El estudio de la estructura del cristal empleando las técnicas de DIFRACCION POR RAYOS X.
La rama de las ciencias que se relaciona con la descripción geométrica de los cristales y su estructura interna.
Modelos empleados experimentalmente o teóricamente para estudiar la forma de las moléculas, sus propiedades electrónicas, o interacciones; comprende moléculas análogas, gráficas generadas en computadoras y estructuras mecánicas.
Forma tridimensional característica de una proteína, incluye las estructuras secundaria, supersecundaria (motivos), terciaria (dominios) y cuaternaria de la cadena de péptidos. ESTRUCTURA DE PROTEINA, CUATERNARIA describe la conformación asumida por las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Formación de sustancias cristalinas a partir de soluciones o fusiones. (traducción libre del original: McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 4th ed)
Microscopía electrónica en la que se produce una congelación rápida de las muestras. La imagen de las moléculas hidratadas-congeladas y de los organelos permite obtener la mejor resolución posible que semeja al estado vivo, libre de fijadores químicos o de colorantes.
Dispositivos para acelerar protones o electrones en órbitas cerradas donde el voltaje de aceleración y la fuerza del campo magnético varían (el voltaje de aceleración se mantiene constante para los electrones) para mantener el radio de la órbita constante.
Esparcimiento de rayos X por la materia, especialmente cristales, con la consiguiente variación en intensidad debida a los efectos de interferencia. El análisis de la estructura de los cristales de los materiales se hace pasando rayos x a través de ellos y registrando la imagen de difracción de los rayos (CRISTALOGRAFIA POR RAYOS X).
Partes de una macromolécula que participan directamente en su combinación específica con otra molécula.
Forma tridimensional característica de una molécula.
Nivel de la estructura proteica en el cual las combinaciones de estructuras secundarias de proteína (alfa hélices, regiones lazo y motivos) están empacadas juntas en formas plegadas que se denominan dominios. Los puentes disulfuro entre cisteínas de dos partes diferentes de la cadena polipeptídica junto con otras interacciones entre cadenas desempeñan un rol en la formación y estabilización de la estructura terciaria. Las pequeñas proteínas generalmente consisten de un dominio único, pero las proteínas mayores pueden contener una cantidad de dominios conectados por segmentos de cadena polipeptídica que no tienen estructura secundaria.
Ubicación de los átomos, grupos o iones en una molécula con relación unos a los otros, así como la cantidad, tipo y localización de uniones covalentes.
Partículas elementales estables que poseen la carga negativa más pequeña conocida, presente en todos los elementos; también llamados negatrones. Los electrones cargados positivamente se denominan positrones. Los números, energías y ordenamiento de electrones alrededor de los núcleos atómicos determinan las identidades químicas de los elementos. Los rayos de electrones también se denominan RAYOS CATÓDICOS.
Nivel de la estructura proteica en el cual las interacciones regulares del tipo de unión de hidrógeno en tramos contiguos de la cadena polipeptídica conduce a alfa hélices, cadenas beta (que se alínean formando las láminas beta) u otro tipo de enrollados. Este es el primer nivel de plegamiento de la conformación proteica.
Espectroscopía por RMN de macromoléculas biolóticas de tamaño pequeño a mediano. Se emplea con frecuencia en investigaciones estructurales de proteínas y ácidos nucléicos, y a menudo comprende más de un isótopo.
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
Fuerza de atracción de baja energía entre el hidrógeno y otro elemento. Juega un papel principal en las propiedades del agua, proteínas y otros compuestos.
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Proceso mediante el cual las sustancias, ya sean endógenas o exógenas, se unen a proteínas, péptidos, enzimas, precursores de proteínas o compuestos relacionados. Las mediciones específicas de unión de proteína frecuentemente se utilizan en los ensayos para valoraciones diagnósticas.
La dispersión de NEUTRONS por la materia, en particular los cristales, con variación en la intensidad debido a los efectos de la interferencia. Es útil en CRISTALOGRAFÍA y DIFFRACTIÓN DE POLVO.
La región de una enzima que interactúa con su substrato provocando una reacción enzimática.
Método espectroscópico de medición del momento magnético de las partículas elementales tales como núcleos atómicos, protones o electrones. Se emplea en aplicaciones clínicas tales como IMAGEN POR RESONANCIA MAGNÉTICA (IMAGEN POR RESONANCIA MAGNÉTICA)
Forma tridimensional y ordenamiento característico de las proteínas multiméricas (agregados de más de una cadena polipeptídica).
Proteínas y grupos prostéticos de proteínas que absorben luz y que se encuentran en ciertos microorganismos. Algunos fotorreceptores microbianos inician reacciones químicas específicas, que indican un cambio en el ambiente, mientras otros generan energía, bombeando iones específicos a través de la membrana celular.
Dispersión de una RADIACIÓN electromagnética o acústica, o de partículas, en ángulos pequeños a causa de partículas o cavidades de dimensiones que a veces son del orden de varias veces la longitud de onda de la radiación o la longitud de onda de Briglie de las partículas dispersadas. También se denomina ángulo bajo de dispersión (de McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 6a ed). Las técnicas de dispersión de ángulo pequeño (SAS), neutrones de ángulo pequeño (SANS), rayos X (SAXS), y dispersión de luz (SALS o símplemente LS) se utilizan para la observación de objetos a escala nanométrica.
Molécula que se une a otra molécula. Se usa especialmente para referirse a una molécula pequeña que se une específicamente a una molécula grande, como p. ej., la unión de un antígeno a un anticuerpo, la unión de una hormona o un neurotransmisor a un receptor, o la unión de un sustrato o un efector alostérico a una enzima. Un ligando es también molécula que dona o acepta un par de electrones para formar un enlace covalente coordinado con el átomo metálico central de un complejo de coordinación. (Dorland, 28a ed)
POLIPÉPTIDOS lineales sintetizados en los RIBOSOMAS y que ulteriormente pueden ser modificados, entrecruzados, divididos o unidos en proteinas complejas, con varias subunidades. La secuencia específica de AMINOÁCIDOS determina la forma que tomará el polipéptido durante el PLIEGUE DE PROTEINA.
Relación entre la estructura química de un compuesto y su actividad biológica o farmacológica. Los compuestos frecuentemente se clasifican juntos porque tienen características estructurales comunes, incluyendo forma, tamaño, arreglo estereoquímico y distribución de los grupos funcionales.
La facilitación de una reacción química por material (catalizador) que no es consumida por la reacción.
La técnica que lava las muestras de tejidos con una solución concentrada de una sal de metal pesado, dejándola secar. La muestra se recubre con una capa muy fina de la sal metálica, excluyéndose las áreas donde está presente una macromolécula adsorbida. Las macromoléculas permiten que los electrones del rayo de un microscopio electrónico pasen mucho con mucha más facilidad que el metal pesado, produciéndose así una imagen inversa o negativa de la molécula.
Radiación electromagnética emitida que penetra cuando los electrones orbitales internos de un átomo son excitados y liberan energía radiante. Las longitudes de onda de los rayos X van de 1 pm a 10 nm. Los rayos X de energía más alta son mas duros que los rayos X de longitud de onda más cortas. Los rayos X blandos o rayos Grenz son menos enérgicos y más largo en longitud de onda. El extremo corto de longitud de onda del espectro de rayos X se solapa con la gama de los RAYOS GAMMA de longitud de onda. La distinción entre los rayos gamma y los rayos X se basa en su fuente de radiación.
Proceso mediante el cual dos moléculas con la misma composición química forman un producto de condensación o polímero.
Representaciones teóricas que simulan el comportamiento o actividad de los procesos o fenómenos químicos; comprende el uso de ecuaciones matemáticas, computadoras y otros equipos electrónicos.
Proteínas qe se hallan en cualquier especie de bacteria.
Enzima básica que está presente en la saliva, lágrimas, clara de huevo y muchos fluidos animales. Funciona como agente antibacteriano, La enzima cataliza la hidrólisis de enlaces 1,4-beta entre los residuos de ácido N-acetilmurámico y la N-acetil-D-glucosamina en el peptidoglicano y entre residuos de N-acetil-D-glucosamina en la quitodextrina. EC 3.2.1.17.
La tasa de la dinámica en los sistemas físicos o químicos.
MUTAGÉNESIS de ingeniería genética en un sitio específico de una molécula de ADN, que introduce una sustitución, una inserción o una delección de una base.
El montaje de la ESTRUCTURA CUATERNARIA DE PROTEÍNA de las proteínas multiméricas (COMPLEJOS MULTIPROTEÍNAS) desde sus compuestos de las SUBUNIDADES DE PROTEÍNA.
Fenómeno por el cual compuestos cuyas moléculas tienen el mismo número y tipo de átomos y el mismo ordenamiento atómico, difieren en sus relaciones espaciales.
Una simulación por computador desarrollada para estudiar el movimiento de las moléculas en un período de tiempo.
Procesos que intervienen en la formación de ESTRUCTTURA TERCIARIA DE PROTEÍNA.
Ténica analítica para estudiar sustancias presentes en concentraciones de coenzimas en células individuales, in situ, mediante la medición de la absorción de la luz. La luz de una lámpara de tungsteno o de un arco de xenonio dispersada por una retícula monocromática, ilumina el sistema óptico de un microscopio. La absorción de luz se mide (en nanómetros) comparando la diferencia entre la imagen de la muestra y una imagen de referencia.
La acumulación de una carga eléctrica sobre un objeto.
Diseño molecular de drogas con propósitos específicos (tales como unión al ADN, inhibición enzimática, eficacia anti cancerígena, etc.) basado en el conocimiento de las propiedades moleculares tales como la actividad de los grupos funcionales, geometría molecular y estructura electrónica y también en la información catalogada sobre moléculas análogas. El diseño de drogas generalmente consiste en el modelaje molecular asistido por computación y no incluye la farmacocinética, análisis de dosis o análisis de administración de la droga.
Un líquido transparente, inodoro, insaboro que es esencial para la vida de la mayoría de los animales y vegetales y es un excelente solvente para muchas sustancias. La fórmula química es el óxido de hidrógeno (H2O). (Traducción libre del original: McGraw-Hill Dictionary of Scientific and Technical Terms, 4th ed)
Análisis rigurosamente matemático de las relaciones energéticas (calor, trabajo, temperatura y equilibrio). Describe sistemas cuyos estados están determinados por parámetros térmicos, como la temperatura, además de parámetros mecánicos y electromagnéticos.
Grado de similitud entre secuencias de aminoácidos. Esta información es útil para entender la interrelación genética de proteinas y especies.
Mezclas homogéneas formadas al mezclar sustancias sólidas, líquidas o gaseosas (solutos) con un líquido (el solvente), desde donde las sustancias disueltas pueden recuperarse por procesos físicos.
Partículas elementales eléctricamente neutras que se encuentran en todos los núcleos atómicos menos el de hidrógeno ligero; la masa es igual a la del protón y electrón combinados y son inestables cuando se aíslan del núcleo, sufriendo descomposición beta. Los neutrones lentos, térmicos, epitérmicos y rápidos se refieren a los niveles de energía con los cuales los neutrones son expulsados de los núcleos más pesados durante su descomposición.
Compuestos y complejos moleculares consistentes en un gran número de átomos generalmente sobre 500 kD de tamaño. En los sistemas biológicos las substancias macromoleculares se pueden visualizar generalmente usando MICROSCOPIO ELECTRÓNICO y se distinguen de los ORGANELOS por la carencia de estructura membranosa.
Operaciones controladas por procesos analíticos o diagnósticos, o sistemas por medio de dispositivos mecánicos o electrónicos.
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
El grado de similitud entre la forma tridimensional de las proteínas. Puede ser una indicación de poca HOMOLOGÍA DE SECUENCIA DE AMINOÁCIDO y utilizada para el DISEÑO DE DROGAS racional.
Procesamiento de datos ejecutado principalmente por medios automáticos.
Proteínas preparadas por la tecnología del ADN recombinante.
Una proteína conjugada que es el pigmento transportador de oxígeno del músculo. Está constituída por una cadena polipeptídica de globina y un grupo heme.
Ordenamiento espacial de los átomos de un ácido nucleico o polinicleótido que produce su forma tridimensional característica.
Propiedad característica de la actividad enzimática con relación a la clase de sustrato sobre el cual la enzima o molécula catalítica actúa.
Isoenzima de anhidrasa carbónica citosólica se encuentra ampliamente distribuida en las células de casi todos los tejidos. Las deficiencias de la anhidrasa carbónica II produce un síndrome caracterizado por la OSTEOPETROSIS, acidosis l tubular renal (ACIDOSIS TUBULAR RENAL ) y calcificación cerebral. EC 4.2.1.-
Auxiliar de diagnóstico para la determinación de la función del páncreas.
El reemplazo que occurre natural o inducido experimentalmente de uno o más AMINOÁCIDOS en una proteína con otra. Si un amino ácido equivalente funcional se sustituye, la proteína puede mantener el acitividad tipo salvaje. La sustitución también puede disminuir, aumentar, o eliminar la función de la proteína. La sustitución inducida experimentalmente se utiliza con frecuencia para estudiar las actividades y enlaces de las enzimas.
Representación por medio de la computadora de sistemas físicos y fenómenos tales como los procesos químicos.
La medición de la cantidad de calor presente en varios procesos, tales como las reacciones químicas, cambios de estado, y formaciones de soluciones, o en la determinación de las cualidades caloríficas de las sustancias. La unidad fundamental de medida es el julio (joule, en inglés) o la caloría (4.184 julios).
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.
Cualquier cambio detectable y heredable en el material genético que cause un cambio en el GENOTIPO y que se transmite a las células hijas y a las generaciones sucesivas.
Procedimientos mediante los que se cambia o se crea in vitro la función y estructura de las proteínas, alterando las existentes o sintetizando nuevos genes estructurales que dirigen la síntesis de proteínas con las propiedades deseadas. Esos procedimientos pueden incluir el diseño de MODELOS MOLECULARES de proteínas utilizando GRÁFICOS POR ORDENADOR u otras técnicas de modelado molecular; la MUTAGÉNESIS SITIO DIRIGIDA de genes existentes; y técnicas de EVOLUCIÓN MOLECULAR DIRIGIDA para crear nuevos genes.
La interacción termodinámica entre una sustancia y AGUA.
Análisis basado en la función matemática formulada por primera vez en 1807 por Jean-Baptiste-Joseph Fourier. La función, conocida como la transformada de Fourier, describe el patrón sinusoidal de cualquier patrón fluctuante en el mundo físico en términos de su amplitud y su fase. Tiene amplia aplicación en biomedicina, por ej. análisis de datos cristalográficos de rayos X, cardinal en la identificación la naturaleza de doble hélice del ADN y en el análisis de otras moléculas, incluyendo virus, y el algoritmo de proyección reversa universalmente utilizado en tomografía computadorizada, etc.
Grandes mamíferos marinos del orden CETACEA. En el pasado fueron muy valiosos comercialmente por el aceite, por su carne como alimento para los humanos y en ALIMENTACIÓN ANIMAL y FERTILIZANTES, así como por la lámina córnea de la mandíbula superior ("barba" de ballena). En la actualidad existe una moratoria en la mayoría de la pesca comercial de ballenas, ya que todas las especies están en la lista de amenazadas o en vías de extinción.
Programas y datos operativos y secuenciales que instruyen el funcionamiento de un computador digital.
Microscopía usando un haz de electrones, en lugar de luz, para visualizar la muestra, permitiendo de ese modo mucha mas ampliación. Las interacciones de los ELECTRONES con los materiales son usadas para proporcionar información acerca de la estructura fina del material. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN las reacciones de los electrones transmitidos a través del material forman una imagen. En la MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE RASTREO un haz de electrones incide en un ángulo no normal sobre el material y la imagen es producida a partir de las reacciones que se dan sobre el plano del material.
Metaciclofanos fenólicos derivados de la condensación de FENOLES y ALDEHIDOS. El nombre deriva de las estructuras moleculares semejantes a un florero. Los paréntesis cuadrados [ n ] indican el número de anillos aromáticos.
Una técnica de simulación por computador que se usa para modelar la interacción entre dos moléculas. Típicamente, la simulación de acoplamiento mide las interacciones de una molécula pequeña o ligando con una parte de una molécula más grande tal como una proteína.
La medición de la amplitud de los componentes de una onda compleja en toda la gama de frecuencia de la onda. (McGraw-Hill Dictionary of Scientific y términos técnicos, 6a ed)
Enzima que cataliza la conversión de urato y productos no identificados. Es una proteína que contiene cobre. Los productos iniciales se descomponen para formar alantoína. EC 1.7.3.3.
Teoría acerca de que la radiación y la absorción de energía ocurre en cantidades definidas llamadas cuantos (E) que varían en tamaño y se definen por la ecuación E=hv en la cual "h" es la constante de Planck y "v" es la frecuencia de la radiación.
Partículas elementales estables que tiene la menor carga positiva conocida y se encuentran en el núcleo de todos los elementos. La masa del protón es menor que la del neutrón. Un protón es el núcleo del átomo de hidrógeno ligero, i.e., el ión hidrógeno.
Técnica aplicable a la gran variedad de sustancias que exhiben paramagnetismo debido a los momentos magnéticos de los electrones no pareados. Los espectros son útiles para la detección e identificación, para la determinación de la estructura del electrón, para el estudio de las interacciones entre moléculas, y para la medición de los "spins" y momentos nucleares. La espectroscopía nuclear electrónica de doble resonancia (ENDOR), es una variante de la técnica que puede dar una mejor resolución. El análisis de la resonancia del spin electrónico puede hacerse ahora in vivo, incluyendo aplicaciones imagenológicas como la RESONANCIA MAGNÉTICA.
Análisis de la masa de un objeto mediante la determinación de las longitudes de ondas en las que la energía electromagnética es absorbida por dicho objeto.
Líquidos que disuelven otras sustancias (solutos), generalmente sólidos, sin cambio en la composición química, como el agua con azúcar.
Ligandos cargados neutral o negativamente vinculados a los cationes metálicos o átomos neutrales. El número de átomos del ligando a los que centro metálico está directamente vinculado es el número de coordinación del catión metálico, y ese número es siempre mayor que la de valencia regular o número de oxidación del metal. Una coordinación compleja de puede ser negativo, neutral o positivamente cargado.
Bacteria en forma de bastoncillo rodeada de una estructura en forma de vaina que tiene salientes en forma de balón fuera de los extremos de la célula. Es termofílica, el crecimiento ocurre con temperaturas tan altas como 90 grados C. Se aisla de sedimentos marinos geotérmicamente calientes o de aguas termales.
Un cambio de polarización planar a polarización elíptica cuando una onda de luz plano-polarizada atraviesa un medio ópticamente activo.
Una clase de enzimas que catalizan la hidrólisis de una de los tres enlaces éster en un compuesto conteniendo fosfotriéster.
Especie de bacteria gramnegativa, aerobia, en forma de bastoncillos que se encuentran en las aguas termale s con pH neutro a alcalino, así como en los calentadores de agua.
La facilitación de reacciones bioquímicas con la ayuda de catalizadores de origen natural tales como las ENZIMAS.
Análisis de la intensidad de la difusión de Raman de luz monocromática como una función de la frecuencia de la luz difundida.
Familia de virus ADN con forma bacilar que infectan a ARCHAEA. Carecen de cubiertas o lípidos víricos.
Módulos proteicos con superficies de unión a ligandos conservadas que intervienen en funciones de interacción específicas en las VIAS DE TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL y los SITIOS DE UNIÓN específicos de sus LIGANDOS proteicos afines.
La porción de la hemoglobina que aporta el color. Se halla libre en tejidos y como el grupo prostético en muchas hemoproteínas.
Complejos macromoleculares formados de la asociación de subunidades definidas de proteínas.
Estado del ambiente que se manifiesta en el aire y en los cuerpos en forma de calor, en una gradación que fluctúa entre dos extremos que, convencionalmente, se denominan: caliente y frío (Material IV - Glosario de Protección Civil, OPS, 1992)
Una clase de compuestos del tipo R-M, donde el átomo de C se úne directamente a cualquier otro elemento excepto H, C, N, O, F, Cl, Br, I, o At.
Una técnica biosensora en que las biomoléculas capaces de enlazar con analíticos o enlaces específicos son primero inmovilizadas en una cara de una película metálica. Entonces se proyecta luz por la cara opuesta de la película, para excitar los plasmones de superficie, o sea, las oscilaciones de los electrones libres propagándose a lo largo de la superficie de la película. Se mide el índice refractario de la luz que esta superficie refleja. Cuando las biomoléculas inmovilizadas son enlazadas por sus ligandos, se crea una alteración en los plasmones de superficie en la cara opuesta de esta película, la cual es directamente proporcional al cambio en la masa enlazada o adsorbida. El enlace se mide por los cambios en el índice refractario. La técnica se usa para estudiar las interacciones biomoleculares, como el enlace antígeno-anticuerpo.
Proteínas obtenidas de ESCHERICHIA COLI.
Heterodímeros de FLAVONOIDES unidos a LIGNANOS.
Proporción en la que una enzima conserva su conformación estructural o su actividad cuando se somete al almacenamiento, aislamiento y purificación o a otras manipulaciones físicas o químicas, entre las que se incluyen las enzimas proteolíticas y el calor.
Proteínas que se encuentran en las membranas celulares e intracelulares. Están formadas por dos tipos, las proteínas periféricas y las integrales. Incluyen la mayoría de las enzimas asociadas con la membrana, proteínas antigénicas, proteínas transportadoras, y receptores de drogas, hormonas y lectinas.
Un aminoácido esencial importante en un número de procesos metabólicos. Se requiere para la producción de HISTAMINA.
Secuencia de PURINAS y PIRIMIDINAS de ácidos nucléicos y polinucleótidos. También se le llama secuencia de nucleótidos.
Determinación del espectro de absorción ultravioleta mediante moléculas específicas en gases o líquidos, por ejemplo CI2, SO2, NO2, CS2, ozono vapor de mercurio y varios compuestos insaturados.
Proteínas que constituyen la CÁPSIDE de VIRUS.
Una técnica de investigación para medir regiones de moléculas expuestas a solventes que es usada para percibir acerca de la CONFORMACION PROTEICA.
Elementos químicos electropositivos caracterizados por su ductibilidad, maleabilidad, brillo, y conductibilidad al calor y la electricidad. Pueden reemplazar al hidrógeno de un ácido y formas bases con radicales hidroxilo.
La transformación de los líquidos en sólidos por la extracción de calor.
Sal potásica utilizada para reponer ELECTROLITOS con el fin de restaurar el EQUILIBRIO HIDROELECTROLÍTICO, y como alcalinizador urinario y sistémico. Puede administrarse por vía oral o en perfusión intravenosa. En el pasado se utilizó en formulaciones como DIURÉTICOS y EXPECTORANTES.
Procedimiento consistente en una secuencia de fórmulas algebraicas y/o pasos lógicos para calcular o determinar una tarea dada.
Enzima que cataliza la segmentación endonucleolítica de los ácidos ribonucléicos pancreáticos a 3'-fosfomono- y oligonucleótidos que terminan en ácidos citidílico o uridílico, con intermediarios de 2',3'-fosfato cíclico. EC 3.1.27.5.
Miembros de la clase de compuestos formados por AMINOÁCIDOS unidos por enlaces peptídicos entre aminoácidos adyacentes en estructuras lineales, ramificadas o cíclicas. Los OLIGOPÉPTIDOS están compuestos por aproximadamente 2-12 aminoácidos. Los polipéptidos están compuestos por aproximadamente 13 o mas aminoácidos. Las PROTEINAS son polipéptidos lineales que normalmente son sintetizadas en los RIBOSOMAS.
Cadenas simples de aminoácidos que son las unidades de PROTEÍNAS multiméricas. Estas pueden estar compuestas de subunidades iguales o no iguales. Una o mas subunidades monoméricas pueden componer un protómero, que a su vez es una subunidad de un conjunto mas amplio.
Enzima del citocromo P-450 soluble que cataliza la monooxigenación del alcánfor en presencia de putidaredoxin reductasa y oxigeno molecular. Esta enzima, codificada por el gen CAMC también conocido como CYP101, ha sido cristalizada a partir de bacterias y la estructura está bien definida. En condiciones anaeróbicas, esta enzima reduce los compuestos polihalogenados enlazados al sitio de enlace del alcánfor.
Halógeno con el símbolo atómico Br, número atómico 36, y peso atómico 79.904. Es un líquido pardo-rojizo volátil que emana vapores sofocantes, es corrosivo para la piel y puede causar gastroenteritis severa si se ingiere.
Polímero de desoxirribonucleótidos que es el material genético primario de todas las células. Los organismos eucarióticos y procarióticos contienen normalmente ADN en forma de doble cadena, aunque en varios procesos biológicos importantes participan transitoriamente regiones de una sola cadena. El ADN, que consiste de un esqueleto de poliazúcar-fosfato posee proyecciones de purinas (adenina y guanina) y pirimidinas (timina y citosina), forma una doble hélice que se mantiene unida por puentes de hidrógeno entre estas purinas y pirimidinas (adenina a timina y guanina a citosina).
Proteínas producidas por GENES que han sufrido MUTACIONES.
Compuestos o agentes que se combinan con una enzima de manera tal que evita la combinación sustrato-enzima normal y la reacción catalítica.
La normalidad de una solución con respecto a los iones de HIDRÓGENO. Está relacionado a las mediciones de acidez en la mayoría de los casos por pH = log 1 / 2 [1 / (H +)], donde (H +) es la concentración de iones de hidrógeno en gramos equivalentes por litro de solución. (Traducción libre del original: McGraw-Hill Diccionario de Términos Científicos y Técnicos, 6 a ed)
Metal de número atómico 30 y peso atómico 65.37. Es un oligoelemento necesario en la dieta, siendo una parte esencial de muchas enzimas, y desempeña una función importante en la síntesis de proteínas y en la división celular. La deficiencia de zinc se asocia con ANEMIA, baja estatura, HIPOGONADISMO, alteración de la CICATRIZACIÓN DE HERIDA y geofagia. Se conoce con el símbolo Zn.
Reacción química en que un electrón se transfiere de una molécula a otra. La molécula donante del electrón es el agente de reduccción o reductor; la molécula aceptora del electrón es el agente de oxidación u oxidante. Los agentes reductores y oxidantes funcionan como pares conjugados de oxidación-reducción o pares redox.
Hidrógeno. El primer elemento químico de la tabla periódica. Tiene por símbolo atómico H, número atómico 1 y peso atómico [1.00784; 1.00811]. Existe, en condiciones normales, como un gas diatómico incoloro, inodoro e insípido. Los iones del hidrógeno son PROTONES. Además del isótopo común H1 el hidrógeno existe como el isótopo estable DEUTERIO y el isótopo radioactivo inestable TRITIO.
Grandes colecciones de moléculas pequeñas (peso molecular menor o igual a 600), de naturaleza similar o diferente, que se utilizan en pruebas rápidas de detección sistemática de la función génica, la interacción proteica, el procesamiento celular, las vías bioquímicas y otras interacciones químicas.
Parte blanca de un huevo, especialmente del huevo de gallina, utilizado para cocinar. Contiene albúmina.
La capacidad de una proteína para mantener su conformación estructural o sus actividades cuando se somete a manipulaciones físicas o químicas.
Metaloendopeptidasa extracelular termoestable, que contiene cuatro iones de calcio. EC 4.4.24.27.
El proceso de encontrar productos químicos para su posible uso terapéutico.
Apareamiento de las bases de purinas y pirimidinas por ENLACES DE HIDRÓGENO en la molécula de doble cadena de ADN o ARN.
Un elemento con símbolo atómico O, número atómico 8 y peso atómico [15.99903; 15.99977]. Es el elemento más abundante de la tierra y es esencial para la respiración.
Antiséptico local utilizado principalmente en vendajes de heridas.
Uso de computadoras para el diseño y/o fabricación de cualquier cosa, incluídos los fármacos, procedimientos quirúrgicos, ortesis y prótesis.
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Polímeros de alto peso molecular que contienen una mezcla de nucleótidos purínicos y pirimidínicos mantendos juntos en forma de cadena por medio de enlaces ribosa o desoxirribosa.
Un oligoelemento de metal pesado maleable anaranjado que tiene por símbolo atómico Cu, número atómico 29 y peso atómico 63.55. Sus sales son venenosas. El cobre es esencial en la nutrición siendo un componente de varias proteínas incluyendo la ceruloplasmina, eritrocupreína, citocromo c oxidasea, tirosinasa, etc. Su deficiencia, que es rara, puede resultar en anemia microcítica hipocrómica, neutropenia y alteraciones óseas.
Sal de sodio trihidratada del ácido acético, la cual es utilizada como una fuente de iones sodio en soluciones de diálisis y como un alcalinizante sistémico y urinario, diurético y expectorante.
Espectrofotometría en la región infrarrojo, generalmente con el fin de análisis químico mediante la medición del espectro de absorción asociado con los niveles rotacionales y vibracionales de energía de las moléculas.
Componentes estructurales de proteínas, comunmente observados, formados por combinaciones simples de estructuras secundarias adyacentes. Una estructura comunmente observada puede estar compuesta por una SECUENCIA CONSERVADA que puede estar representada por una SECUENCIA DE CONSENSO.
Rodopsinas que se encuentran en la MEMBRANA PÚRPURA de archaea halofílica como el HALOBACTERIUM HALOBIUM. Funcionan como transductores de energia, convirtiendo la energia luminosa en energia electroquímica mediante BOMBAS DE PROTONES.
Un aminoácido no esencial que contiene tiol y que es oxidado para formar CISTINA.
Representación, generalmente a escala peequeña, para mostrar la estructura, construcción o apariencia de algo (Adaptación del original: Random House Unabridged Dictionary, 2d ed).
Agentes purificadores o limpiadores, habitualmente sales de bases o ácidos alifáticos de cadena larga, que ejercen la limpieza (disolución de aceite) y efectos antimicrobianos a través de una acción de superficie que radica en la posesión tanto de propiedades hidrofílicas como hidrofóbicas.
Enzimas que catalizan la interconversión de aldosas a componentes cetosas.
Una secuencia de aminoácidos en un polipéptido o de nucleótidos en el ADN o ARN que es similar en múltiples especies. Un grupo de secuencias conservadas conocidas está representada por una SECUENCIA DE CONSENSO. Los MOTIVOS DE AMINOACIDOS están formados frecuentemente por secuencias conservadas.
Mioglobina que se encuentra en la forma férrica oxidada o en forma hemínica. La oxidación causa un cambio en color desde el rojo al carmelita.
Estudio de la composición, estructura química y las reacciones químicas de los seres vivos.
Modificación de la reactividad de las ENZIMAS por la unión de los efectores a sitios (SITIOS ALOSTÉRICOS) de las enzimas distintos a los SITIOS DE UNIÓN del substrato.
Un gas noble que tiene por símbolo atómico Xe, número atómico 54 y peso atómico 131.30. Se encuentra en la atmósfera terrestre y ha sido utilizado como anestésico.
ARN que tiene actividad catalítica. Tiene una secuencia que se enrolla para formar una superficie compleja que puede funcionar como una enzima en las reacciones con si mismo y con otras moléculas. Puede darse incluso en ausencia de proteina. Existen numerosos ejemplos de especies de ARN que actuan sobre el ARN catalítico, aunque el alcance de esta clase de enzima no se limita a un tipo particular de sustrato.
Proceso de generación de una MUTACIÓN genética. Puede darse espontáneamente o ser inducida por MUTÁGENOS.
Un átomo o grupo de átomos que tiene una carga electrica positiva o negativa debido a la ganancia (carga negativa) o pérdida (carga positiva) de uno o mas electrones. Los átomos con carga positiva son llamados CATIONES; aquellos con carga negativa son ANIONES.
Proteína que tiene uno o más iones metálicos estrechamente unidos y que forman parte de su estructura. (Dorland, 28a ed)
Bases de datos que contiene información sobre PROTEÍNAS, tales como la SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS; CONFORMACIÓN PROTÉICA, y otras propiedades.
Enzima que cataliza la hidrolisis de la ACETILCOLINA en COLINA y acetato. En el SISTEMA NERVIOSO CENTRAL, esta enzima desempeña un papel en la función de las uniones neuromusculares periféricas. EC 3.1.1.7.
Un raro elemento metaloferroso, duro, quebradizo, blanco-grisáceo que tiene por símbolo atómico Ru, número atómico 44 y peso atómico 101.07. Es utilizado como catalizador y endurecedor para el PLATINO y el PALADIO.
Bacteria gramnegativa inmóvil que se encuentra en los suelos o salmueras.
El estudio de FENÓMENOS FÍSICOS y PROCESOS FÍSICOS aplicados a las cosas vivos.
Compuestos orgánicos que contiene el radical -CO-NH2. Las amidas son derivadas de los ácidos por el reemplazo del OH por -NH2 o del amoníaco por el reemplazo del H por un grupo acilo.
Un oligoelemento componente de la vitamina B12. Tiene por símbolo atómico Co, número atómico 27 y peso atómico 58.93. Es utilizado en armas nucleares, aleaciones y pigmentos. La deficiencia en animales lleva a la anemia; su exceso en humanos puede llevar a la eritrocitosis.
Un ADN de hélice doble hacia la izquierda. Su nombre deriva de su estructura angosta en zigzag que es la forma menos torcida y delgada de ADN. Las regiones que forman ADN-Z dentro del GENOMA pueden jugar un importante rol en REGULACION DE LA EXPRESION GENICA.
Fenómeno por el cual ciertos compuestos químicos tienen estructuras diferentes aunque los compuestos tengan la misma composición elemental.
Un método para determinación de puntos de contacto entre proteínas interactivas o sitios de enlace de proteínas a ácidos nucleicos. Para la huella de proteína se utiliza un reagente o protease que corta la proteína. La segmentación proteica es inhibida cuando las proteínas, o ácidos nucleicos y proteína, entran en contacto mutuamente. Después de la finalización de la reacción de corte, los fragmentos restantes de péptidos son analizados por electroforesis.
Compuestos orgánicos que contienen el grupo carboxi (-COOH). Este grupo de compuestos incluyen aminoácidos y ácidos grasos. Los ácidos carboxílicos pueden ser saturados, insaturados o aromáticos.
Complejos de proteína que toman parte en el proceso de FOTOSÍNTESIS. Se encuentran en las MEMBRANAS TILACOIDES de los CLOROPLASTOS de plantas y en una variedad de estructuras en los organismos más primitivos. Hay dos complejos mayores involucrados en los procesos fotosintéticos llamados FOTOSISTEMA I y FOTOSISTEMA II.
Compuestos orgánicos que contienen fósforo como parte integral de la molécula. Incluido en este descriptor esta una amplia gama de compuestos sintéticos que se utilizan como PLAGUICIDAS y MEDICAMENTOS.
Proceso de disociación de un compuesto químico por la adición de una molécula de agua.
Imines are organic compounds containing a functional group with the general structure RR'C=NR'', where R, R' are organic residues and NR'' is an organic amino group. (Definición aproximada)
Animales bovinos domesticados del género Bos, que usualmente se mantienen en una granja o rancho y se utilizan para la producción de carne o productos lácteos o para trabajos pesados.
Un oligoelemento que tiene por símbolo atómico Mn, número atómico 25 y peso atómico 54.94. Está concentrado en la mitocondria, principalmente en la glándula pituitaria, hígado, páncreas, riñón y hueso, influencia la síntesis de mucopolisacáridos, estimula la síntesis hepática de colesterol y ácidos grasos y es un cofactor de muchas enzimas incluyendo la arginasa y la fosfatasa alcalina en el hígado.
Monóxido de carbono (CO). Un gas venenoso, incoloro, inodoro e insaboro. Se combina con la hemoglobina para formar la carboxihemoglobina, que no tiene la capacidad de transportar el oxígeno. La falta de oxígeno resultante provoca dolor de cabeza, vértigo, disminuye el pulso y el ritmo respiratorio, inconciencia y muerte.
Deuterio. El isótopo estable del hidrógeno. Tiene un neutrón y un protón en el núcleo.
La interrupción de los enlaces no covalentes y / o puentes disulfuro responsable de mantener la forma tridimensional y la actividad de la proteína nativa.
Una familia de elementos no metálicos, generalmente electronegativos, del grupo VIIa de la tabla periódica. Son todos multivalentes y tienen números de oxidación de -1 (el más común) 1, 3, 5, and 7.
Aminoácido esencial, necesario para el crecimiento normal de los niños y para el equilibrio del NITRÓGENO en los adultos. Es un precursor de los ALCALOIDES DE INDOL en las plantas. Es un precursor de la SEROTONINA (y por ello utilizado como antidepresivo y facilitador del sueño). Puede ser un precursor de la NIACINA en mamiferos, aunque de manera ineficiente.
Drogas que se unen y bloquean la activación de RECEPTORES ADRENERGICOS BETA 2.
Fragmentos de unión univalentes de antígeno, compuestos por una CADENA LIGERA DE INMUNOGLOBULINAS entera y el amino terminal de una de las CADENAS PESADAS DE INMUNOGLOBULINA de la región media, unidas entre sí mediante uniones disulfuro. Los Fab contienen las regiones variables de la molécula de inmunoglobulina, que son parte del sitio de unión a antígeno y las primeras regiones constantes. Este fragmento puede obtenerse por digestión de las inmunoglobulinas con la enzima proteolítica PAPAINA.
Filum de bacterias oxigénicas fotosintéticas que comprende desde bacterias unicelulares a multicelulares, que poseen CLOROFILA y que realizan la FOTOSÍNTESIS con oxígeno. Las Cyanobacteria son los únicos organismos conocidos capaces de fijar tanto el DIÓXIDO DE CARBONO (en presencia de luz) como el NITRÓGENO. La morfología celular puede incluir heterocistos fijadores de nitrogeno y/o células en reposo denominadas acinetos. Anteriormente denominadas algas azúl-verdosas, las cyanobacteria eran consideradas tradicionalmente como ALGAS.
Proteínas parciales formadas por hidrólisis parcial de proteínas o generadas a través de técnicas de INGENIERÍA DE PROTEÍNAS.
Elemento metálico con el símbolo atómico Fe, número atómico 26 y peso atómico 55.85. Es un constituyente esencial de las HEMOGLOBINAS.
Una técnica espectroscópica en la que el rango de las longitudes de onda se presenta simultáneamente con un interferómetro y el espectro se deriva matemáticamente del patrón así obtenido.
Calidad o estado de poder ser plegado o doblado repetidamente.
Grupos químicos que contienen el enlace disulfuro covalente -S-S-. El átomo de azufre puede unirse a partes orgánicas o inorgánicas.
Cápsula externa de proteínas que protege a un virus, ella protege al ácido nucleico viral. Ella puede tener simetría helicoidal o icosaédrica y está compuesta por unidades estructurales o capsómeros. Conforme al número de subunidades que tienen los capsómeros, se les llama dímeros (2), trímeros (3), pentámeros (5) o hexámeros (6).
Citidina (dihidrógeno fosfato). Nucleótido citosina que contiene un grupo fosfato esterificado a la molécula de azúcar en la posición 2', 3' o 5'.
Especie imperfecta de hongo que crece en maníes y otras plantas y que produce la sustancia carcinogénica aflatoxina. Se utiliza también en la producción del antibiótico flavicina.
Campo de la biología relacionada con el desarrollo de técnicas para la recolección y manipulación de datos biológicos, y la utilización de estos datos para hacer descubrimientos biológicos o predicciones. Este campo abarca todos los métodos computacionales y teorías para la solución de problemas biológicos, incluyendo la manipulación de modelos y conjuntos de datos.
Una técnica de espectrometria de masa usada para análisis de compuestos no volátiles tales como proteínas y macromoléculas. La técnica involucra preparación de gotas electricamente cargadas del analizado de moléculas disueltas en solvente. Las gotas electricamente cargadas entran en una cámara de vácuo donde el solvente es evaporado. La evaporación de solvente reduce el tamaño de la gota, a través de eso aumentando la repulsión culombica dentro de la gota. Como las gotas cargadas se tornan menores, la carga excesiva dentro de ellas les hace desintegrar y liberar el analizado de moléculas. Los analizados volatizados de moléculas son entonces analizados por espectrometria de masa.
Parte de una molécula del ARN MENSAJERO, que experimenta un cambio en su conformación bajo la unión a un metabolito específico u otra molécula pequeña, de ese modo regulando la trancripción de los ARN mensajeros, procesamiento post-transcripcional, transporte, traducción o estabilidad en respuesta a diferentes niveles del metabolito u otras células pequeñas.
Carboxipeptidasas que primariamente se encuentran en el SISTEMA DIGESTIVO que cataliza la liberación de C-terminal aminoácidos. Las carboxipeptidasas A tienen una pequeña o ninguna actividad para hidrólisis de ACIDO ASPARTICO C-terminal; ACIDO GLUTAMICO; ARGININA; LISINA; o PROLINA. Esta enzima requiere ZINC como cofactor y fue antes listada como EC 3.4.2.1 y EC 3.4.12.2.
Las características físicas y los procesos de los sistemas biológicos.
Subclase de canales iónicos que se abren o cierran en respuesta a la unión de LIGANDOS específicos.
Motivos de unión a calcio compuestos de dos hélices (E y F) unidas por un bucle. El calcio está vinculado por la región del bucle. Estos motivos se encuentran en muchas proteínas que son reguladas por el calcio.
Sustancias producidas por al reacción entre ácidos y bases; compuestos que consisten de un metal (positivo) y un radical no metal (negativo).
Péptidos constituídos por entre dos y doce aminoácidos.
Compuestos basados en el 2-amino-4-hidroxipteridina.
Proceso de difusión selectiva a través de una membrana. Habitualmente se emplea para separar solutos de bajo peso molecular, que se difunden a través de la membrana, de los solutos coloidales y de alto peso molecular que no lo hacen .
Familia de bacterias fototróficas púrpuras sulfúricas, que depositan globulos de azúfre elemental dentro de sus células. Se encuentran en diversos medios acuáticos.
Proceso de comunicación pictórica entre los humanos y las computadoras, en que la entrada y la salida de datos de la computadora tienen la forma de gráfico, dibujos u otras representaciones pictóricas adecuadas.
Compuestos cíclicos con un anillo del tamaño aproximado de 1-4 docenas de átomos.
Un aminoácido esencial. A menudo se adiciona a la dieta animal.
Sitio de una enzima que al unirse a un modulador, provoca que la enzima sufra un cambio conformacional que puede alterar sus propiedades catalíticas o de unión.
Sustancias que son capaces de insertarse entre bases sucesivas de ADN, y de este modo lo retuercen, desenrrollan o deforman y, por tanto, impiden que funcione adecuadamente. Se utilizan en el estudio del ADN.
El estudio de los procesos y FENÓMENOS QUÍMICOS subyacentes a los procesos y FENÓMENOS FÍSICOS.
Mutación causada por la sustitución de un nucleótido por otro. Esto causa que una molécula de ADN tenga un cambio en un solo par de bases.
Capas de moléculas de lípidos que son del grosor de dos moléculas. Los sistemas de doble capa se estudian frecuentemente como modelos de membranas biológicas.
Operación controlada de un aparato, proceso, o sistema por dispositivos mecánicos o electrónicos que ocupan el lugar de los órganos humanos de observación, esfuerzo y decisión.