor de integración del huésped, que originariamente fue identificado como una proteína bacteriana necesaria para la integración del bacteriófago Q beta (ALOLLEVIVIRUS). Su función celular puede ser la de regular la estabilidad y procesamiento del ARNm ya que se une estrechamente al poli(A)ARN e interfiere con las uniones ribosómicas.Clostridium acetobutylicum: Una especie de bacteria gram-positiva de la familia Clostridiaceae, usada para la producción industrial de SOLVENTES.Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos: La hibridación de una muestra de ácido nucleico a un conjunto muy grande de SONDAS DE OLIGONUCLEÓTIDOS, que han sido unidos individualmente en columnas y filas a un soporte sólido, para determinar una SECUENCIA DE BASES, o para detectar variaciones en una secuencia de genes, EXPRESION GENÉTICA, o para MAPEO GENÉTICO.Proteínas Recombinantes de Fusión: Proteínas recombinantes que se producen por TRADUCCIÓN GENÉTICA de genes de fusión formados por la combinación de SECUENCIAS REGULADORAS DEL ÁCIDO NUCLEICO de uno o mas genes con la proteina que codifica secuencias de uno o mas genes.Factor Rho: Proteína a la que afecta la terminación de la síntesis del ARN durante el proceso de transcripción genética a través de la disociación del complejo ternario de transcripción ARN-POLIMERASA ADN-DEPENDIENTES de la terminación del gen.Ácidos: Compuestos químicos que ceden iones de hidrógeno o protones disueltos en agua, que pueden ser sustituidos por metales o radicales básicos, o reaccionan con bases formando sales y agua (neutralización). Una extensión del término incluye a sustancias disueltas en medios distintos del agua. (Traducción libre del original: Grant & Hackh's Chemical Dictionary, 5th ed)Proteínas PII Reguladoras del Nitrógeno: Familia de proteínas adaptadoras de la transducción de señales que controlan el METABOLISMO DEL NITRÓGENO. Se encuentran principalmente en los procariotas.Myxococcus xanthus: Especie de bacterias deslizantes que se encuentran en el suelo así como en la superficie del agua dulce y en el agua de mar costera.Caulobacter crescentus: Especie de bacterias gramnegativas que están formadas por células vibroides delgadas.Pseudomonas putida: Especie de bacteria gramnegativa aislada del suelo y el agua así como de muestras clínicas. Ocasionalmente es un patógeno oportunista.Adaptación Fisiológica: Cambios biológicos no genéticos de un organismo en respuesta a los desafíos de su AMBIENTE.Proteínas de la Membrana Bacteriana Externa: Proteínas aisladas de la membrana externa de bacterias gramnegativas.Fenotipo: Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.Exopeptidasas: Una sub-clase de PÉPTIDO HIDROLASAS que sólo actúan cerca de los extremos de las cadenas de polipéptidos.Exonucleasas: Enzimas que catalizan la liberación de mononucleótidos mediante la hidrólisis del enlace terminal de cadenas de desoxirribonucleótidos o ribonucleótidos.Proteínas Represoras: Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.Secuencia Conservada: Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.Bradyrhizobium: Género de bacterias aerobias gramnegativas en forma de bastoncillo que usualmente contiene gránulos de poli-beta-hidroxibutirato. Característicamente invaden las raíces pilosas de las plantas leguminosas y actúan como simbiontes intracelulares.Secuencias Hélice-Giro-Hélice: Primer motivo proteico reconocido que se une al ADN. Los motivos de hélice-giro-hélice fueron identificados originalmente en las proteínas bacterianas, pero desde entonces se han hallado en cientos de PROTEINAS QUE SE UNEN AL ADN tanto de eucariotas como de procariotas. Estan formados por dos alfa hélices conectadas por una corta cadena extendida de aminoácidos que constituye el "giro". Las dos hélices se mantienen en un ángulo fijo, ante todo mediante interacciones entre las dos hélices.Viabilidad Microbiana: Capacidad de un microbio para sobrevivir en determinadas condiciones. También puede relacionarse con la capacidad de replicación de una colonia.Transactivadores: Productos genéticos difusibles que actúan sobre moléculas homólogas o heterólogas de ADN viral o celular para regular la expresión de proteínas.Permanganato de Potasio: Sal de potasio del ácido permangánico (HMnO4). Un compuesto hidrosoluble, altamente oxidante con cristales púrpura y sabor dulce.