Secuencias Reguladoras de Ácidos Nucleicos
Secuencias de ácido nucléico que intervienen en la regulación de la expresión de genes.
Elementos Reguladores de la Transcripción
Secuencias de nucleótidos de un gen que están involucradas en la regulación de la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA.
Regiones Promotoras Genéticas
Elementos de Facilitación Genéticos
Secuencia de Bases
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Transcripción Genética
Genes Reguladores
Genes que regulan o circunscriben la actividad de otros genes, específicamente genes que codifican para PROTEINAS o ARNs, que tienen funciones de REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA.
Regulación de la Expresión Génica
Cualquiera de los procesos por los cuales factores nucleares, citoplasmáticos o intercelulares influyen en el control diferencial (inducción o represión), de la acción de genes a nivel de transcripción o traducción.
Factores de Transcripción
Sustancias endógenas, usualmente proteínas, que son efectivas en la iniciación, estimulación, o terminación del proceso de transcripción genética.
Elementos de Respuesta
Secuencias de nucleótidos, generalmente al inicio de la cadena, que son reconocidas por factores de transcripción reguladores específicos, provocando la respuesta del gen a los distintos agentes reguladores. Estos elementos pueden encontrarse tanto en regiones promotoras como intensificadoras.
Proteína 1 de Unión a los Elementos Reguladores de Esteroles
Proteína de unión a los elementos reguladores de esteroles que regula la expresión de los GENES implicados en el metabolismo de los ÁCIDOS GRASOS y en la LIPOGÉNESIS. Existen dos isoformas mayores de la proteína debido al EMPALME ALTERNATIVO.
Elementos Transponibles de ADN
Segmentos discretos de ADN que pueden escindirse y reintegrarse a otro sitio del genoma. La mayoría son inactivos, es decir, no se han encontrado fuera del estado integrado. Los elementos transportables de ADN incluyen los elementos SI bacterianos (secuencias de inserción), los elementos Tn, los elementos controladores del maíz Ac y Ds, Drosophila P, elementos gitanos y pogo, los elementos humanos Tigger y los elementos Tc y marinos que se encuentran en todo el reino animal.
Proteínas de Unión al ADN
Sitios de Unión
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico
Cloranfenicol O-Acetiltransferasa
Enzima que cataliza la acetilación del cloranfenicol para formar cloranfenicol 3-acetato. Como el cloranfenicol 3-acetato no se enlaza con los ribosomas bacterianos y no es un inhibidor de peptidiltransferasa, la enzima es la responsable de la resistencia natural al cloranfenicol en las bacterias. La enzima, de la cual se conocen variantes, está presente en bacterias tanto gramnegativas como granpositivas. EC 2.3.1.28.
Proteína 2 de Unión a Elementos Reguladores de Esteroles
Genes Reporteros
Genes cuya expresión es fácilmente detectable y portanto se emplean para estudiar la actividad promotora en muhcas posiciones en un genoma diana. En la tecnología del ADN recombinante, estos genes pueden unirse a una región promotora de interés.
Transfección
Incorporación de ADN desnudo o purificado dentro de las CÉLULAS, usualmente eucariotas. Es similar a la TRANSFORMACION BACTERIANA y se utiliza de forma rutinaria en las TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GEN.
ARN Mensajero
Secuencias de ARN que funcionan como molde para la síntesis de proteínas. Los ARNm bacterianos generalmente son transcriptos primarios ya que no requieren de procesamiento post-transcripcional. Los ARNm eucarioticos se sintetizan en el núcleo y deben exportarse hacia el citoplasma para la traducción. La mayoría de los ARNm de eucariotes tienen una secuencia de ácido poliadenílico en el extremo 3', conocida como el extremo poli(A). La función de este extremo no se conoce con exactitud, pero puede jugar un papel en la exportación del ARNm maduro desdel el núcleo así como ayuda a estabilizar algunas moléculas de ARNm al retardar su degradación en el citoplasma.
Desoxirribonucleasa I
Enzima que es capaz de hidrolizar el ADN altamente polimerizado quebrando los enlaces fosfodiéster, preferencialmente adyacentes a un nucleótido de pirimidina. Cataliza la segmentación endonucleolítica del ADN dando lugar a los productos finales 5'-fosfodi- y oligonucleótido. La enzima tiene preferencia por el ADN de cadena doble. EC 3.1.21.1 (anteriormente EC 3.1.4.5).
ADN
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Secuencia Conservada
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Intrones
Secuencias no codificadoras e interventoras de ADN que son transcriptas, pero que son removidas en la transcripción génica primaria y degradadas rápidamente durante la maduración del ARN mensajero. La mayoría de los genes en los núcleos de eucariotes contienen intronas, al igual que los genes mitocondriales y del cloroplasto.
Línea Celular
Plásmidos
Moléculas extracromosómicas generalmente de ADN CIRCULAR que son auto-replicantes y transferibles de un organismo a otro. Se encuentran en distintas especies bacterianas, arqueales, micóticas, de algas y vegetales. Son utilizadas en INGENIERIA GENETICA como VECTORES DE CLONACION.
Proteínas Nucleares
Proteínas que se encuentran en los núcleos de las células. No se confunden con las NUCLEOPROTEÍINAS que son proteínas conjugadas con ácidos nucleicos, que no están necesariamente presentes en el núcleo.
Clonación Molecular
Inserción de moléculas de ADN recombinante de fuentes procariotas y/o eucariotas en un vehículo replicador, como el vector de virus o plásmido, y la introducción de las moléculas híbridas resultantes en células receptoras sin alterar la viabilidad de tales células.
Mapeo Restrictivo
Eliminación de Secuencia
Secuencias Reguladoras de Ácido Ribonucleico
Secuencias dentro del ARN que regulan el procesamiento, la estabilidad (ESTABILIDAD DEL ARN) o la traducción de ARN (vea BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS).
Secuencias Repetitivas de Ácidos Nucleicos
Secuencias de ADN o ARN que se producen en múltiples copias. Existen varios tipos: SECUENCIAS REPETITIVAS ESPARCIDAS son copias de elementos transponibles (ELEMENTOS TRANSPONIBLES DE ADN o RETROELEMENTOS) dispersos a través del genoma. Las SECUENCIAS REPETIDAS TERMINALES flanquean ambos extremos de una otra secuencia, por ejemplo, las repeticiones terminales largas (LTRs) en los RETROVIRUS. Las variaciones pueden ser repeticiones directas, ocurriendo en la misma dirección, o repeticiones invertidas, en dirección opuesta a cada una. Las SECUENCIAS REPETIDAS EN TANDEM son copias que se encuentran adyacentes unos a otros, directas o invertidas (SECUENCIAS REPETIDAS INVERTIDAS).
Proteínas Potenciadoras de Unión a CCAAT
Una clase de proteínas que fueron originariamente identificadas por su habilidad de ligarse a la secuencia de CCAAT del ADN. La proteína potenciadora de unión a CCAAT típica forma dímeros y consiste de un dominio de activación, una región básica de unión a ADN, y un dominio de dimerización rico en leucina (LEUCINA ZIPPERS). FACTOR DE ENLACE A CCAAT es estructuralmente un tipo distinto de proteína potenciadora de unión a CCAAT que consiste de un trímero de tres diferentes subunidades.
Ratones Transgénicos
Mutación
Huella de ADN
Método para determinar la especificidad de secuencia de las proteínas que enlazan con el ADN. La dermatoglifia del ADN utiliza un agente que daña el ADN (ya sea un reactivo químico o una nucleasa) que rompe el ADN en cada par de bases. La ruptura del ADN es inhibida donde el ligando enlaza con el ADN.
Secuencia de Aminoácidos
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Exones
Las partes de una transcripción de un GEN que queda después que los INTRONES se remueven. Son ensambles que se convierten en un ARN MENSAJERO u otro ARN funcional.
Región de Flanqueo 5'
Región del ADN que bordea el extremo 5' de una unidad de transcripción y en la que se localizan diversas secuencias reguladoras.
Unión Proteica
Proteínas de Unión a los Elementos Reguladores de Esteroles
Factores de transcripción de cremallera de leucinas hélice-asa-hélice de carácter básico que se unen al elemento regulador de esteroles TCACNCCAC. Se sintetizan como precursores que son ensartados en las MEMBRANAS del RETÍCULO ENDOPLÁSMICO.
Activación Transcripcional
Luciferasas
Enzimas que oxidan ciertas SUSTANCIAS LUMINISCENTES para emitir luz (LUMINISCENCIA). Las luciferasas de diferentes organismos han evolucionado de distinto modo, por lo que tienen diferentes estructuras y sustratos.
Genes
Análisis de Secuencia de ADN
Un proceso de múltiples etapas que incluye la clonación,mapeo del genoma, subclonación, determinación de la SECUENCIA DE BASES, y análisis de la información.
Cartilla de ADN
Secuencias cortas de ADN (generalmente alrededor de 10 pares de bases) que son complementarias a las secuencias de ARN mensajero y que permiten que la transcriptasa inversa comience a copiar las secuencias adyacentes del ARNm. Las cartillas se usan con frecuencia en las técnicas de biología y genética molecular.
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Factor de Transcripción Sp1
Células HeLa
Secuencia de Consenso
Secuencia teórica de nucleótidos o aminoácidos en la cual cada nucleótido o aminoácido es él que se presenta más frecuentemente en ese sitio en las diferentes secuencias que ocurren en la naturaleza. La frase tambien se refiere a una secuencia real que se aproxima al consenso teórico. Un grupo de secuencias conservadas conocidas es representado por una secuencia de consenso. Las estructuras proteicas supersecundarias comúnmente observadas (MOTIVOS DE AMINOÁCIDOS) están frecuentemente formadas por secuencias conservadas.
Proteínas Represoras
Proteínas que mantienen la inactividad de la transcripción de GENES específicos u OPERONES. Las clásicas proteínas represoras son proteínas de unión a ADN que normalmente están vinculados a la REGIÓN OPERADORA de un operon, o las SEQUENCIAS DE POTENCIADOR de un gen hasta que ocurre una señal que causa su liberación.
Regulación Enzimológica de la Expresión Génica
Oligoelementos
Un grupo de elementos químicos que se necesitan en cantidades diminutas para el crecimiento, desarrollo y funcionamiento adecuado de un organismo. (Traduccíon libre del original: McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 4th ed)
Elementos Alu
La familia de la secuencia Alu (nombrada por la enzima endonucleasa de restricción Alu I) es el elemento repetido diseminado más altamente repetido en el ser humano (más de un millón de copias). Se deriva del componente 7SL del ARN de la PARTICULA DE RECONOCIMIENTO DE SEÑAL y contiene un promotor de la ARN polimerasa III. La transposición de este elemento a las señales de las regiones génicas codificadoras o reguladoras es responsable de muchas enfemedades hereditarias.
Análisis de Elementos Finitos
Elementos
En química una sustancia simple es aquella que no puede ser descompuesta por medios químicos y que está constituída por átomos que son idénticos en su configuración electrónica periférica y por consiguiente en sus propiedades químicas y también en el número de protones de sus núcleos, pero que pueden diferir en el número de electrones de sus núcleos y por ende en su número atómico y sus propiedades radioactivas. (Dorland, 28a ed)
Transgenes
Genes que son introducidos en un organismo empleando TÉCNICAS DE TRANSFERENCIA DE GENES.
Elementos Silenciadores Transcripcionales
Secuencias de ácido nucleico que están implicadas en la regulación negativa de la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA, silenciando la cromatina.
Proteínas Recombinantes de Fusión
Especificidad de Órganos
Células Tumorales Cultivadas
Transactivadores
Proteínas de Homeodominio
Proteínas que se codifican por los genes "homeobox" (GENES, HOMEOBOX) que muestran similitud estructural con ciertas proteínas unidas al ADN de procariotes y eucariotes. Las proteínas del homeodominio participan en el control de la expresión genética durante la morfogénesis y el desarrollo (REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN DEL GEN, DESARROLLO).
Modelos Genéticos
Elementos Aisladores
Secuencias de ácido nucleico reguladoras que limitan o se oponen a la acción de los ELEMENTOS DE FACILITACIÓN GENÉTICOS y definen el límite entre loci de genes regulados diferencialmente.
Regulación del Desarrollo de la Expresión Génica
Expresión Génica
Manifestación fenotípica de un gen o genes a través de los procesos de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA y .TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Cromatina
El material de los CROMOSOMAS. Es un complejo del ADN, HISTONAS y proteinas no histona (PROTEÍNAS CROMOSÓMICAS NO HISTONA)que se encuentran dentro del núcleo celular.
Mutagénesis Sitio-Dirigida
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
Regiones no Traducidas 5'
Secuencia en el extremo 5' del ARN mensajero que no codifica producto. Esta secuencia contiene el sitio de unión del ribosoma y otras secuencias que regulan la transcripción y la traducción.
Regiones no Traducidas 3'
Secuencia en el extremo 3' del ARN mensajero que no codifica producto. Esta región contiene secuencias reguladoras de la transcripción y de la traducción.
Globinas
Superfamilia de proteínas que contiene el pliegue en globina el cual se compone de 6-8 hélices alfa dispuestos en una característica de estructura envolvente HEMO.
Oligodesoxirribonucleótidos
Núcleo Celular
Cuerpo limitado por una membrana, dentro de una célula eucariota, que contiene cromosomas y uno o más nucléolos (NUCLEOLO CELULAR). La membrana nuclear consta de una membrana de doble capa perforada por un número de poros; la membrana exterior se continúa con el RETICULO ENDOPLÁSMICO. Una célula puede tener más de un núcleo.(From Singleton & Sainsbury, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology, 2d ed)
Mapeo Cromosómico
Cualquier método empleado para determinar la localización y distancias relativas entre los genes en un cromosoma.
Ensayo de Cambio de Movilidad Electroforética
Técnica electroforética para identificación de ligaciones de un compuesto al otro. Márcase un compuesto para seguir su movilidad durante la electrofóresis. Si el compuesto marcado presentarse unido a un otro compuesto, entonces la movilidad del compuesto marcado por el medio electroforético será retardada.
Familia de Multigenes
Conjunto de genes originados por la duplicación y variación de algún gen ancestral. Tales genes pueden estar agrupados en el mismo cromosoma o dispersos en diferentes cromosomas. Ejemplos de familias multigénicas incluyen aquellas que codifican las hemoglobinas, inmunoglobulinas, antígenos de histocompatibilidad, actinas, tubulinas, queratinas, colágenos, proteínas de shock térmico, proteínas adhesivas salivares, proteínas coriónicas, proteínas de las cutículas, proteínas vitelínicas y faseolinas, así como histonas, ARN ribosómico, y genes de ARN. Los tres últimos son ejemplos de genes repetidos donde cientos de genes idénticos están presentes y ordenados en forma de tándem.
Células Cultivadas
Operón Lac
Unidad genética formada por tres genes estructurales, un operador y un gen regulatorio. El gen regulatorio controla la síntesis de los tres genes estructurales: BETA-GALACTOSIDASA, permeasa de beta-galactósidos (involucrada con el metabolismo de la lactosa) y la beta-tiogalatósido acetiltransferasa.
beta-Galactosidasa
Grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de residuos terminales, no reductores de beta-D-galactosa en los beta-galactósidos. La deficiencia de beta-galactosidasa A1 puede causar la GANGLIOSIDOSIS GM1.
Sitio de Iniciación de la Transcripción
Drosophila melanogaster
Análisis Mutacional de ADN
Conformación de Ácido Nucleico
Elementos de Nucleótido Esparcido Corto
Secuencias altamente repetidas, de 100K-300K bases de largo, que contienen promotores de la ARN polimerasa III. Los elementos Alu (ELEMENTOS ALU) de los primates y los ENEC B1 de roedores se derivan del ARN 7SL, el componente ARN de la partícula de reconocimiento de señal. La mayoría de los otros ENEC se derivan de ARNt que incluye las repeticiones ampliamente diseminadas de mamíferos (RDM).
Drosophila
TATA Box
Una secuencia conservada rica en A-T que está contenida en los promotores para la ARN polimerasa II. El segmento tiene una longitud de siete pares de bases y los nucleótidos más comunmente hallados son TATAAAA.
Sondas de Oligonucleótidos
Oligonucleótidos sintéticos o naturales utilizados en estudios de hibridización con el propósito de identificar y estudiar fragmentos específicos de ácidos nucleicos, ejemplo, segmentos de ADN cercanos o que están dentro de locus específicos del gen o de genes. La sonda hibridiza con un ARNm específico, si está presente. Las técnicas convencionales utilizadas para evaluar el producto de hibridización incluyen el ensayo de dot blot, ensayo de Southern blot, y las pruebas de anticuerpos específicos de híbridos de ADN:ARN. Las marcas convencionales para la sonda incluyen el marcaje con radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina.
Regulación Viral de la Expresión Génica
Elementos de Nucleótido Esparcido Largo
Secuencias altamente repetidas, de 6K-8K pares de bases en longitud, que contienen promotores de la ARN polimerasa II. También tienen un marco de lectura abierta relacionado con la transcriptasa reversa de los retrovirus, pero no contienen largas repeticiones terminales (LRT). Las copias de la familia LINE 1 (L1) forman alrededor de 15.
Inmunoprecipitación de Cromatina
Técnica para identificar secuencias de ADN que se enlazan, en vivo, a proteínas de interés. Involucra fijación formaldehido de CROMATINA para entrelazar el ADN PROTEINAS DE ENLACE DE ADN. Después de cortar el ADN en pequeños fragmentos, los complejos de proteína ADN específicos se aislan por inmunoprecipitación con proteínas específicas de ANTICUERPOS. Luego, el ADN aislado del complejo puede ser identificado por amplificación y secuencia de RCP.
Genoma
Animales Modificados Genéticamente
Animales, o hijos de dichos animales, en los cuales se ha transferido experimentalmente material genético clonado utilizando una microinyección, bien directamente o dentro del embrión, de ADN extraño, o de tipos de células diferenciadas. Se han producido variedades transgénicas de conejos, ratas, peces, Xenopus, ovejas, cerdos y pollos utilizando genes de erizos de mar, Cándida, Drosophila, y ratas.
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Método in vitro para producir grandes cantidades de fragmentos específicos de ADN o ARN de longitud y secuencia definidas a partir de pequeñas cantidades de cortas secuencias flanqueadoras oligonucleótidas (primers). Los pasos esenciales incluyen desnaturalización termal de las moléculas diana de doble cadena, reasociación de los primers con sus secuencias complementarias, y extensión de los primers reasociados mediante síntesis enzimática con ADN polimerasa. La reacción es eficiente, específica y extremadamente sensible. Entre los usos de la reacción está el diagnóstico de enfermedades, detección de patógenos difíciles de aislar, análisis de mutaciones, pruebas genéticas, secuenciación del ADN y el análisis de relaciones evolutivas.
Genes Homeobox
Genes que codifican FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN altamente conservados que controlan la identidad posicional de las células (TIPIFICACIÓN DEL CUERPO) y la MORFOGÉNESIS a lo largo del desarrollo. Sus secuencias contienen una secuencia de 180 nucleótidos, llamada homeobox, debido a que las mutaciones de esos genes a menudo dan lugar a transformaciones homeóticas, en las que una estructura corporal reemplaza a otra. Las proteinas codificadas por los genes homeobox se llaman PROTEINAS HOMEODOMAIN.
Vectores Genéticos
Moléculas de ADN capaces de replicarse de forma autónoma dentro de una célula huésped y dentro de la cual pueden insertarse otras secuencias de ADN y de esta manera amplificarse. Muchas se derivan de PLÁSMIDOS, BACTERIÓFAGOS o VIRUS. Se usan para transportar genes foráneos a las células receptoras. Los vectores genéticos poseen un sitio replicador funcional y contienen MARCADORES GENÉTICOS para facilitar su reconocimiento selectivo.
Especificidad de la Especie
Restricción de un comportamiento característico, estructura anatómica o sistema físico, tales como la respuesta inmune, respuesta metabólica, o la variante del gen o genes a los miembros de una especie. Se refiere a la propiedad que distingue una especie de otra, pero también se utiliza para los niveles filogenéticos más altos o más bajos que el de la especie.
Biología Computacional
Campo de la biología relacionada con el desarrollo de técnicas para la recolección y manipulación de datos biológicos, y la utilización de estos datos para hacer descubrimientos biológicos o predicciones. Este campo abarca todos los métodos computacionales y teorías para la solución de problemas biológicos, incluyendo la manipulación de modelos y conjuntos de datos.
Proteínas de Drosophila
Proteínas que se originan en especies de insectos pertenecientes al género DROSOPHILA. Las proteínas de la especie mas estudiada de la drosophila, la DROSOPHILA MELANOGASTER, son las que mas interés tienen en el área de la MORFOGÉNESIS y el desarrollo.
Motivos de Nucleótidos
Comúnmente observados SECUENCIA DE BASES o nucleótidos componentes estructurales que pueden ser representados por una SECUENCIA DE CONSENSO o una SECUENCIA LOGO.
Elementos E-Box
Lugares de ADN con la secuencia de consenso CANNTG. ELEMENTOS DE FACILITACIÓN pueden contener varias copias de este elemento. Las E-cajas desempeñar un papel regulador en el control de la transcripción. Se unen con espiral de hécile-asa-hélice (bHLH) de tipo FACTORES DE TRASCRIPOCIÓN. La especificidad de unión está determinada por el heterodímero bHLH específico o una combinación de homodímero y por los nucleótidos específicos en la posición 3 y 4 de la secuencia de la E-caja.
Proteína de Unión a Elemento de Respuesta al AMP Cíclico
Biblioteca Genómica
ADN Intergénico
Cualquiera de los ADN entre los ADN que codifican genes, incluyendo a regiones no traducidas, regiones flanqueadoras 5' y 3', INTRONAS, pseudogenes no funcionales, y secuencias repetitivas no funcionales. Este ADN puede o no codificar funciones reguladoras.
ARN
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Northern Blotting
Detección del ARN que ha sido separado electroforéticamente e inmovilizado mediante secado en papel de nitrocelulosa u otro tipo de papel o membrana de nylon.
Mutagénesis
Proceso de generación de una MUTACIÓN genética. Puede darse espontáneamente o ser inducida por MUTÁGENOS.
Southern Blotting
Un método (desarrollado originalmente por E.M.Southern) para la detección del ADN que ha sido separado electroforéticamente e inmovilizado mediante secado en papel de nitrocelulosa o de otro tipo o en membrana de nylon.
Empalme Alternativo
Proceso en el cual muchas transcripciones de ARN se generan a partir de un solo gen. El empalme alternativo implica el empalme conjunto de otros conjuntos posibles de EXONAS durante el procesamiento de algunas, aunque no todas, las transcripciones del gen. Por tanto, una exona particular puede estar conectada a cualquiera de las diversas exonas alternativas para formar un ARN maduro. Las formas alternativas maduras de ARN MENSAJERO producen ISOFORMAS DE PROTEÍNAS en las que una parte de las isoformas es común, mientras que las otras partes son diferentes.
Hígado
Un gran órgano glandular lobulada en el abdomen de los vertebrados que es responsable de la desintoxicación, el metabolismo, la síntesis y el almacenamiento de varias sustancias.
ADN Complementario
ADN complementario de una sola cadena sintetizado a partir del molde del ARN por acción de la ADN polimerasa dependiente de ARN. El ADNc (es decir, ADN complementario, no ADN circular, no C-DNA) se utiliza en una variedad de experimentos de clonación molecular al igual que sirve como sonda de hibridización específica.
Empalme del ARN
Regulación Bacteriana de la Expresión Génica
Eliminación de Gen
Reordenamiento genético por la pérdida de segmentos de ADN o ARN, que acerca secuencias que normalmente están separadas aunque en vecindad próxima. Esta eliminación puede detectarse usando técnicas de citogenética y también pueden inferirse por el fenotipo, que indica la eliminación en un locus específico.
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Proteínas de Unión al ARN
Retroelementos
Elementos que se transcriben en el ARN, tienen transcripción inversa en el ADN y luego se insertan en un sitio nuevo del genoma. Las repeticiones terminales largas (RTL) similares a la de los retrovirus están contenidas en los retrotransposones y en elementos semejantes a los retrovirus. Los retroposones, como son los ELEMENTOS NUCLEOTÍDICOS MUY ENTREMEZCLADOS y los ELEMENTOS NUCLEOTÍDICOS POCO ENTREMEZCLADOS no contienen RTL.
Diferenciación Celular
Genoma Humano
Complemento génico completo contenido en un juego de cromosomas de un ser humano, ya sea haploide (derivado de un progenitor) o diploide (conjunto doble, derivado de ambos progenitores). El conjunto haploide contiene de 50 000 a 100 000 genes y alrededor de 3 mil millones de pares de bases.
Homología de Secuencia de Aminoácido
Histonas
Pequeñas proteínas cromosomales (aproximadamente de 12-20 kD) que poseen una estructura abierta, no doblada y que se unen al ADN en el núcleo celular por enlaces iónicos. La clasificación en los diversos tipos (denominadas histona I, histona II, etc.) se basa en las cantidades relativas de arginina y lisina de cada una.
Región de Control de Posición
Región reguladora que fue identificada por primera vez en el locus de la beta globina humana, pero que se halló posteriormente en otros loci. Se piensa que la región regula la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA mediante la apertura y remodelación de la estructura de la CROMATINA. También pueden tener actividad facilitadora.
Factores Estimuladores hacia 5'
Factores de transcripción de SECUENCIAS HÉLICE-ASA-HÉLICE de carácter básico que se expresan ubicuamente. Se unen a secuencias CANNTG en los promotores de diversos GENES implicados en el metabolismo de los cabrohidratos y de los lípidos.
Pollos
Proteínas Recombinantes
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Saccharomyces cerevisiae
Factores de Unión al ADN Específico de las Células Eritroides
Grupo de factores de transcripción que originalmente se describieron como específicos de las CÉLULAS ERITROIDES.
Secuencias Repetidas Terminales
Secuencias nucleotídicas repetidas tanto en los extremos 5' como 3' de una secuencia dada. Por ejemplo, lo que distingue al transposón es que está flanqueado por repeticiones invertidas en cada extremo y que las repeticiones invertidas están flanqueadas por repeticiones directas. El elemento delta de los retrotransposones Ty y las RTL (repeticiones terminales largas) son ejemplos de este concepto.
Tetraodontiformes
Pequeño orden de peces principalmente marinos que contiene 340 especies. La mayoría tienen forma redondeada o de cofre. En su hígado y sus ovarios se encuentra TETRODOTOXINA.
Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa
Variación de la técnica PCR en la que el cADN se hace del ARN mediante transcripción inversa. El cADN resultante se amplifica usando los protocolos PCR estándares.
Fenotipo
Apariencia externa del individuo. Es producto de las interacciones entre genes y entre el GENOTIPO y el ambiente.
Regulación Fúngica de la Expresión Génica
Células 3T3
Líneas celulares cuyo procedimiento original de crecimiento consistia en seren transferidas (T) a cada 3 días e placadas a 300.000 células por placa (cápsula o disco de Petri). Las líneas se desarrollaron utilizando varias cepas diferentes de ratones. Los tejidos son generalmente fibroblastos derivados de embriones de ratones pero otros tipos y fuentes también ya fueron desarrollados. Las líneas 3T3 son sistemas de hospederos in vitro valiosos para los estudios de transformación de virus oncogénicos ya que las células 3T3 poseen una elevada sensibilidad a la INIBICION DE CONTACTO.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Proteínas Fluorescentes Verdes
Analógos y derivados proteicos de la proteína fluorescente Aequorea victoria verde que emite luz (FLUORESCENCIA) cuando se estimula con RAYOS ULTRAVIOLETAS. Se usan en GENES REPORTEROS al hacer TÉCNICAS GENETICAS. Se han hecho numerosos mutantes para emitir otros colores o ser sensibles a pH.
Transducción de Señal
La transferencia de información intracelular (biológica activación / inhibición), a través de una vía de transducción de señal. En cada sistema de transducción de señal, una señal de activación / inhibición de una molécula biológicamente activa (hormona, neurotransmisor) es mediada por el acoplamiento de un receptor / enzima a un sistema de segundo mensajería o a un canal iónico. La transducción de señal desempeña un papel importante en la activación de funciones celulares, diferenciación celular y proliferación celular. Ejemplos de los sistemas de transducción de señal son el sistema del canal de íon calcio del receptor post sináptico ÁCIDO GAMMA-AMINOBUTÍRICO, la vía de activación de las células T mediada por receptor, y la activación de fosfolipases mediada por receptor. Estos, más la despolarización de la membrana o liberación intracelular de calcio incluyen activación de funciones citotóxicas en granulocitos y la potenciación sináptica de la activación de la proteína quinasa. Algunas vías de transducción de señales pueden ser parte de una vía más grande de transducción de señales.
Esteroles
Modelos Biológicos
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de procesos biológicos o enfermedades. Para modelos de enfermedades en animales vivos, MODELOS ANIMALES DE ENFERMEDAD está disponible. Modelos biológicos incluyen el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Procesamiento Postranscripcional del ARN
Modificación biológica postranscripcional de ARNs mensajeros, de transferencia o ribosómicos o sus precursores. Incluyen la ruptura, metilación, tiolación, isopentilación, formación de pseudoridina, alteraciones conformacionales y la asociación con proteínas ribosómicas.
Mutagénesis Insercional
Mutagénesis en la que la mutación es provocada por la introducción de secuencias extrañas de ADN en una secuencia génica o extragénica. Esto puede ocurrir espontáneamente in vivo o puede inducirse experimentalmente in vivo o in vitro. Las inserciones de ADN provírico en un protooncogén celular o cerca de él pueden interrumpir la TRADUCCIÓN GENÉTICA de las secuencias codificadoras o interferir con el reconocimiento de elementos reguladors y pueden originar una expresión no regulada del protooncogén, con la consiguiente formación de tumores.
Factor de Transcripción Sp3
Factor de transcripción proteína de especificidad que regula la expresión de diversos genes, como el FACTOR DE CRECIMIENTO DEL ENDOTELIO VASCULAR y el INHIBIDOR P27 DE CINASA DEPENDIENTE DE LA CICLINA.
Ratones Consanguíneos C57BL
Secuencias Hélice-Asa-Hélice
Estructuras supersecundarias recurrentes caracterizadas por 20 aminoácidos que se pliegan en dos alfa hélices conectadas por un segmento de "lazo" no helicoidal. Se encuentran en muchas secuencias específicas de PROTEINAS QUE SE UNEN AL ADN y de PROTEINAS QUE SE UNEN AL CALCIO.
Operón
En las bacterias, grupo de genes metabólicamente relacionados, con un promotor común, cuya transcripción a un ARN MENSAJERO policistrónico único está bajo control de una región OPERADORA.
Cromosomas Artificiales Bacterianos
Construcciones de ADN que se componen de al menos un ORIGEN DE RÉPLICA, para la exitosa replicación, propagación y mantenimiento como un cromosoma extra en las bacterias. Además pueden transportar grandes cantidades (cerca de 200 kilobases) de otra secuencia para una variedad de propósitos en bioingeniería.
Sondas de ADN
ADN específico de especies o subespecies (incluyendo ADN COMPLEMENTARIO; genes conservados, cromosomas enteros, o genomas enteros) utilizado en estudios de hibridación con el fin de identificar los microorganismos, para medir homologías ADN-ADN, agrupar subespecies, etc. La sonda de ADN se hibrida con un ARNm específico, si está presente. Entre las técnicas convencionales que se utilizan para determinar el producto de hibridación se encuentran ensayos de "dot blot" (o inmunotransferencia por puntos), ensayos de "Southern blot" (o inmunotransferencia de Southern), y pruebas de anticuerpos específicos de híbridos ADN:ARN. Entre los marcadores convencionales de las sondas de ADN se encuentran los marcadores radioactivos 32P y 125I y el marcador químico biotina. El empleo de sondas de ADN proporciona un sustituto específico, sensible, rápido, y barato de técnicas de cultivo celular para el diagnóstico de las infecciones.
Factor 1 de Transcripción de Unión a Octámeros
Factor de transcripción octámero que se manifiesta ubicuamente, que regula la TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA del ARN NUCLEAR PEQUEÑO, GENES DE INMUNOGLOBULINAS y genes de HISTONAS H2b.
Evolución Molecular
Perfilación de la Expresión Génica
La determinación de un patrón de genes expresados al nivel de TRANSCRIPCIÓN GENÉTICA bajo circunstancias específicas o en una célula específica.
Cromosomas Artificiales de Levadura
Cromosomas en los cuales los fragmentos de ADN exógeno, cuyo tamaño puede llegar a varios cientos de pares de kilobases, se han clonado en la levadura a través de la ligadura a secuencias de vectores. Estos cromosomas artificiales se utilizan ampliamente en la biología molecular para la construcción de amplias bibliotecas genómicas de organismos superiores.
Factores de Transcripción NFI
Factores de transcripción originalmente identificados como proteínas de unión al ADN específicas de sitios, esenciales para la REPLICACIÓN DEL ADN en los ADENOVIRUS. Son importantes para el desarrollo y el funcionamiento de la GLÁNDULA MAMARIA.
Proteínas Proto-Oncogénicas
Pez Cebra
Oligonucleótidos
Polímero constituido por pocos nucleótidos (de 2 a 20). En genética molecular, secuencia pequeña sintetizada para igualar a una región donde se sabe que ocurre una mutación y luego usada como detector (SONDA DE OLIGONUCLEÓTIDO). (Dorland, 28a ed)
Proteínas de Interacción con los Canales Kv
Familia de proteínas sensoras de calcio neuronal, que interactúan con los canales de potasio tipo A y los regulan.
Dedos de Zinc
Motivos de las proteínas que se unen al ADN y al ARN cuyos aminoácidos se pliegan en una sola unidad estructural alrededor de un átomo de zinc. En el dedo de zinc clásico, un átomo de zinc se encuentra unido a dos cisteínas y dos histidinas. Entre las cisteínas y las histidinas hay 12 residuos que forman una yema de dedo que se une al ADN. Por variaciones en la composición de las secuencias de la yema de dedo y el número y espaciado de las repeticiones en tándem del motivo, los dedos de zinc pueden formar un gran número de sitios específicos de unión con diferente secuencia.
Proteínas Proto-Oncogénicas c-jun
Proteína celular, que se une al ADN, y que es codificada por el gen c-jun (GEN, JUN). Ellas participan en el control transcripcional relacionado con el crecimiento. Parece que tienen tres funciones diferentes: dimerización (con c-fos), unión al ADN, y activación transcriptional. La transformación oncogénica puede tener lugar por la expresión constitutiva de c-jun.
Estructura Terciaria de Proteína
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Recombinación Genética
Producción de nuevos ordenamientos del ADN por varios mecanismos tales como variación y segregación, INTERCAMBIO GENÉTICO, CONVERSIÓN GÉNICA, TRANSFORMACIÓN GENÉTICA, CONJUGACIÓN GENÉTICA, TRANSDUCCIÓN GENÉTICA o infección mixta por virus.
Factor de Transcripción AP-1
Factor multiproteico compuesto por los productos de los proto-oncogenes c-jun y c-fos. Estas proteínas deben formar dímeros para unirse al sitio de reconocimiento AP-1, conocido también como el elemento de respuesta TPA (TRE). El AP-1 controla tanto la transcripción basal como la inducible de varios genes.
Vertebrados
Silenciador del Gen
Factores de Transcripción con Motivo Hélice-Asa-Hélice Básico
Familia de factores de transcripción de unión al ADN que contienen un MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE de carácter básico.
Regulación de la Expresión Génica de las Plantas
ARN no Traducido
Proteínas Portadoras
Metilación
Adición de grupos metilo. En histoquímica, la metilación se usa para esterificar grupos sulfato tratando cortes de tejido con metanol caliente en presencia de ácido clorhídrico. (Stedman, 25a ed)
Embrión de Mamíferos
Etapa inicial del desarrollo de los MAMÍFEROS. Generalmente se define como el periodo que va desde la fase de segmentación del CIGOTO hasta el final de la diferenciación embrionaria de las estructuras básicas. En el embrión humano, representa los dos primeros meses del desarrollo intrauterino y precede a los estadios de FETO.
Mutación Puntual
Mutación causada por la sustitución de un nucleótido por otro. Esto causa que una molécula de ADN tenga un cambio en un solo par de bases.
Regiones no Traducidas
Partes de la secuencia del ARN mensajero que no codifica para productos, es decir, REGIONES 5' NO TRADUCIDAS y REGIONES 3' NO TRADUCIDAS.
Hibridación in Situ
Línea Celular Tumoral
Una línea celular derivada de células de tumor cultivadas.
Algoritmos
Alelos
Leucina Zippers
Motivos que se unen al ADN formados por dos alfa hélices que se entrelazan durante 8 giros en una espiral enrollada y luego se bifurcan para formar unas estructuras en forma de Y. Las leucinas que ocurren en repeticiones heptádicas terminan en los mismos lados de las hélices y son adyacentes unas a otras en el tronco de la Y (la región "zipper"). Los residuos que se unen al ADN se encuentran en la región bifurcada de la Y.
Factor de Transcripción YY1
Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos
La hibridación de una muestra de ácido nucleico a un conjunto muy grande de SONDAS DE OLIGONUCLEÓTIDOS, que han sido unidos individualmente en columnas y filas a un soporte sólido, para determinar una SECUENCIA DE BASES, o para detectar variaciones en una secuencia de genes, EXPRESION GENÉTICA, o para MAPEO GENÉTICO.
Región de Flanqueo 3'
Región de ADN que bordea el terminal 3' de una unidad transcripcional y donde una variedad de secuencias regulatorias está ubicada.
Transformación Genética
Cambio producido en la composición genética de un organismo por transferencia unidireccional (TRANSFECCIÓN, TRANSDUCCIÓN, GENÉTICA, CONJUGACIÓN, GENÉTICA, etc.) y la incorporación de ADN extraño en células procariotas o eucariotas por recombinación de parte o la totalidad de ese ADN en el genoma celular.
Unión Competitiva
Embrión no Mamífero
Desarrollo de un huevo fecundado (CIGOTO) en especies animales distintas de los MAMÍFEROS. Para pollos, use EMBRIÓN DE POLLO.
ADN Recombinante
Duplicado del Terminal Largo de VIH
Secuencias reguladoras importantes para la replicación viral que se encuentran a cada extremo del genoma del VIH. La RTL incluye el AMPLIFICADOR DEL VIH, el promotor y otras secuencias. Son regiones específicas del RTL un elemento regulador negativo (ERN), los sitios de unión NF-kappa, los sitios de unión Sp1, la TATA BOX y el elemento de respuesta transactivador (RTA). La unión de proteínas celulares y virales a estas regiones regula la transcripción del VIH.
Proteínas
Factor C1 de la Célula Huésped
Coactivador transcripcional celular que en un principio se identificó por ser necesario para la unión estable de las PROTEÍNAS INMEDIATAS TEMPRANAS del VIRUS DEL HERPES SIMPLE. Se trata de una proteína nuclear que es un coactivador transcripcional de una serie de factores de transcripción, entre los que se incluyen la PROTEÍNA VP16, la PROTEÍNA DE UNIÓN GA, la PROTEÍNA 2 DE RESPUESTA DE CRECIMIENTO PRECOZ y el FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN E2F4.