Código Genético
Acepción aplicada a la SECUENCIA DE BASES con respecto a cómo es transformada en SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS. El inicio, parada y orden de los aminoácidos de una proteína se especifica por tripletes consecutivos de nucleótidos denominados codones (CODON).
Codón
Conjunto de tres nucleótidos en una secuencia de codificación de proteínas que especifica los aminoácidos individuales o una señal de terminación (CODÓN DE TERMINACIÓN). La mayoría de los codones son universales, pero algunos organismos no producen los ARN DE TRANSFERENCIA complementarios para todos los codones. Estos codones se conocen como codones no asignados (CODÓN SIN SENTIDO).
Anticodón
Conjunto secuencial de tres nucleótidos en el ARN DE TRANSFERENCIA, que interactúa con su secuencia complementaria en el ARN MENSAJERO, el CODÓN, durante el proceso de traducción en el ribosoma.
Codón de Terminación
Cualquier codón que da la señal de terminación de la TRADUCCIÓN GENÉTICA. Los FACTORES DE TERMINACIÓN DE PÉPTIDOS se unen al codon de terminación y desencadenan la hidrólisis del enlace aminoacilo que conecta el polipéptido terminado al ARNt. El codón de terminación no especifica aminoácidos.
Aminoacilación de ARN de Transferencia
Conversión de TRANSFERENCIA DE ARN sin carga a AMINOACIL ARNt.
Aminoacil-ARNt Sintetasas
Subclase de enzimas que aminoacilan el ARN DE TRANSFERENCIA AMINOÁCIDO-ESPECÍFICO con los correspondientes AMINOÁCIDOS.
ARN de Transferencia
Pequeñas moléculas de ARN, 73-80 nucleótidos de longitud, que funcionan durante la traducción (BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS) para alinear AMINOÁCIDOS en los RIBOSOMAS en una secuencia determinada por el ARNm (ARN MENSAJERO). Hay alrededor de 30 diferentes ARN de transferencia. Cada uno reconoce un específico CODÓN establecido en el ARNm a través de su propia ANTICODÓN y como aminoacil-ARNt ( AMINOACIL ARN DE TRANSFERENCIA), cada uno lleva un aminoácido específico al ribosoma para añadir a la longitud en las cadenas peptídicas.
ARN de Transferencia de Cisteína
ARN de transferencia que es específico para transportar cisteina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Evolución Molecular
El proceso de cambio acumulado en el nivel de ADN, ARN; y PROTEINAS, en generaciones sucesivas.
Aminoacilación
Una reacción que introduce un grupo aminoacilo a una molécula. La AMINOACILACION DE ARN DE TRANSFERENCIA eselprimer paso en TRADUCCIÓN GENETICA.
Aminoácidos
Compuestos orgánicos que generalmente contienen un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH). Veinte aminoácidos alfa son las subunidades que se polimerizan para formar proteínas.
Biosíntesis de Proteínas
Biosíntesis de PÉPTIDOS y PROTEÍNAS en los RIBOSOMAS, dirigida por ARN MENSAJERO, a través del ARN DE TRANSFERENCIA, que se encarga del estándard proteinogénico de los AMINOÁCIDOS.
Tirosina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la tirosina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.1.
Cilióforos
Modelos Genéticos
Secuencia de Bases
Foraminíferos
ARN de Transferencia de Alanina
ARN de transferencia que es específico para transportar alanina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
ARN de Transferencia de Isoleucina
ARN de transferencia que es específico para transportar isoleucina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
ARN de Transferencia Aminoácido-Específico
Grupo de ARNs de transferencia que son específicos para transportar cada uno de los 20 aminoácidos hacia los ribosomas en preparación para la síntesis de proteínas.
Methanococcales
Orden de metágenos anaerobios en el reino EURYARCHAEOTA. Tienen forma de pseudosarcina, cocoide o bastoncillos envueltos en vainas y catabolizan a grupos metilo. Las paredes celulares están compuestas de proteínas. El orden incluye una familia, METHANOCOCCACEAE.
Datos de Secuencia Molecular
Descripciones de secuencias específicas de aminoácidos, carbohidratos o nucleótidos que han aparecido en lpublicaciones y/o están incluidas y actualizadas en bancos de datos como el GENBANK, el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), la Fundación Nacional de Investigación Biomédica (NBRF) u otros archivos de secuencias.
Alanina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la alanina con su ARN de trasferencia específico. EC 6.1.1.7.
Loligo
Conformación de Ácido Nucleico
ARN de Transferencia de Serina
ARN de transferencia que es específico para transportar serina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Aminoacil-ARN de Transferencia
Intermediarios en la biosíntesis de proteínas. Los compuestos se forman a partir de aminoácidos, ATP y ARN de transferencia, una reacción catalizada por la aminoacil ARNt sintetasa. Son compuestos claves en el proceso de translación genética.
Edición de ARN
Proceso que cambia la secuencia de nucleótidos del ARNm a partir de aquella del molde de ADN que lo codifica. Algunas de las clases principales de edición de ARN son las siguientes: 1) conversión de la citosina a uracil en el ARNm, 2) adición de un número variable de guaninas en sitios predeterminados y 3) la adición y deleción de uracilos, modelados por ARNs guías (ARN GUIA).
Leucina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la leucina con su ARN de transferencia específico. EC 6.2.2.4.
Secuencia de Aminoácidos
El orden de los aminoácidos tal y como se presentan en una cadena polipeptídica. Se le conoce como la estructura primaria de las proteínas. Es de fundamental importancia para determinar la CONFORMACION PROTÉICA.
ARN de Transferencia de Tirosina
ARN de transferencia que es específico para transportar tirosina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Selenocisteína
Euplotes
Monoyodotirosina
Producto de la yodación de la tirosina. En la biosíntesis de las hormonas tiroideas (TIROXINA y TRIYODOTIRONINA), la tirosina primero se yoda, dando lugar a la monoyodotirosina.
Escherichia coli
Especie de BACILOS GRAMNEGATIVOS ANEROBIOS FACULTATIVOS que suelen encontrarse en la parte distal del intestino de los animales de sangre caliente. Por lo general no son patógenos, pero algunas cepas producen DIARREA e infecciones piógenas. Las cepas patógenos (viriotipos) se clasifican según sus mecanismos patógenos específicos, como toxinas (ESCHERICHIA COLI ENTEROTOXÍGENA).
Genes Mitocondriales
Genes que están localizados en el ADN MITOCONDRIAL. La herencia mitocondrial a menudo se concibe como una herencia materna, aunque se diferencia de esta en que se transmite cromosómicamente.
Evolución Biológica
Biogénesis
El origen de la vida. Incluye estudios de las bases potenciales de la vida en compuestos orgánicos, pero excluye estudios del desarrollo de formas alteradas de vida a través de mutación y selección natural, que es la EVOLUCION BIOLÓGICA.
Diplomonadida
Grupo de flagelados, en su mayoría EUCARIOTAS simbióticos caracterizados por doble simetría asociada con la presencia de un par de sistemas de organelos cariomastigonte. Los dos núcleos están unidos por fibras a los flagelos y no hay MITOCONDRIA. Los Diplomonadida antes eran miembros de la clase Zoomastigóforos en el viejo paradigma de los cinco reinos.
Códigos de Ética
Isoleucina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la isoleucina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.5.
ARN de Transferencia de Glicerina
ARN de transferencia que es específico para transportar glicina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
ARN de Transferencia de Triptófano
ARN de transferencia que es específico para transportar triptófano hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Serina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la serina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.11.
ARN de Transferencia de Leucina
ARN de transferencia que es específico para transportar leucina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Methanosarcina
Género de METHANOSARCINALES anaerobios, de forma esférica irregular, cuyos organismos son inmóviles. No se forman endosporas. Estos archaea derivan su energía de la formación de metano a partir de acetato, metanol, mono-, di-, y trimetilamina, y posiblemente, monóxido de carbono. Los organismos son aislados a partir de agua dulce y de ambientes marinos.
Factores de Terminación de Péptidos
Proteínas que participan en la reacción de terminación de la cadena peptídica (TERMINACIÓN DE LA CADENA PEPTÍDICA TRADUCCIONAL)de los RIBOSOMAS. Incluyen factores especificos de liberación de codón de clase I, que reconocen las señales de parada (CODÓN TERMINADOR) en el ARN MENSAJERO; y factores no especificos de liberación de codón de clase II.
Triptófano-ARNt Ligasa
Enzima que activa el triptofano con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.2.
Mycoplasma capricolum
ARN
Polinucleótido constituido esencialmente por cadenas, con un esqueleto que se repite, de unidades de fosfato y ribosa al cual se unen bases nitrogenadas. El ARN es único entre las macromoléculas biológicas pues puede codificar información genética, servir como abundante componente estructural de las células, y también posee actividad catalítica.
Evolución Molecular Dirigida
Técnicas empleadas para producir moléculas que presentan propiedades que se corresponden con las demandas del experimentador. Estas técnicas combinan métodos para producir cambios estructurales con métodos de selección. También se utilizan para analizar mecanismos de evolución propuestos, en condiciones de selección in vitro.
Lisina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la lisina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.6.
Modificación Traduccional de las Proteínas
Algunas de las modificaciones catalizadas enzimáticamente de los AMINO ACIDOS de PROTEINAS individuales y clivaje enzimático o entrecruzamiento de cadenas de péptidos que ocurren pre - translacionalmente (sobre el componente amino ácido del ARN DE TRANSFERENCIA DE AMINO ACIL), co-translacionalmente (durante el proceso de TRADUCCION GENETICA) o después de completada la translación ( PROCESAMIENTO PROTEICO POSTRADUCCIONAL).
Emparejamiento Base
Apareamiento de las bases de purinas y pirimidinas por ENLACES DE HIDRÓGENO en la molécula de doble cadena de ADN o ARN.
Treonina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la treonina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.3.
ARN de Transferencia de Asparagina
ARN de transferencia que es específico para transportar asparragina hacia los sitios del ribosoma en preparación para la síntesis de proteínas.
Proteínas
POLIPÉPTIDOS lineales sintetizados en los RIBOSOMAS y que ulteriormente pueden ser modificados, entrecruzados, divididos o unidos en proteinas complejas, con varias subunidades. La secuencia específica de AMINOÁCIDOS determina la forma que tomará el polipéptido durante el PLIEGUE DE PROTEINA.
Archaea
Uno de los tres dominios de la vida (los otros son BACTERIA y Eucarya), conocido anteriormente como Archaebacteria bajo el taxon Bacteria, pero considerado ahora separado y diferente. Se caracterizan por: 1) la presencia de ARN de transferencia y de ARNs ribosómicos característicos; 2) la ausencia de peptidoglicanos en las paredes celulares; 3) la presencia de lípidos vinculados con el éter construidos a partir de subunidades de cadena ramificada; y 4) su aparición en hábitats inusuales. Mientras que la archaea recuerda a las bacterias en su morfología y organización genómica, recuerdan a la eucaria en su método de replicación genómica. El dominio contiene al menos cuatro reinos: CRENARCHAEOTA, EURYARCHAEOTA, NANOARCHAEOTA y KORARCHAEOTA.
Células Eucariotas
Ingeniería de Proteínas
Procedimientos mediante los que se cambia o se crea in vitro la función y estructura de las proteínas, alterando las existentes o sintetizando nuevos genes estructurales que dirigen la síntesis de proteínas con las propiedades deseadas. Esos procedimientos pueden incluir el diseño de MODELOS MOLECULARES de proteínas utilizando GRÁFICOS POR ORDENADOR u otras técnicas de modelado molecular; la MUTAGÉNESIS SITIO DIRIGIDA de genes existentes; y técnicas de EVOLUCIÓN MOLECULAR DIRIGIDA para crear nuevos genes.
ADN Mitocondrial
ADN de doble cadena de la MITOCONDRIA. En los eucariotas, el GENOMA mitocondrial es circular y codifica los ARN ribosómicos, ARN de transferencia y alrededor de 10 proteínas.
Mutación
Células Procariotas
Ribosomas
Estructuras con múltiples componentes que se encuentran en el CITOPPLASMA de todas las células, y en las MITOCONDRIAS y en los PLASTIDIOS. Desempeñan función en la BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS a través de la TRADUCCIÓN GENÉTICA.
Selenoproteínas
Proteínas que incorporan específicamente la SELENOCISTEÍNA en su cadena de aminoácidos. La mayoría de las selenoproteínas son enzimas con los residuos de selenocisteína siendo responsables para sus funciones catalíticas.
Repeticiones de Dinucleótido
Sistemas de Lectura Abierta
Secuencia de tripletes de nucleótidos sucesivos que son leidos como un CODÓN especificador de AMINOÁCIDOS y que comienza con un CODÓN INICIADOR y termina con un codón de parada (CODÓN TERMINADOR).
Fenilalanina-ARNt Ligasa
Enzima que activa la fenilalanina con su ARN de transferencia específico. EC 6.1.1.20.
Sustitución de Aminoácidos
El reemplazo que occurre natural o inducido experimentalmente de uno o más AMINOÁCIDOS en una proteína con otra. Si un amino ácido equivalente funcional se sustituye, la proteína puede mantener el acitividad tipo salvaje. La sustitución también puede disminuir, aumentar, o eliminar la función de la proteína. La sustitución inducida experimentalmente se utiliza con frecuencia para estudiar las actividades y enlaces de las enzimas.
Alineación de Secuencia
Combinación de dos o más aminoácidos o secuencias de bases de un organismo u organismos de manera que quedan alineadas las áreas de las secuencias que comparten propiedades comunes. El grado de correlación u homología entre las secuencias se pronostica por medios computarizados o basados estadísticamente en los pesos asignados a los elementos alineados entre las secuencias. Ésto a su vez puede servir como un indicador potencial de la correlación genética entre organismos.