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Structural genome variation, haplotype diversity and the barley pan-genome - Exploring structural genome diversity for barley ... i) establishing de novo whole genome shotgun sequencing assemblies of two haplotypes, genetically highly distant from the ... iii) performing deep transcript sequencing (RNA-seq, HiSeq2500) and de novo assembly of 200 highly diverse haplotypes. ... ii) Mapping long distance SV in the same 50 haplotypes by tethered 3D-conformation capture sequencing; ...
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