Holoenzyme
Holoenzyme sind Enzyme, die aus einer apoenzymatischen (proteinhaltigen) und koenzymatischen (nichtproteinhaltigen) Komponente bestehen, die zusammenarbeiten, um eine katalytische Funktion auszuüben. Der Zusammenbau von Apoenzym und Koenzym ermöglicht die volle katalytische Aktivität des Enzyms, das an biochemischen Reaktionen im menschlichen Körper beteiligt ist.
DNA-Polymerase III
DNA-Polymerase III ist ein Schlüsselenzym des replikativen Apparats von Bakterien, das für die Synthese und Replikation von DNA während der Zellteilung verantwortlich ist, indem es Nukleotide an die wachsende DNA-Kette anhängt und somit eine kontinuierliche Kettenverlängerung ermöglicht.
Apoenzyme
Escherichia coli
DNA-gesteuerte RNA-Polymerasen
DNA-gesteuerte RNA-Polymerasen sind Enzyme, die die Synthese von RNA durch Transkription katalysieren, indem sie komplementäre Ribonukleotide an eine herunterregulierte DNA-Matrize anlagern, wodurch ein Einzelstrang-RNA-Molekül erzeugt wird. Diese Enzyme spielen daher eine entscheidende Rolle bei der Genexpression und Proteinsynthese in Zellen.
Sigma-Faktor
In Molekularbiologie, ist ein Sigma-Faktor ein Proteinfaktor beteiligt an die Initiation der Transkription in Prokaryoten, erkennt und bindet spezifisch an Promotorregionen der DNA, um die RNA-Polymerase zum Start der Transkription zu positionieren.
Makromolekulare Substanzen
DNA-gesteuerte DNA-Polymerase
Eine DNA-polymerase ist ein Enzym, das die Synthese neuer DNA-Stränge durch Hinzufügen von Nukleotiden an ein vorhandenes Primer-Molekül katalysiert, wobei die Sequenz der neu synthetisierten DNA-Stränge durch komplementäre Basenpaarung mit einem vorliegenden DNA-Matrizenstrang bestimmt wird. Diese Art der DNA-Polymerase wird als "DNA-gesteuert" bezeichnet, da sie die DNA-Sequenz des Matrizenstrangs repliziert und so für die exakte Vermehrung von Genen in lebenden Organismen unerlässlich ist.
Molekülsequenzdaten
Coenzyme
Mediator Complex
A Mediator Complex is a multi-protein complex that functions as a bridge to connect transcription factors with the basal transcription machinery, thereby playing a crucial role in regulating gene expression in eukaryotic cells.
Kinetics
Protein Phosphatase 2
RNA-Polymerase Sigma 54
RNA-Polymerase Sigma 54 ist ein transkriptionelles Faktorprotein, das bei Bakterien beteiligt ist, die Genexpression durch Initiierung der Transkription von bestimmten Gruppen spezifischer Gene zu regulieren, indem es eine holoenzymatische Form der RNA-Polymerase an bestimmte Promotorregionen im Genom bindet.
Protein Binding
Proteinuntereinheiten
Proteinuntereinheiten sind die einzelnen, diskreten Untereinheiten oder Substrukturen, aus denen komplexe Proteine durch Faltung und Assemblierung von Aminosäureketten gebildet werden, die durch Disulfidbrücken, Ionenbindungen, Wasserstoffbrücken oder andere nichtkovalente Wechselwirkungen zusammengehalten werden.
Amino Acid Sequence
Eine Aminosäuresequenz ist die genau festgelegte Reihenfolge der verschiedenen Aminosäuren, die durch Peptidbindungen miteinander verbunden sind und so die Primärstruktur eines Proteins bilden. Diese Sequenz bestimmt maßgeblich die Funktion und Eigenschaften des Proteins. Die Information über die Aminosäuresequenz wird durch das Genom codiert und bei der Translation in ein Protein übersetzt.
Templates, Genetic
Genetic templates refer to the instructions contained within our DNA that dictate the structure and function of proteins and other cellular components, essentially serving as the blueprint for the development and maintenance of all living organisms.
DNA Replication
Base Sequence
Ribonuclease P
Ribonuclease P ist ein ribonukleoproteinisches Enzym, das die Maturation der 5'-Enden tRNAs durch die Spaltung präkurser tRNAs katalysiert, wodurch die 5'-Leadersequenz entfernt wird. Diese Definition betont die Funktion des Enzyms bei der Verarbeitung von RNA-Molekülen und hebt hervor, dass es sich aus einem RNA- und Proteinteil zusammensetzt.
Binding Sites
In der Medizin und Biochemie bezieht sich der Begriff 'Binding Sites' auf spezifische, konformationsabhängige Bereiche auf Proteinen, DNA oder RNA-Molekülen, die die Bindung und Interaktion mit bestimmten Liganden wie beispielsweise Drogen, Hormonen, Enzymen oder anderen Biomolekülen ermöglichen.
RNA-Polymerase II
RNA-Polymerase II ist ein Enzymkomplex, der die Transkription von DNA in mRNA während der Genexpression in Eukaryoten katalysiert und insbesondere für die Synthese von mRNA und snRNA verantwortlich ist.
Catalytic Domain
A 'Catalytic Domain' in a medical or biochemical context refers to a specific region within an enzyme that contains the active site, where catalysis (the increase in the rate of a chemical reaction) occurs, enabling the enzyme to perform its function efficiently and selectively.
Transcription, Genetic
Bakterielle Proteine
Cyclic AMP-Dependent Protein Kinase RIIalpha Subunit
Die Cyclic AMP-abhängige Proteinkinase RIIα-Untereinheit ist ein regulatorisches Protein, das als Teil der holoenzymatischen Heterodimerstruktur mit der katalytischen Untereinheit CARK (Cyclic AMP-dependent Kinase) eine wichtige Rolle in der Signaltransduktion durch Phosphorylierung und Regulierung von Zielproteinen spielt, insbesondere bei der Adaptation auf zellulärer Ebene im Rahmen des cAMP-Signalwegs.
Casein-Kinase II
Bakteriophage phi X 174
Bakteriophage phi X 174 ist ein einzelsträngiges DNA-Virus, das Escherichia coli Bakterien infiziert und als Prototyp für die Klasse der kleinen, einzelsträngigen DNA-Bakteriophagen dient. Es war der erste DNA-infizierende Organismus, dessen Genom vollständig sequenziert wurde.
Promoter Regions, Genetic
Protein Conformation
Models, Molecular
Molekulare Modelle sind grafische oder physikalische Darstellungen von Molekülen und ihren räumlichen Strukturen sowie der Wechselwirkungen zwischen Atomen und Molekülen auf molekularer Ebene, die in der biochemischen und pharmakologischen Forschung zur Visualisierung und Verständnis von biologischen Prozessen eingesetzt werden.
Bakteriophage T4
Bakteriophage T4 ist ein spezifisches Virus, das sich an Bakterien der Art Escherichia coli (E. coli) bindet und infiziert, indem es deren DNA-Synthese übernimmt und neue Phagen-Partikel produziert, die schließlich die Wirtsbakterien zerstören.
Cyclic AMP-Dependent Protein Kinase RIalpha Subunit
Aspartat-Carbamoyltransferase
Die Aspartat-Carbamoyltransferase ist ein enzymatischer Katalysator, der die Übertragung einer Carbamoylgruppe von Carbamoylphosphat auf L-Aspartat während der Synthese von N-Carbamoylaspartat in der Harnstoffzyklusreaktion katalysiert.
Cyclin-Dependent Kinase 8
Cyclin-Dependent Kinase 8 (CDK8) is a serine/threonine protein kinase that regulates transcription by forming a complex with cyclin C, and plays roles in various cellular processes such as differentiation, proliferation, and apoptosis. It is also involved in the regulation of signaling pathways like Wnt, Notch, and hormone receptor signaling.
Mutation
In der Genetik, ist eine Mutation eine dauerhafte und bedeutsame Veränderung im Erbgut eines Organismus, die als Folge einer Veränderung in der DNA-Sequenz auftritt und von Generation zu Generation weitergegeben wird.
Phosphoprotein-Phosphatase
Eine Phosphoprotein-Phosphatase ist ein Enzym, das die Entfernung einer Phosphatgruppe von phosphorylierten Proteinen katalysiert, was einen regulierenden Effekt auf zelluläre Signalwege hat.
Cyclo-IMP
Catalysis
In der Biochemie und Pharmakologie verweist 'Catalysis' auf die Erhöhung der Reaktionsgeschwindigkeit eines chemischen Prozesses durch die Anwesenheit einer Katalysatorsubstanz, die selbst nicht in die endgültige Produktbildung einfließt und am Ende des Prozesses regeneriert wird. Dies ist ein wichtiger Aspekt vieler Stoffwechselvorgänge im menschlichen Körper sowie bei der Entwicklung von Arzneimitteln, um deren Wirksamkeit zu optimieren oder Nebenwirkungen zu minimieren.
Tetrahymena thermophilia
Tetrahymena thermophila ist ein freilebendes, einzelliges, vielkerniges Protozoon, das häufig in Süßwasserökosystemen vorkommt und als Modellorganismus in der biologischen und medizinischen Forschung zur Untersuchung von Zellprozessen wie Genexpression, Proteinsynthese, DNA-Replikation und -Reparatur sowie für die Erforschung von Wirt-Parasit-Interaktionen genutzt wird.
Adenosintriphosphat
Cyclic AMP-Dependent Protein Kinase RIIbeta Subunit
Die Cyclic AMP-abhängige Proteinkinase RIIβ-Subunit ist ein regulatorischer Untereinheitentyp der Proteinkinase A, der durch Bindung von cAMP aktiviert wird und eine zentrale Rolle in der Signaltransduktion durch cAMP spielt, indem sie die Phosphorylierung und Regulation spezifischer Zielproteine katalysiert.
Escherichia-coli-Proteine
Escherichia-coli-Proteine sind Proteine, die in der Bakterienart Escherichia coli (E. coli) gefunden werden und für verschiedene zelluläre Funktionen wie Stoffwechsel, Replikation, Transkription und Reparatur verantwortlich sind.
Substrate Specificity
Rekombinante Proteine
Elektrophorese, Polyacrylamidgel-
Pyridoxalphosphat
Bakterien-DNA
Bakterielle DNA bezieht sich auf die Desoxyribonukleinsäure (DNA), die das genetische Material der Bakterienzellen darstellt und die Informationen enthält, die für ihre Wachstums-, Entwicklungs- und reproduktiven Funktionen erforderlich sind. Diese DNA ist in einem einzelnen chromosomalen Strang vorhanden, der zusammen mit der kleineren Plasmid-DNA (ebenfalls aus DNA bestehend) im Bakterienzellkern gefunden wird.
DNA-bindende Proteine
DNA-bindende Proteine sind Proteine, die spezifisch und affin an bestimmte Sequenzen oder Strukturen der DNA binden, um verschiedene zelluläre Prozesse wie Transkription, Reparatur, Replikation und Chromatin-Organisation zu regulieren.
Chromatographie, Gel-
Protein Structure, Tertiary
DNA-Polymerase Il
DNA-Polymerase I ist ein Enzym, das während der DNA-Replikation und -Reparatur bei Prokaryoten eine wichtige Rolle spielt, da es sowohl die Funktion hat, neu synthetisierte DNA-Stränge zu verlängern als auch RNA-Primer durch DNA-Einzelstränge zu ersetzen. Es ist auch in der Lage, einfache DNA-Schäden direkt zu reparieren und dient somit einem doppelten Zweck im Zellstoffwechsel von Bakterien.
Saccharomyces-cerevisiae-Proteine
Saccharomyces cerevisiae-Proteine sind Proteine, die aus der Modellorganismuse Hefe (Saccharomyces cerevisiae) isoliert und in der biomedizinischen Forschung zur Untersuchung von Zellprozessen wie Genexpression, Replikation, Transkription und Signaltransduktion eingesetzt werden.
Flavin-Adenin-Dinucleotid
Protein-Kinasen
Cyclo-AMP-abhängige Proteinkinasen
Cyclo-AMP-abhängige Proteinkinasen sind Enzyme, die durch Bindung des second messengers Cyclo-AMP aktiviert werden und eine zentrale Rolle in intrazellulären Signaltransduktionswegen spielen, indem sie die Phosphorylierung und Aktivierung von spezifischen Protein-Substraten katalysieren.
Transkriptionsfaktoren
Transkriptionsfaktoren sind Proteine, die die Genexpression regulieren, indem sie die Aktivität von Genen durch Bindung an bestimmte DNA-Sequenzen steuern und so die Transkription von DNA in mRNA beeinflussen.
Molecular Weight
In der Medizin und Biowissenschaften bezeichnet die molekulare Masse das Summengewicht aller Atome in einem Molekül, ausgedrückt in Dalton (Da) oder SI-Einheiten von kg/mol, oft verwendet zur Charakterisierung von Biomolekülen wie Proteinen und DNA.
Enzyme Activation
Enzyme Activation bezeichnet den Prozess der Umwandlung einer Inaktiven Enzympräkursor-Form (Zymogen oder Proenzym) in ihre aktive, funktionsfähige Konformation durch Proteolyse oder Konformationsänderungen, wodurch die katalytische Aktivität zur Beschleunigung biochemischer Reaktionen ermöglicht wird.
Cyclic AMP-Dependent Protein Kinase Type II
Cyclic AMP-dependent Protein Kinase Type II (PKA II) refers to a subtype of the protein kinase A enzyme, which is a key regulator of various cellular processes and is activated by the intracellular second messenger cyclic AMP (cAMP), leading to the phosphorylation and regulation of specific downstream target proteins.
Saccharomyces cerevisiae
'Saccharomyces cerevisiae' ist eine spezifische Art von Hefe, die häufig in der Lebensmittelindustrie verwendet wird, wie zum Beispiel bei der Herstellung von Brot und Bier, und die aufgrund ihrer genetischen Zugänglichkeit und ihres einfachen Anbaus auch als Modellorganismus in biologischen und medizinischen Forschungen dient.
DNA, Einzelstrang-
Apoproteine
Klonierung, molekulare
Telomerase
Telomerase ist ein spezifisches Enzym, das die Verlängerung der Telomere, also der Endkappen der Chromosomen, katalysiert und so die Zellteilungsfähigkeit und Lebensdauer von Zellen beeinflusst. Diese Aktivität kann bei Krebszellen erhöht sein, während sie in normalen, differenzierten Zellen niedriger ist oder sogar fehlt.
Isoenzyme
Phosphorylase-Kinase
Plasmids
Plasmide sind kleine, extrachromosomale DNA-Moleküle, die in Bakterien und anderen Mikroorganismen vorkommen und die Fähigkeit besitzen, sich replizativ zu vermehren, wobei sie genetische Informationen tragen können, die der Wirtsevolution dienen oder nützlich für biotechnologische Anwendungen sein können.
Enzymstabilität
Biotin
Biotin, auch als Vitamin B7 bekannt, ist ein wasserlösliches Vitamin, das für den menschlichen Körper essentiell ist und bei verschiedenen Stoffwechselprozessen eine Rolle spielt, insbesondere bei der Regulation des Fett-, Kohlenhydrat- und Eiweißstoffwechsels sowie bei der Synthese von Biomolekülen wie DNA und Keratin.
Cyclo-AMP
Replikationsfaktor C
Der Replikationsfaktor C, oft als CDC bezeichnet, ist ein Protein, das bei Eukaryoten während des Zellzyklus an der Replikation des DNA-Strangs beteiligt ist und die Initiation der DNA-Replikation steuert, indem es die Bindung von weiteren Replikationsproteinen an den Ursprungsregionen (ORCs) fördert.
Genes, Bacterial
'Bacterial Genes' refer to the hereditary units present in bacteria that are passed down from one generation to the next and contain the information necessary for the growth, development, and reproduction of the organism. These genes are encoded in the bacterial chromosome or in plasmids, which are small circular DNA molecules that can be transferred between bacteria. Bacterial genes play a crucial role in the expression of various traits, including antibiotic resistance, metabolic processes, and pathogenicity.
Kaliumpermanganat
Ribulose-Biphosphat-Carboxylase
Potassium Acetate
Potassium Acetate is a medication and dietary supplement used to restore potassium levels in the body, often prescribed to treat or prevent low potassium blood levels (hypokalemia) caused by certain medical conditions, medications, or chronic kidney disease, and it is a white salt formulated as a compound of potassium ions (K+) and acetate ions (CH3COO-).
Endoribonucleasen
Endoribonukleasen sind Enzyme, die die RNA-Moleküle spezifisch an inneren Stellen schneiden und so in kleinere Segmente oder Einzelnukleotide spalten können. Diese Aktivität ist wichtig für verschiedene zelluläre Prozesse wie die Reifung von tRNA, die Degradation von mRNA und die Abwehr gegen RNA-Viren. Es gibt mehrere Klassen von Endoribonukleasen mit unterschiedlichen Spezifitäten und Funktionen im Zellstoffwechsel.
Mutagenese, lokalspezifische
'Lokalspezifische Mutagenese' bezieht sich auf die Entstehung spezifischer Genmutationen in bestimmten Zellen oder Geweben eines Organismus, hervorgerufen durch die Exposition gegenüber mutagenen Agentien, wie chemischen Substanzen oder ionisierender Strahlung, ohne dabei die Integrität des Gesamterbguts zu beeinträchtigen.
Nucleic Acid Conformation
Protein Structure, Quaternary
DNA
Kristallographie, Röntgenstrahl-
Phosphonoessigsäure
RNA
Phosphorylation
Phosphorylierung ist ein biochemischer Prozess, bei dem eine Phosphatgruppe durch die Katalyse einer Kinase-Enzym auf eine Protein- oder Lipidmoleküle übertragen wird, was oft eine Aktivierung oder Deaktivierung von Enzymfunktionen, Signaltransduktionsprozessen oder zellulären Regulationsmechanismen zur Folge hat.
Cobamide
Gene Expression Regulation, Bacterial
Methylmalonyl-CoA-Decarboxylase
Transkriptionsfaktoren, TFII-
TFII (Transcription Factor II) sind Proteinkomplexe, die während der Initiation der Transkription an der DNA binden und die RNA-Polymerase II zur startpunktgenauen Transkription von Proteincodierenden Genen aktivieren.
Pilzproteine
Pilzproteine sind strukturelle oder funktionelle Proteine, die in Pilzen vorkommen und an zellulären Prozessen wie Wachstum, Stoffwechsel, Signaltransduktion und Pathogenität beteiligt sind, wobei einige von ihnen aufgrund ihrer einzigartigen Eigenschaften und Strukturen als Zielmoleküle in der medizinischen Forschung dienen.
D-Aminosäure-Oxidase
Pyridoxal
Protein Phosphatase 1
RNA, katalytische
Katalytische RNA, auch bekannt als ribozym, ist ein spezifisches RNA-Molekül, das die Fähigkeit besitzt, chemische Reaktionen zu katalysieren, wie beispielsweise die Proteinbiosynthese durch Aktivierung und Bindung von Aminosäuren während der Translation.
Propionic Acidemia
Flavin-Mononucleotid
Structure-Activity Relationship
DNA-Helikasen
DNA-Helikasen sind Enzyme, die die Doppelstränge der DNA entwirren und damit die Voraussetzung für den Zugang der Replikations- oder Reparaturmaschinerie zu den Nukleotidsequenzen schaffen.
Bacillus subtilis
Chromatographie, Affinitäts-
Affinitätschromatographie ist ein Verfahren der Chromatographie, bei dem die Trennung und Isolierung von bestimmten Biomolekülen (z.B. Proteinen, DNA, Peptiden) auf Grundlage ihrer affinen Bindung an eine spezifische biologisch aktive Substanz (Ligand) erfolgt, die an ein Trägermaterial (z.B. Matrix, Gel) immobilisiert wurde.
Trans-Activators
Adenosintriphosphatasen
Adenosintriphosphatasen sind Enzyme, die die Hydrolyse von Adenosintriphosphat (ATP) in Adenosindiphosphat (ADP) und anorganisches Phosphat katalysieren, wodurch Energie für zelluläre Prozesse freigesetzt wird.
Cyclic AMP-Dependent Protein Kinase RIbeta Subunit
Exodesoxyribonuclease V
Exodesoxyribonuclease V ist ein Enzym, das während des DNA-Reparaturprozesses durch Spaltung und Entfernen von 3'-Mononukleotiden aus einer Doppelstrangbruchstelle an der 5'-Phosphatgruppe beteiligt ist. Diese Aktivität trägt zur Wiederherstellung der Integrität der DNA bei, indem es die korrekte Basenpaarung wiederherstellt und das intakte Molekül für weitere Zellfunktionen bereitstellt. Das Enzym spielt eine wichtige Rolle in der Beseitigung von DNA-Schäden, einschließlich solcher, die durch ionisierende Strahlung oder chemische Mutagene verursacht werden.
DNA-Primase
Eine DNA-Primase ist ein Enzym, das kurze RNA- oder DNA-Primer synthetisiert, um die Initiation der DNA-Replikation zu starten, indem es an den 5'-Ende des lagging strand (nachfolgenden Strang) bindet und die Synthese des Okazaki-Fragments einleitet. Diese Primer werden dann durch das Enzym DNA-Polymerase I entfernt und durch DNA ersetzt, um eine kontinuierliche DNA-Kette zu bilden.
Dimerization
Desoxyadenin-Nucleotide
Mutagenesis
'Mutagenesis' refers to the process of causing permanent changes or mutations in the DNA sequence of an organism, which can potentially lead to various health consequences including cancer and hereditary disorders.
RNA, bakterielle
Bakterielle RNA bezieht sich auf die im Bakterienzellplasma vorhandenen Ribonukleinsäuren, die als genetisches Material für die Proteinsynthese und Regulation von Genexpression dienen, einschließlich mRNA (Messenger-RNA), rRNA (Ribosomal-RNA) und tRNA (Transfer-RNA).
Spektrophotometrie
Kohlenstoff-Stickstoff-Ligasen
DNA-Primer
In Molekularbiologie, ist ein DNA-Primer ein kurzes, einzelsträngiges Stück DNA oder RNA, das die Synthese eines neuen DNA-Strangs durch Polymerase-Kettenreaktion (PCR) oder DNA-Sequenzierung initiiert, indem es einen komplementären Teil des zu kopierenden DNA-Abschnitts bereitstellt.
Virusproteine
DNA, Virus-
Biocatalysis
Biocatalysis ist ein Prozess, bei dem Enzyme oder andere Biomoleküle als Katalysatoren eingesetzt werden, um chemische Reaktionen in lebenden Organismen zu beschleunigen und zu steuern, sowie in der biotechnologischen Anwendung zur Herstellung von Feinchemikalien, Pharmazeutika und für Diagnostikzwecke.
Exodesoxyribonucleasen
T-Phagen
T-Phagen sind Bakteriophagen, die sich spezifisch an Bakterien der Gattung Escherichia coli (E. coli) mit bestimmten Serotypen des bakteriellen Oberflächenproteins O157:H7 binden und infizieren können, wodurch sie ein potentielles Therapeutikum zur Behandlung von entsprechenden bakteriellen Infektionen darstellen.